| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,536,218 | C→A | 23.8% | intergenic (+187/+396) | yjhR → / ← nanS | pseudogene, helicase family; putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,536,218 | 0 | C | A | 23.8% | 122.1 / 3.4 | 48 | intergenic (+187/+396) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family; putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/24); new base A (7/5); total (19/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAAAATGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATAACA > NC_000913/4535980‑4536449 | aaaaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACATCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagc < 2:598411/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 1:367037/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 1:1478062/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 2:229236/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 2:290610/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 1:1126599/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 1:1060263/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGACTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 1:110434/239‑1 (MQ=255) aaaaTGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTATGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 2:400633/239‑1 (MQ=255) aaaGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAAtaatat‑aata < 2:1271/239‑1 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGCTTATAAATCTTATTGTTTACCTATTCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTTTGTTTTGAAG‑AAAAAGCAAACAACAAAAT‑AAAAAATGAATAATttttttta > 2:593972/1‑237 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGTGG‑CTTTTTTGTAAGTAAAA‑AAAATAC‑AGCACTAATAT‑ATAAATAGGCTAATTTTTTTgt > 1:284048/1‑238 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTT‑C‑TTGTTTGAATGAAAG‑AAAATATAAACAATAATAT‑AATAAAGGCCGAATTTTTTTgt > 1:1175373/1‑238 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑T‑TTTTTGTTATTAAAGTAAAATAC‑AGAAAAAATAT‑AATAATAGGCTAATtttttttt > 2:610994/1‑237 (MQ=255) cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGaa < 1:1195851/239‑1 (MQ=255) cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATAAAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGGCTAATTTCTTTGaa < 2:178362/239‑1 (MQ=255) tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTGCC‑TTTTTGGAAT‑AAAA‑AAAAAGAAAACAAACATAT‑TATAAATGCCTTATtttttttttc > 1:1067348/1‑235 (MQ=255) tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑G‑TTTTTTGAATGAAAG‑AAAAAACAAGAAAAAAAAT‑AATAAAGGCCTAATTTTTTTTaaa > 2:516179/1‑238 (MQ=255) gaGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTAt < 2:400103/239‑1 (MQ=255) ttCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTTTGTATGAAAA‑AAAAAGCAAGCAAAAATAT‑AATAATAGGCTCATTTTTTTTAACATTATTAAGTATTATAAT‑ATTGT‑CTAtttttct > 1:787183/1‑235 (MQ=255) gATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTGTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCa‑ta < 1:464543/214‑1 (MQ=255) aCAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGt < 1:691560/239‑1 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTTGGAATGAAAG‑AAAATGGAAGCAATAATAT‑AATAATTGCCTAATTTTTTTTAACATCATTTAGCA‑TATCATCATTGT‑CTATTTATCAGAATCCATCg > 1:396881/1‑239 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGAG‑C‑TTTTTGGAATGAAAA‑AAAATCACAGAAATAATAT‑AATAAAAAGCTAATTTCTTTTTAAATCATTAAGGA‑AATCATCAATGT‑CTCTTTTCCATAATCCGTcc > 1:191377/1‑238 (MQ=255) gAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑G‑TTTTTTGCATGAAAT‑ATAAAACCATAAAAAATAT‑AAAAATAGGATTATTTCTTTTTACATAATTTATAA‑TAATATCATCATCCTTTTTTCCA‑TATCCGTCGaa > 2:887807/1‑238 (MQ=255) tagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTTTGAATGAAAG‑AAAAAACAAGAAATAAAAT‑AAAAAAAGTCTAATTTTTTTTTAAATCATTAAACA‑AATCATCATCGT‑TTATTTTTCAGAATACGTCTTCTta > 2:822284/1‑239 (MQ=255) tagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGG‑G‑TTTTTTTGATGTAAA‑AAAAAGAAAACAATAAAAT‑AAAAAAGGCCTAATTTTTTTTTAAATAATTAAGAA‑AATAATCAATGT‑TTATTTTTCAGAATCCCGCGACttt > 2:1390337/1‑238 (MQ=255) gtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGG‑C‑TTTTTTGAATTAAAA‑AAAAAAAAAGAAATAATAT‑AAAAAAAAGCTAATTTTTTTTTAAAACATTAAACA‑TATAATCATCGT‑CTTTTTTTCCGAATACCTTGACttttt > 2:1210959/1‑236 (MQ=255) aaaGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTtat‑a < 1:1315525/237‑1 (MQ=255) tttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACgg < 1:593972/239‑1 (MQ=255) cAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCatat < 1:375504/239‑1 (MQ=255) aTGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCa < 1:317789/239‑1 (MQ=255) tGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑G‑TTTTTTGGATGAAAG‑AAAATGAAAGCAATAAAAT‑AATAAAGGCCTAATTTTTTTTTACATCATTAAGAA‑TATCATAATCGT‑CTATTTTTCAGAATCCGTGCACTTTT‑AATTCCCCGAAAGGCatatacg > 2:30893/1‑236 (MQ=255) gTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTa < 1:529720/174‑1 (MQ=255) tAAGGCGACTTTCCTTTTTATTTCTAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGa < 2:450935/238‑1 (MQ=255) tttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtg < 1:1532319/239‑1 (MQ=255) cGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACg < 1:785873/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:1390337/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:822284/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:1447703/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:247883/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:1210959/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:30893/239‑1 (MQ=255) tCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTATGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAt‑aataa < 1:642527/99‑1 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑G‑TTTTTTGAATTAAAA‑AAAAAGTAAGAAAAAAAATAAAAAATGGCCTATTTTTTTTTAA‑ATAATTAAATA‑TATAATTATTTT‑ATTTTTTTCCGAATCCGCCGACTCATAAATACCCACAA‑AGCATATCTGGACGGGGCTCCCAACCCGCTGGGCCAAAAAGTTCTCCTAAACCGTGTGGATGtg > 2:42365/1‑238 (MQ=255) cATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATgcaagcaa < 1:1323397/70‑1 (MQ=255) ttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑G‑TTTTTTTGATGAAAA‑AAAAAGAAAGGCATAATAT‑AAAAATGGGCTTATTTTTTTTTACATAATTAAGCA‑TATTATCATCGT‑CTATTTGCCTGAAAATCTCCACTTAT‑AATAACCAAAAACGCATATTAAGAAGGTGCGGGCGACGCTGTTGCGCCAAACAGTCCAGCAAAAAGAGTGGAAGGTCGTCGGTTTCCGAGCCCTAATca > 2:697682/1‑238 (MQ=255) ttGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTTGGAATGGAAA‑AAAATGCAAGCAAAAATAT‑AATAAATGCCTAAATTCTTTGAAAATCATTAAACA‑TATCATCATCCT‑CTATTTTTCAGAATCCGTCGACTTTT‑AATCACCCGAACGGCAAATTCGGACGGGGGTGCGGACGCTTTGGCCCCCAACCCTCCCGTAAACTGTGTTGATGTTCGTTGATTTTCGAGCCAAAATct > 1:1003496/1‑238 (MQ=255) cgtgaaTTAATGGCGGGTT‑C‑TTTTAGGAATAAAAA‑AAAATACAAGAAATAATAA‑AATAAGGGCCTAATTTCTTGAAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGATTCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGGGGCCAAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGAt < 1:757557/234‑1 (MQ=255) cTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGAt < 1:610994/239‑1 (MQ=255) cTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGAA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAA‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCAAAAACTTCCCAGAAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGAt < 1:887807/239‑1 (MQ=255) cTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGAAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTCCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGAt < 1:516179/239‑1 (MQ=255) aaTGAAAA‑AAAATGCAAGAAATAATAA‑AATAATGGATTAATTTCTTTCAAATTCATAAAACC‑TATCAACATCGT‑CTAGTGGCCAGACTCCTACGTATTAT‑AAGCGCAAGAACAGCATATCAGGACGGTGTTGCGAACGCTGTGGCCAAAAACGTTCGAGTAAACTGGATAGCTGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAAACGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAACCTg < 2:1067348/238‑1 (MQ=255) aTGAAAT‑AAAATGAAAGAAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TTTAATCCTCTT‑TTATTGGCCAGAATCCGTCGCCTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCAAAAACGTCCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTa < 2:923273/239‑1 (MQ=255) tGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTCATCTGTac > 2:607856/1‑238 (MQ=255) tGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTaa > 2:500947/1‑239 (MQ=255) aaTGCAAGAAAAAATAT‑AATAATGGCCTATTTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTGGCCAGAATCCGTCGACTTAA‑AATCGCCAGAACGGCATATAAGGCCGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACTTTCAAGAAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATaac < 2:396881/239‑1 (MQ=255) aTGCAAGAAATAATAT‑AATAATGGCCTATTTCCTTTGAACATCATTAACCA‑TATCATCATCGT‑CTATTGGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCAAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATaaca < 2:787183/239‑1 (MQ=255) | AAAAAATGAAATAAAGGCAATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGTG‑C‑TTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGCAATAATAT‑AATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATTAAGCA‑TATCATCATCGT‑CTATTTGCCAGAATCCGTCGACTTAT‑AATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATAACA > NC_000913/4535980‑4536449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |