| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,151,689 | G→T | 31.7% | intergenic (+43/+22) | yegJ → / ← yegK | uncharacterized protein/ser/thr phosphatase‑related protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,151,689 | 0 | G | T | 31.7% | 39.7 / 11.0 | 49 | intergenic (+43/+22) | yegJ/yegK | uncharacterized protein/ser/thr phosphatase‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (20/13); new base T (9/7); total (29/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.84e-01 | |||||||||||
TATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAAGAAGATATTTCAGACTGGATGTATACGCGCGGGGATAAAATTTA‑CGGCGGTTATACCATTGATCCTTTATTGGT‑CACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGC‑GGTTG‑AATTGTTGTCTTCAA‑CCGCCATG‑AGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGTTTACCGCCGGGCTGGACAAAAACTGC‑TTTAACAATTCAGGTAATAAATCGAGTTGTTCCTGCGTTGCTGCCGCCAGTCCATTGAAAAACGGGGTAAAGAAAGGCACATGAGGAGAATTATCCAGCATATTTAACGCCAGTCGCTGGATACCATCCGTA > NC_000913/2151475‑2151921 | tATTGTTAAAAACGGAGAATAGGGCAGGGAGTGAAAAAAAAAGAAAAAAGATATTTCAGTCTGGATTTATACGGGGGGGAAAAAAATTTG‑CGGTGTTTATACCATTGATCTTTTATTGGT‑CACTTATCAAAAAAAAGAAGCCGACGAGAAAAGAGAAAAATTGGTTCGCTAACCCGCCTTTATATTTATTGTTAAAACGGGC‑GGTTG‑AATTGTTGTCTTCAA‑CCGCCATG‑AGAAactc < 2:939130/238‑1 (MQ=255) 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TATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAAGAAGATATTTCAGACTGGATGTATACGCGCGGGGATAAAATTTA‑CGGCGGTTATACCATTGATCCTTTATTGGT‑CACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGC‑GGTTG‑AATTGTTGTCTTCAA‑CCGCCATG‑AGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGTTTACCGCCGGGCTGGACAAAAACTGC‑TTTAACAATTCAGGTAATAAATCGAGTTGTTCCTGCGTTGCTGCCGCCAGTCCATTGAAAAACGGGGTAAAGAAAGGCACATGAGGAGAATTATCCAGCATATTTAACGCCAGTCGCTGGATACCATCCGTA > NC_000913/2151475‑2151921 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |