| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2495448 | 179 (1.390) | 4 (0.030) | 4/422 | NT | 2.2% | intergenic (‑156/‑197) | yfdY/lpxP | DUF2545 family putative inner membrane protein/palmitoleoyl‑acyl carrier protein (ACP)‑dependent acyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 2495449 | 178 (1.420) | intergenic (‑157/‑196) | yfdY/lpxP | DUF2545 family putative inner membrane protein/palmitoleoyl‑acyl carrier protein (ACP)‑dependent acyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CACGTTCAGTACCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCGTGGTTATGTCCTGACTAGTCTTTACACTCTTTACAGGAACCATTGTCGTACATGATGGCCCAACCAATTGAGTGTACCGCTGTCGACATGGAATCTTCTGCGATACAACAATTCGTATCTACAGAAGGTAACTATGTTTCCACAATGCAAATTTTCCCGCGAGTTTCTACATCCT > NC_000913/2495218‑2495686 | cccGTTCAGTACCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAg < 1:478171/237‑1 (MQ=255) aGTACCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGa > 1:982092/1‑239 (MQ=255) tACCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGaaa > 2:677271/1‑239 (MQ=255) aCCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAg < 1:151253/239‑1 (MQ=255) gACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAg > 1:1329305/1‑235 (MQ=255) gACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAg > 1:1049366/1‑238 (MQ=255) aTGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCg > 1:1068834/1‑239 (MQ=255) gTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGATAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAg < 1:68078/239‑1 (MQ=255) aGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTg < 2:9231/239‑1 (MQ=255) cGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGAt < 2:1049366/238‑1 (MQ=255) gCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCACCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATaa < 1:274710/239‑1 (MQ=255) gCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTGCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATaa < 2:627568/239‑1 (MQ=255) tACGCAGACAATACACAGGGCCAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTCACCATCACTGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTCCTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAga > 2:342080/1‑238 (MQ=255) aGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAg < 1:464577/238‑1 (MQ=255) aCAAGACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCACAACCTCCTGACGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGc < 2:160581/220‑1 (MQ=255) tACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGc > 2:1184348/1‑239 (MQ=255) gggCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAAta < 2:302974‑M2/187‑3 (MQ=255) gggCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCAt > 1:1176547/1‑239 (MQ=255) gggCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCAt > 1:561388/1‑239 (MQ=255) gggCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGCGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCa > 1:1395825/1‑238 (MQ=255) ggCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCAt > 2:1355671/1‑238 (MQ=255) gCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTa > 1:1036028/1‑221 (MQ=255) gCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAAACAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATg < 1:1351506/238‑1 (MQ=255) aaCATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCg < 1:395991/239‑1 (MQ=255) ccATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCGTGGtt < 1:1136791/239‑1 (MQ=255) ccATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCGTGGtt < 2:1349846/239‑1 (MQ=255) aaTTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCGTGGTTATGTc < 1:1355671/239‑1 (MQ=255) ttAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCGTGGTTATGt > 2:447374/1‑236 (MQ=255) aTCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCGTGGTTATGTCCTg > 2:954616/1‑237 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |