Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,491 | C→A | 15.4% | A10E (GCA→GAA) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,491 | 0 | C | A | 15.4% | 258.2 / 11.9 | 126 | A10E (GCA→GAA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/65); new base A (9/11); total (49/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206255‑3206725 | ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCAGACAAAAACAAAAACT‑AGAGTTGTCCTGATGAGCGTGAGGAATAAAC‑AACA‑AGCCGG‑G‑aa > 1:261785/1‑239 (MQ=255) ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATAAAAAAACT‑GTAGATTGCATGGTGGGAGAGAGGTAAAAAC‑AACA‑GGCAAT‑G‑ag > 2:148146/1‑238 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑aa < 2:538390/238‑1 (MQ=255) tCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTg < 2:356486/239‑1 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCACACAAAAAAAAAAAAT‑GGAGTTGTCATGATGTGGGAAAGTAAAAAAC‑AACA‑GGAAGT‑G‑AATAAGTTGACa > 2:1314934/1‑239 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACa < 1:230324/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAga‑ga < 1:319244/238‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGGTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GAt < 1:554090/239‑1 (MQ=255) gATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTg < 2:868002/238‑1 (MQ=255) tAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCg < 2:443225/239‑1 (MQ=255) tAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATGCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTc < 1:717129/238‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTAGACAAATACAAAAAAT‑GGAGTTGTCCTTGTGAGCGGAAGTAAAAAAA‑AAAA‑AGCAAC‑G‑AAAAAGATTAAAGA‑GATTGTGGcgca > 2:76146/1‑236 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAACT‑GGAGTTGTCAAGGAGAGGGGAAGTAATAAAC‑AAAA‑AGCAAG‑G‑AATAAATTTGCAGA‑GAATGtgtctca > 1:764714/1‑233 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAAACAAATACAAAAAAC‑GTGGGTGTCCTGGTGAGCGAAAGAAAAAAAA‑AACA‑CACAGA‑G‑AAAAAAATGACAGA‑GATTGTGTC‑Taa > 2:41850/1‑239 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAAACAAAAAAAAAAAAT‑TGAGTTTTCCTGGTGTGTGGAAGTAAAAAAC‑AACACGGCA‑T‑G‑GATAAAGTGACAGA‑GAATGTCGC‑Taa > 1:716197/1‑239 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTAAACAAAAAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAAA‑AAAA‑GGCAGA‑G‑AATAAAATGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACttt > 2:977525/1‑238 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCa < 1:381189/203‑1 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑CATTTTTTCCTAAACAACAAAAAAAA‑GGGGGTGTCACAATGAGGGCAAGTAATAAAC‑CACA‑AGCAAC‑G‑GAAAACTTGTCAGC‑GATTGTCGG‑CCACTTTAcccc > 2:297075/1‑236 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCAATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCCGGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAACCG‑GGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAGC‑AACG‑GGAAGT‑G‑AATAAGTGGACAGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGcc < 1:1034508/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAAT‑GGAGTTGCCATGATTAGCGGAAGTAAAAAAA‑AACA‑AGAAGA‑G‑AATAATCTGACAGA‑GGATGTCGC‑GACAATTACCGCCATTAt > 1:673571/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTACACAAATAAAAAAAAT‑GGGGATTTCCTGATGAGAGAAAGTAATAAAC‑AAAA‑AGCAAG‑G‑AAAAAATTGACAGA‑GAGTTTTCC‑TAACTTTTCCGCACTGAttt > 1:1369101/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGGAAAATATAAAAAAA‑GGAGGTGCCCTGTTGTGGGGAAGGAATAAAC‑AAAA‑GGAAAA‑G‑GAAAAAGTGACAGG‑GATTGTCGC‑TAAATTTACCCCCCTAAttt > 1:113305/1‑239 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGa < 1:817567/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCTGACACAAACAAAAAAA‑TGAGGTGGCATGATGAGGGGAAGAAAAAAAC‑AAAA‑AGCAGT‑G‑GAAAAGTTGAACAA‑GGATGTTGG‑CAACTTTACCGCCCCGATTTCT‑TCCCCaaaa > 2:1211880/1‑236 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAACAAAAACA‑GGAGTTGTCACGGTGGGCGAAAGTAAAAAGC‑AACA‑CGCAGG‑G‑AAAAAATTGTCAGA‑AAATGTCGC‑TAACTTTACCACCCCGATTTCT‑ACCCGACA‑GCCtgat > 2:487715/1‑239 (MQ=255) cgaaaTATTAATTTTTATTTTCGGGTTAATTAAGAAACTTTTAATTACATTTTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAAAAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGA‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACgt < 2:1369101/235‑1 (MQ=255) gaaaTATTATTTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACgtg < 2:261785/236‑1 (MQ=255) atatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGG‑AATTTTTTTCAACAAAAAAAAAAAAT‑TGAGTTGTCATTATTAGCGGAAGTAATAAACAAACA‑GAAAGT‑G‑AAAAATTAGAAAGA‑‑AGTGTCGG‑CAAATTTACCCGCCTGATTTAT‑AACCGGAA‑GCCCGGTGAccttgttg > 2:782590/1‑232 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAAT‑GGAGTTGTCATGATGAGGGGAAATAAAAAAC‑AAAA‑AGGAGG‑G‑AAAAAGATGACCGA‑GAATGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGAATTTT‑ACCCCTAT‑GCCTGAGGACGGGGTGGa > 2:372883/1‑239 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACgtg < 1:1346673/234‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGAG‑AAATTTTTCACAAAAATAAAAAAAAT‑GGGGTTGTCATAGTGGGCGTGAGTAAAAAGA‑AAAA‑AGAAAA‑G‑AATAAAATTTCAGA‑GATATTTGC‑TAAAATTATCCCCCTGCATTTT‑ACCCCAAT‑GTCtgatgagaggtggga > 1:739830/1‑230 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGTAAAAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGa < 1:977525/239‑1 (MQ=255) ttcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTCGACAAAAACAAAAACA‑AGAGTTGCCATGATGAGGGGAAGAAAAAAAC‑AAAA‑GGAAGA‑G‑AAAAAGATGAAAGA‑GAATGTCGC‑TAACATTTCCGCCATAATTTTT‑ACACGCAT‑GTCGCATGAGGTGGTGGGTa > 2:28355/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:1211880/239‑1 (MQ=255) tATTTGCGGGTTAATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTGGTGGGGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACG‑GGATTTGCCATGAGGAGCGAAAGTAATAAGA‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:782590/239‑1 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAAT‑GGAGGTGTCATGATGAGCGGAAGAAATAAAC‑AACA‑AACAGA‑G‑AATAAATTGACAGA‑GATTGTCGCGTAAATTT‑CCCCCCTGATTTTT‑ACCCCAAA‑AGCTGATGACGTTGTGGGGAAAATAAAACa > 2:731558/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAT‑AGAGTTTGCATTATGAGGGAAAGGAAAAAAA‑AAAA‑GGGAGA‑G‑GAAAAATTGAAAAA‑AAGTGTTAG‑TAACATTACCGCCCATATTTTT‑ACCCGGAA‑GGCTGATGTGGGGGGGGGTGAAATAAAACa > 2:975011/1‑239 (MQ=255) tttCGCATGAATTAACGAATTTTAAATTAATTATAAAAGTTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTTAGTGGTATTTTGTGGAGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTCGCAATGATGAGTGAATGTAATAAGC‑ACCG‑GGAAGT‑G‑ATTAATTTGACAGA‑GTTTGGCCT‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAg < 1:551818/239‑1 (MQ=255) ctgtttGATTCACGAACGTTTAATTACATATTCGCGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTA‑AATTTTCCCAGAAAAACACAAAAACT‑GGATTGGCCATAATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAGGTGGACGGA‑GATTGCCGC‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTa < 1:1129549/235‑1 (MQ=255) cgcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTa < 1:362532/239‑1 (MQ=255) gaatccgcGAATTTTTAATTAGATAGTGCCGGTGAAAAAAAATAAAAAACCACTGTTGTAGTGGTGGTTTGGGGCGGGG‑AATTTTGCCAAACAAATAAAAAAACG‑GGTGTTGCTATGACGAGCAAAATTAAAAAAA‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTAGACAAA‑GATTGTCGT‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTAGATAAACTAAAACAGCTAAAgg < 2:1112907/231‑1 (MQ=255) tGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGG‑AAATTTTTCAGACAAATAAAAAAAAT‑GGAGTTGGCATGATGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACA‑AGCAGG‑G‑AATAAATTGACAGA‑AATTTTCGC‑TAACTTTAACGCCCTGATTTCT‑ACCCCAAT‑GCCTGGTGACGTGGGGGGTAAACTAAAACAACTAAAGGGTG‑C‑CGAAAcgtc > 1:812328/1‑239 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAAAT‑GGAGTTTTCATGATGAGCGAAAGAAATAAGC‑AACA‑CGCAGG‑G‑AATAAATTGACACA‑GATTGTCGC‑CAACTTTACCGCCCTGATTTCT‑ACCCCCAT‑GCCCGATGACGTGGTGGGGAAAACACAAAAGCTAAAGGGTA‑C‑CGgaaagcgg > 2:599508/1‑233 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGCC‑AATTTTTTTAGAAAAAAGCAAAAAATCTGGTTTGGCAAG‑TGGATGTAAGGGAAAAAC‑AAGA‑GGCCGT‑G‑TATAAGTTATAAGT‑AATTGTCGG‑AAAGTTTTACACCATGATTTCT‑CCGCCCAA‑GCCTCATGACGTGGTGGTTAAACTAAAAAAACCAAACGATgggcaaacgccg > 2:1244826/1‑227 (MQ=255) aaTTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCTAACAAATACAAAAAAT‑TGAGTTGCCATGATGAGGGAAAGAAATAAGA‑AAAA‑AGGAAT‑G‑AATAAAATTAAAGA‑GATTGGCGC‑CAACCTTACAGCCATGATTTTT‑ACCCGAAT‑GCCTGATTACGGGGTGGGAAAACTAAAAAAACTAAAGGATG‑C‑CGaaaaactgtcg > 1:904245/1‑231 (MQ=255) aaTTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAACT‑GGGGGTTCCCTGATGAGAGAAAAGAATAAAC‑AACA‑AGCAGT‑G‑AATAAATTGACAGA‑GATTTTCGC‑TTACTTTACCCCCCTGATTTTT‑TCCCCCAT‑GCCCGATGACGTGGGGGGTAAACTCAAAAAGCTAAAAGATT‑C‑CGAAACctcgtc > 1:398705/1‑238 (MQ=255) tacaattacACGGGGGAAAAAAAAAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAG‑TTGGGGGGGTGAAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACG‑GGGGTGGCTTGGATGAGCGAAAGAAATAAGC‑AACG‑GGAAGT‑A‑AATAAGTTGACAGA‑GATGGTCGA‑TAATTTACCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATg < 2:592744/231‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCATACAAAAACAAAAAAA‑TGAGTTGCCATGGTGAGCGAAAAGAATAAAC‑AACA‑AGAAGT‑G‑AAAAAATTGAAAGA‑GATTGTTGC‑TAAATTTACCGCCCTGATTTCT‑ACCCGAAA‑TCCTGATGAAGTGGGGGATCAAAATAAACAGCTAAAGGAGT‑C‑CCAAAAATTGTCGGTgggg > 1:1352722/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAACT‑TGAGGTGGCCTTATGGGCGGAAGAAATAAAC‑AAAA‑AGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TTACTTTACCGCCCTGATTTTT‑TCCCCGAT‑GCCTTATGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAACTAAAGGAAGCC‑CGAAAC‑TCGTTGGTgggg > 1:358918/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATaa < 1:1278150/130‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGAAGT‑G‑AATAAGTGGACAGA‑GATTGTCGC‑TATCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:1241603/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:41850/239‑1 (MQ=255) tatTCACCGTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTAAGGGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACT‑GGAGGTGCCATAAGGGGCAAAATTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTGGACAGA‑GATTGTCGC‑AAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1084316/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAAAATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAAAACAAAAACT‑GGATTGGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGaa < 1:294935/239‑1 (MQ=255) ttgaCGGTGGAAAAAAAAAAAAACCCAAATTATTATTGGTGATTGGTGGCGGAT‑AATTTTTCAAAACAAAAAAAAAAACT‑GGAGTGCCGATGATGAAAGAAATTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑T‑AATAAGTTGACGGA‑GCTTGTCGA‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:686643/234‑1 (MQ=255) agggtgaaaaaaaaTAAAAAACCACATTTTTGGTGGGAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTACAGACAAATACAAAAACG‑GGGGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GTTTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:1341638/231‑1 (MQ=255) aCGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGTG‑AATTTTTCAAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:812328/239‑1 (MQ=255) aCGGTGACAAAAAAGATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑ATTTTTACAAGAAAAAGAGAAAAACT‑GGGGGTGCTATGAGGGGGTAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGAAGG‑G‑AAAAAGTTGAAAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 1:1244826/239‑1 (MQ=255) cGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCCCACAAAAAAAAAAAAT‑GGAGTTGCCATGATGAGAGAAAGAAATAAAC‑AAAA‑AGGAAT‑G‑AAAAAAATGACAGA‑GATTGTCGC‑TAAATTTACCGCCATGATTTTT‑ACCCCAAT‑GCCCGATGACGTGGTGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAGGAAG‑C‑CGAAAAGGCGTCGATGGGGGAAATTa > 1:1067518/1‑239 (MQ=255) ttGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTAAGTGGTATTTTTGGGCGGTG‑AATTTTACCAGACAAAAACAAAAACT‑GGGGTTTCGTTGAGGAGCAAAAGTAATAACC‑AACA‑GGCAGT‑A‑AATAAGTTGACAGA‑GTTGGTGGC‑TAACTTTGCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1128489/237‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAATAAAAACCCAAATTTTAAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACG‑GGAGTGGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAGC‑AACA‑GGAATT‑A‑AATAAGTAGACAGA‑GTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:638215/238‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAGACAAAAAAAAAAAAA‑GGGGGTGCCATGGTGGGGGGAAGGAAAAAAA‑AACA‑AGCAGG‑G‑AATAAGTTGTAAGA‑GAATTTTGC‑TAAATTTTACCCCATCATTTTT‑TCCCCAATAGCCTG‑TGATGGGGGGGGTAAAATAAAACAACCAAAAGATG‑G‑CGCAACAGCGTCGGTGGGGGAAAatatta > 2:1330359/1‑237 (MQ=255) aaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACT‑GGATTGGCCATTATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:372883/239‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAACCCACATTTTTAGGGGTATTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACG‑GGGATGTCAATGAGGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GTATGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:576389/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGA‑AACA‑GGAAGT‑A‑AATAAGTTGACAGA‑GTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:731558/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTCCCAAACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCAATGATGAGCGAAAGAAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑A‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:36974/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑ATTTTTCCCAGACAAAAAAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGA‑AACA‑GGCGGT‑A‑AATAAGTTGACAGA‑GTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1352722/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGTA‑AATTTTCCCAGACAAATAAAAAAACG‑GGAGTGGCAATGATGAGAGAAATTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑A‑AATAAGTTGAAAGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1291049/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTA‑AATTTTCCCAGAAAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGAGGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACG‑GGCAGT‑A‑AATAAGTTGAAAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:68787/239‑1 (MQ=255) tataAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAga‑ga < 1:1393126/121‑1 (MQ=255) acaTTTTTATTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCAATGATGAGGGAAAGTAATAAGA‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAGGTTAAGAGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:1174881/239‑1 (MQ=255) aaaTTTTGAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAATAAAAAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:487715/237‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCTAACAAAAAAAAAAAAT‑GGAGTTGTCATGCTGAGGGAAAATAAAAAGA‑AAAA‑AGCAGG‑GAAAAAAGTTG‑CAGA‑GGTTTTAGC‑TAACATTCCCGCCACAACTTCTAACCCCAAT‑‑CCCGATTACGCGGGGGACAAAATAAAAAAACTAACAGATG‑CACAAAACG‑CGTTGCGGGGGGAAATTAATTACCATACCATTTTTGacaaa > 2:685745/1‑238 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAAAA‑GGAGGTGCCATGATGGGCGAAAGTAATAAAC‑AACA‑GGCAGA‑G‑AAAAAGTTGACAGA‑GATTGTGGC‑Taa > 2:1393126/1‑121 (MQ=255) aattggtgGCGGTA‑AATTTTTCAGGCAAAACAAAAAAACT‑GGATTTCCCATGATGAGCCAAAGTAATAAGC‑ACCA‑GGCGGT‑G‑AATAAGTGGACAGT‑GTTGCTCGC‑TATCTTTGCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGTCGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:758974/234‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:148146/239‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCAAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:76146/239‑1 (MQ=255) gtgtgggtagttG‑AATTTTGACAGAAAAATAAAAACACT‑GGATTTGCGAAGAGGAGCAAAAATGATAAGC‑AACA‑TGCGGT‑G‑AAAAATTTAACAGT‑AGTTGTCCA‑TAATTTTACCACCATGATTTCT‑ACCCGCAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1176372/227‑1 (MQ=255) gTTTGTGGGGGGA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAACCT‑GAAGTTGCCAGAATGGGCGAAAATAATAAGC‑AACA‑GGAAGT‑G‑AATAAGTGGACAGG‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1182401/238‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCGGTA‑AATTTTTCAAGAAAAATAAAAAAACT‑GGAGTGGCCATGATGAGCGAAAGTAATAATC‑AACA‑GGCGGT‑A‑AATAAGTTGAAAGA‑GTTTGTCGT‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:821929/238‑1 (MQ=255) tgtgGGGGTA‑AATTTTCCAAAAAAAATAAAAAAATG‑GGAGTTGCCATGAAGAGCGAAATAAATAAGC‑AACA‑GGCGGT‑A‑AATAAGTTGAAAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGa < 2:1067518/239‑1 (MQ=255) aTTTTCCCAGACAAAGCCAAAAATT‑GGAGTTCCACTGTTGAGCGAAAGAAACAAGC‑AACA‑GGCACT‑T‑AATAGGTGGACAGA‑GATTTCCGC‑TAACTGTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGACG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTc < 2:1148441/239‑1 (MQ=255) tttCCAAACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGAGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGAAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:1379660/239‑1 (MQ=255) tttCCAAAAAAAAAAAAAAACT‑GGATGTGCAATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑A‑AATAATGTGAAAGA‑GATTGTCGC‑AAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:975011/239‑1 (MQ=255) ttacaaGAAAAAGACAAAATCG‑GGAGTTGCCAGGATGAACGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AAAAAGTTGACGGA‑GATTGTGGT‑TATCTTAACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:297075/234‑1 (MQ=255) aaaaaaacaaaaacT‑GGATTTGCCATAATGAGAAAAATAAAAAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 1:1314934/237‑1 (MQ=255) aaaaaaacaaaaacT‑GGAGTTGCCATGATGGGCGAAAGAAAAAAGC‑AACG‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 1:38975/237‑1 (MQ=255) aaaaaTACAAAAACT‑GACTTTCCCATGATGAGCGAAAGAAAAAAGC‑AACA‑GG‑AGTGG‑AATAAGTT‑ACAGAGGATTTCCGC‑TATTTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 2:1131393/237‑1 (MQ=255) aaTAAAAAAAGT‑AGATTTGACATGAGGAGCAAAAGTAATAAGC‑AAAA‑GGCAAT‑A‑AATGAGGGGACAGA‑GAGGGATTC‑TAACTGTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCAGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGAGGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCGGAATCGTCCTGCCTGTCAGGa < 2:689243/239‑1 (MQ=255) acactgggAGTTGCGATAATGACGAAAAGAAATAGTC‑ACCT‑GGAATT‑A‑AATAGGTGGACAGA‑GTTTGTCGC‑TACTTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:1096056/233‑1 (MQ=255) aaCT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑TATTGTCGA‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:739830/239‑1 (MQ=255) gAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACAGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCCGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATCCAACAAGCGATTGACCTGAATACTCCTGCCTGTCAGGACACCTGGGAGAta > 2:767572/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTc < 1:752411/80‑1 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTc > 2:752411/1‑80 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:100135/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1068313/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGAGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 2:228097/1‑238 (MQ=255) aaGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑A‑AATAAGTTGACAGA‑GTTTGTCTC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGt < 2:36186/237‑1 (MQ=255) gTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGt > 1:522259/1‑239 (MQ=255) cA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTcc > 2:5762/1‑238 (MQ=255) | ATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACA‑GGCAGT‑G‑AATAAGTTGACAGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206255‑3206725 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |