| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,228,164 | A→G | 13.1% | E145G (GAG→GGG) | yjbB → | putative Na+/Pi‑cotransporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,228,164 | 0 | A | G | 13.1% | 357.3 / 5.4 | 131 | E145G (GAG→GGG) | yjbB | putative Na+/Pi‑cotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/63); new base G (15/4); total (62/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.27e-03 | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
ATGCTGGTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGT‑CGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTTGATTGTGCAGGCCGTAACGCCGATCACCCAGGCAAA‑CGGCGTTCAGGTGATCTTTGCCTCGCTGACCGGCGATATTCTGCTGGATGCGCTGATTGGCGCGATGTTCGCCATTATCAGCTACTCCAGCCTTGCTGCTGTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCT > NC_000913/4227926‑4228395 | aTGCTGGTGACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGT‑CGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGa < 2:1090868/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |