| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,088,445 | G→T | 8.8% | Q471K (CAA→AAA) | frvR ← | putative frv operon regulator; contains a PTS EIIA domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,088,445 | 0 | G | T | 8.8% | 501.0 / 2.3 | 159 | Q471K (CAA→AAA) | frvR | putative frv operon regulator; contains a PTS EIIA domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/90); new base T (14/3); total (66/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.54e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TTAGCTCATGACGCGCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATAACGGCTCAATC > NC_000913/4088211‑4088680 | ttAGCTCATGACGCGCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTgcgc > 1:536941/1‑238 (MQ=255) tggccagctgcggcggcggCGCAGGCAATCAAGACATGGTTAATGATTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTg < 2:1206732/229‑1 (MQ=255) tGACGCGCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTg < 2:130433/239‑1 (MQ=255) gACGCGCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGc < 1:1361494/239‑1 (MQ=255) cgcgCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGcc < 2:1228979/238‑1 (MQ=255) cgcgCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGcc < 2:1181874/238‑1 (MQ=255) cgcgCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGcc < 1:483015/238‑1 (MQ=255) cgcgCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGcc < 2:1142239/238‑1 (MQ=255) cgcgCAGCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGcc < 2:100012/238‑1 (MQ=255) gcATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGt < 1:1269641/239‑1 (MQ=255) gtcgcAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑Gcc < 2:858717/237‑1 (MQ=255) ggcgCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCCCCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑Gcc < 2:710999/239‑1 (MQ=255) gATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCa < 1:440431/238‑1 (MQ=255) aaGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACcgcg < 2:536941/239‑1 (MQ=255) aaGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACcgcg < 1:706070/239‑1 (MQ=255) cATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTCATATGGTGTTGTGGGACTAATTTTGGACCAATTTTCCGGGGTATATGTT‑TGCAGCTTTTACCGCGTT‑Ca > 1:495920/1‑239 (MQ=255) cATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑Ca > 1:1002820/1‑239 (MQ=255) gTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGc < 1:1293513/202‑1 (MQ=255) ttAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGt < 1:1134599/213‑1 (MQ=255) aTGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATTGTGTTGGGCGAATAATTGCGCCCAAAATTTCCGGGTAATATGTT‑GGCAGATTTCACCGCGTA‑CCTTTGaata > 1:265735/1‑239 (MQ=255) ttCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGATGTGCTTCATCGGCGGTTATATAGTGTTGTTCGACCAACTTCGCACAAACATGCTGGGTAATAACTT‑CCCATCCTTCACCGCGTA‑CACTTGAATAATgga > 2:39001/1‑237 (MQ=255) tCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTTCGACTAATTTCGCACAAATTTTCCGGGTAATTTGTT‑GTCAGCTTTCACCGCGCA‑CATTCTAATAATaaaa > 2:562731/1‑239 (MQ=255) cGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGGCTTATTGCGCACCAATTTGCCGGGGAATATGTT‑GCCAGCTTTTACCGCCTA‑TATTCGAATAATGgaa > 1:285827/1‑238 (MQ=255) cGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGGTATATGGTGGTGTGGGACGAAATGGGCACAAATTTGTCGGGTAAAATGTT‑TCCTGCTTTTCCCGCGGA‑CATTCGAATAAAGaaaa > 2:178893/1‑239 (MQ=255) cGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGGAATTTGGTGTTGTGCGGCTAATTGCGCCCAAATTTGCCGGGGAAAATTTT‑TCCAGCTTTCACCGCGGA‑CATTCGAATAATGaaaa > 1:595275/1‑239 (MQ=255) cGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGCAATATTGTGTTTTGCGCCTAACTGCGCACCAAATTGGCGGGGAACATGTT‑TTCAGCCTTTACCCCGTC‑CCATCGCATAATGgaaa > 1:476592/1‑239 (MQ=255) cTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAACCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCggggg < 1:925517/239‑1 (MQ=255) tCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGGGTTGTGGGACTAAATGGGCCCACATTTTCCGGGTAATCTGTT‑GCCCACCTTTTCCGCGGA‑CATTCGAAAAATGACAAATTCCcggggg > 2:934658/1‑238 (MQ=255) gTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGGCTAACTGCGCACAAAATTGCCGGGGCAAATGTT‑GTCAGCTTTCACCGCGTACCATTC‑AATAATGAAAACTTCCAGGGGGAGA‑Gaaa > 2:747341/1‑239 (MQ=255) tGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGGGGTGTGTGGCCAATTGCGCACAAAATTTCCGGGGAAAATGTT‑GATCGCTTTTACCGCGTA‑CAATCGAACAATGGAAACATCCGGGGGcgatggaaaa > 2:463588/1‑230 (MQ=255) gggCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑Gaaaaaa < 1:1077936/239‑1 (MQ=255) gCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGGGGCTAATTTAGCACAAAATTTCCGGGGAAAATTTT‑TCCAGCTTTTATCCCGCT‑CATTCGGATAATGAAAACTTTCGGGGGCAGA‑GAAAAAAc > 2:1338902/1‑238 (MQ=255) gAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCt < 2:1002820/239‑1 (MQ=255) aGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCt < 1:1248076/238‑1 (MQ=255) cGCTGCTGGTCGCTCCAGTAGTGTGGGAGGGCGAGGCGATTAACGAACAGGTTTTCAACAACGCCTTCGCGGGAGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGAGGTAATATGGTGTTATGAGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTACACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGc < 2:637076/239‑1 (MQ=255) gCTCCTGTTCGCTCCGGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGc < 1:962694/238‑1 (MQ=255) cTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGaa < 2:379676/239‑1 (MQ=255) cGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATTGGGGTGTGGGGCTAATTGCGCCCCAATTTTCCGGGGAATATGTT‑GCCAGCTTTTACCGCGTA‑AATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGGAGG‑GGAAAAAAGCCCCCGGTGTTGGCGGATAAAAACCGTCCGCCGGaaaact > 2:247267/1‑237 (MQ=255) tCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGGGACTAATTGCGCACAAAATTTCCGGGGAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGGA‑CCTTCGAATAATGAAAACTTACGGGGGGAGA‑GAAAAAAAGCCCCGGCTGGTGGCGGATAAATGCCCT‑CGCCCGCAAATGtttt > 2:143796/1‑239 (MQ=255) tgGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTCATTTGGGGGTGTGTGGACAAATCCTGACAAAATTGCCGGGTAATATTTTGGTCCGC‑TTCACCCCGTC‑CATTCCCATTATTCAAACTTTCGGGGGCCGAGGAAAAACCGCTCC‑GCCGTTGGGGCATAAATACAGT‑CCCCAGTAAATGTTTTTTTTGttt > 2:746534/1‑236 (MQ=255) ggcgaggcgaTTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCgg < 1:588404/239‑1 (MQ=255) ggcgaggcgaTTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCgg < 2:323952/239‑1 (MQ=255) gcgaggcgaTTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCgg < 2:983517/238‑1 (MQ=255) aggcgaTTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGGAAAATTGTGTTGTGGGACTAATTTCGCACAAATTTTCCGGGGCATATTTT‑GTCCGCTTTCTCCCCCTA‑CATTCCAATAATTTAAACCTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACCCTCCGGGGGCTGGCGTACAAAAGCCGG‑AGCCACAAAATGTTTTTTTTTTTTTTCACCGGCAg > 2:98312/1‑238 (MQ=255) cgaTTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCg < 1:143796/238‑1 (MQ=255) gaTTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTa < 1:707813/239‑1 (MQ=255) ttAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAAt < 1:178521/239‑1 (MQ=255) tAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATg < 2:452461/239‑1 (MQ=255) aCAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGat < 1:1148828/239‑1 (MQ=255) aCAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGat < 1:587518/239‑1 (MQ=255) tCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATTGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGTCGGGGAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTTGAATAATGAAAAATTTCGGGGGGGGA‑GAAAAAAAGCTCCGGCTGTTGGCGGATAAAAGCCGT‑CGCCCGAAAAAGTTTTTTTTTTTCGTTACCGGCAGCGCGAATGGTAttt > 2:345352/1‑239 (MQ=255) ggTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTTCGCCCAAATTTGCCGGGGAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAAATTCCGGGGGGCGA‑GAAAAAACCCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCCGAAAAAGGTTTTTTTTTTTGGTACCGGCCGCCGTCATGGATtttttt > 2:159521/1‑239 (MQ=255) ttttCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTa < 2:487838/238‑1 (MQ=255) ttttCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTa < 1:1228751/238‑1 (MQ=255) tCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCCCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGt < 1:562731/239‑1 (MQ=255) aCCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGa < 2:939505/239‑1 (MQ=255) cttcgccttcgcGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATg < 1:346871/239‑1 (MQ=255) cttcgccttcgcGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATg < 2:391330/239‑1 (MQ=255) cttcgccttcgcGGGCGATGATGCGGTGTTCTTCATCGGGGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATg < 2:285827/239‑1 (MQ=255) tcgccttcgcGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTTCGCACAAAATTTCCCGGGAATATGTT‑GCCCGCTTTTTCCCCGGA‑TCTTTGAATAATGGAAAATTCCCGGGGGAGA‑GAAAAAAAGCTCCCGCTGTTTGGGGATAAAATCCGG‑CGCCCGGAAATATTTTTTTTTTTTGGTTCCGGCAGCCCGAATGTAATTTTTTATCGGTgtttg > 2:931536/1‑235 (MQ=255) tcgccttcgcGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGGATTAATGTGTTGTGCTACTAACTTTGCACCAATTTGTCGGGGGGTATGTT‑GGCCGATTTTACCACCTA‑CACATGAATAATTTTAACTTTCAGGGGCAGC‑GAAAAAAAACGCCGGGTGTTTGAGAGTCAAAACCGT‑TGCACGAAAAAAGCTTTTTTTTTCGATACCGCGGACCGCAATGCTCttttttttctgggtttt > 2:719245/1‑228 (MQ=255) cgccttcgcGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTTATATGGTGTTGGGGGGCTAATTGCGGACAAAATTTCCGGGGAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATTAAAAATTTCGGGGGGGGG‑GGAAAAAAACCCCGGCCGGTTGCGAATAAATGGCGG‑CGCCCGAAAAAGGTTTTTTTTTTTGTTACCGGGCGCCGGAGTGATATTTTTTT‑AGGTGTTTTaa > 2:679365/1‑239 (MQ=255) gggggCGATGATGCGTTGTGCGTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑TCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTa < 2:1353087/237‑1 (MQ=255) tgatgCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTc < 1:1338902/238‑1 (MQ=255) tgCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATc < 1:82949/238‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCa < 2:595275/239‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCa < 2:1137510/239‑1 (MQ=255) gCGGTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCa < 2:1100771/239‑1 (MQ=255) tgCTTCATCGGCGGGAATATGGGGTTGTGCGACTAATTTGGCACCAATTTTCCGGGGAATATGTT‑GCCAGCTTTTACCGCGTA‑CATTTGAATAATGAAAACATCCGGGGGCAGA‑GAAAAAAAGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCCGAAAATGTTTTATTTGTTTGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTT‑CGGTGATGTAATTATTTAACGCGTCATCCCGTAaat > 2:840223/1‑239 (MQ=255) cATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATgg < 1:868232/239‑1 (MQ=255) ggcggTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCtgt < 2:364214/239‑1 (MQ=255) aaTATGGTGTTGTGCGCCTAATTTCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTTGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTa < 2:1271322/238‑1 (MQ=255) aaTATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTa < 1:172016/238‑1 (MQ=255) atGGTGTTGTGCGACTAATGGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGa < 2:1051454/239‑1 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCa > 1:493576/1‑209 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCa < 2:493576/209‑1 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGt < 2:1337568/211‑1 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGt > 1:1337568/1‑211 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCACTa > 2:647809/1‑239 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATa > 1:660249/1‑239 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATa > 1:762998/1‑239 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATa > 1:662645/1‑239 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATa > 2:416584/1‑239 (MQ=255) ttgtGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATa > 1:173588/1‑239 (MQ=255) tgtgCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATaa < 1:982433/239‑1 (MQ=255) tgCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTAcc < 2:172291/196‑1 (MQ=255) tgCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCtg < 1:38828/220‑1 (MQ=255) tgCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCt > 2:551178/1‑219 (MQ=255) tgCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCt < 1:551178/219‑1 (MQ=255) tgCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATAACg > 2:648734/1‑239 (MQ=255) tgCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATAACg > 1:1115987/1‑239 (MQ=255) cGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGAAAATAATGGCTGTTTGTAATGTACAATAACgg > 2:972085/1‑238 (MQ=255) cTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTa > 2:1080086/1‑204 (MQ=255) cTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCtgt > 1:265646/1‑216 (MQ=255) cTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCtgt < 2:265646/216‑1 (MQ=255) cTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTa < 2:1265083/221‑1 (MQ=255) cTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTa > 1:1265083/1‑221 (MQ=255) cTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATAACGGCTCa < 2:485930/239‑1 (MQ=255) aaTTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCCGCAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTACTGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATAACGGCTCaa > 2:765357/1‑238 (MQ=255) tGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGC‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCCGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTTTTAATTCTCAATAAAGGCCCAAtc > 2:168933/1‑237 (MQ=255) | TTAGCTCATGACGCGCATCGGCGGCGGCGCAGGCGATCAAGACATGGTTAATGACTTCGTTATTCACCTCAACTGGTTGGGCGAGGGTAATAAAAAATCCACGAAAACGTCGCTCCTGTTCGCTCCAGCAATGTGGGATGGCGAGGCGATTAACAATCAGGTTTTCACCTTCGCCTTCGCGGGCGATGATGCGTTGTGCTTCATCGGCGGTAATATGGTGTTGTGCGACTAATTGCGCACAAATTTGCCGGGTAATATGTT‑GCCAGCTTTCACCGCGTA‑CATTCGAATAATGAAAACTTCCGGGGGCAGA‑GAAAAAACGCTCCGGCTGTTGGCGAATAAATGCCGT‑CGCCAGAAAATGTTTTATTTGTTCGATACCGGCAGCCGTAATGATATTTTTTA‑CGGTGATGTAATTATTTACCGCGTCATCCAGTAAATAATGGCTGTTGTTAATGATCAATAACGGCTCAATC > NC_000913/4088211‑4088680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |