| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3830057 | 180 (1.300) | 4 (0.030) | 3/418 | NT | 2.4% | coding (1113/1392 nt) | xanP | xanthine permease |
| ? | NC_000913 | = 3830253 | 157 (1.160) | coding (1309/1392 nt) | xanP | xanthine permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GATGTTGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATCGTG‑CTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAACAGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCT > NC_000913/3830015‑3830484 | gATGTTGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGGTTTTGCCGTTTGCCCCTGGATGGGTGa > 2:397276/1‑239 (MQ=255) cGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCt > 1:1057255/1‑237 (MQ=255) gTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTGTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑ct < 1:676306/239‑1 (MQ=255) gTGCTGGGGCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑ct < 2:725282/239‑1 (MQ=255) tGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑c > 1:1432182/1‑237 (MQ=255) tGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGGCTGGGCGGGTCTCAGCAGGCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGTAAAA‑CCTG‑c > 1:1166843/1‑237 (MQ=255) tGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGAGCTGTCGCTGGCGGTTGGGCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGACTTTGCAGTTTTCCCCTGAATGGCTGAACAA‑CCTG‑c > 1:1464966/1‑237 (MQ=255) 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gAGCGGTTGTGTACAACACAGTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGTTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTGTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGAGTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggc < 1:422390/238‑1 (MQ=255) tttGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 1:1494260/239‑1 (MQ=255) caacaCATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAt < 1:954149/239‑1 (MQ=255) caacaCATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAt < 1:1309064/239‑1 (MQ=255) cacaTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTTGCCTGGGCGTGTCCCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGCTCGCCCCCGGCGGGATTTTCGCCATcc > 1:1012093/1‑237 (MQ=255) cacaTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAACAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGCTCGCCCGGGGCGGTATTACTGGCACCGt > 2:1289076/1‑239 (MQ=255) 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tCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATCGTG‑CTGa > 1:65836/1‑239 (MQ=255) tCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGGGTCGCCGCAACCGCTGATTTTGCAGGTTGCCCCTGAATGGCCGGAAAA‑CCTG‑CTCTCCTCCGGGATTGCCCGCGGCGGGATTACCGCCACCggcgtgc > 2:528562/1‑233 (MQ=255) aaCCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCCCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA‑CCTG‑CTCTTCTCCGGGGTCGCCGCGGGCGGGATTACTGCCATCGTG‑CTGAATTTg > 1:1396973/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |