| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2604989 | 153 (0.980) | 4 (0.030) | 4/412 | NT | 2.6% | coding (179/1440 nt) | hyfD | hydrogenase 4, membrane subunit |
| ? | NC_000913 | = 2604993 | 149 (1.000) | coding (183/1440 nt) | hyfD | hydrogenase 4, membrane subunit | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TGCTGCGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCACGAATCGTTATTACGCATTTTTACTGGTGTTTATCGGCGCGATGGCGGGACTGGTACTCTCCTCGACGCTGCTCGGTCAGTTGTTG > NC_000913/2604755‑2605230 | gctgcGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGg < 1:397066‑M2/239‑2 (MQ=255) tgcGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGgtc > 2:1191208‑M2/1‑236 (MQ=255) tgcGCTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGgt > 2:349721‑M2/1‑236 (MQ=255) cgcTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGgtca < 1:782150‑M2/238‑5 (MQ=255) cTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGACTGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCCTGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATCAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGgtaaccg < 2:1350667‑M2/239‑8 (MQ=255) cTTGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGgtcaacg < 1:1267260‑M2/239‑8 (MQ=255) ttGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGTGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGgtcaacgt > 1:1199409‑M2/1‑231 (MQ=255) ttGCATGGGTCTTCTGGTTAACCGGTCTGTAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTTCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGgtcaacgt > 2:1563538‑M2/1‑231 (MQ=255) ttcttGGTTCTTCTGGTTAGCCGGTCTGTATGGATCACTGACGGTAGATGTAAAATAGTGCTCTGACGTTGTTATTGCTGCCTTTTCTCGGCGCCCGGGTCGTGGCGTTTTCGCATCAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTGGTCACTGATCTCCGCGTTTTTTCAGGCCGATAAAGTCGCCGGCACGTTTACGTTGGTCAACGt < 2:1630078/234‑1 (MQ=255) gCATTGGTCGTCTGGTTAACCGGTCTGGAAGGAGCACTGACGGAATATGGAAAATCTTGCTCTGACGACGTTATTGCTGCCTTTTATCGGCGCACTGGTCGTTGCGTTTTCGCCACAACGTCGGGCCGCCGAATGGGGGGTTTTGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTgg < 2:352651/239‑1 (MQ=255) 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tttGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCa < 2:1303577/239‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTc > 1:1250724/1‑179 (MQ=255) ttCGCCGCGCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCACGaa > 1:542347/1‑239 (MQ=255) cgcgCTGACCACGCTGTGCATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCACGAAt < 1:1336411/235‑1 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cATGTTGTCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCACGAATCGTTATTACGCATTTTTACTgg > 2:370331/1‑239 (MQ=255) ttgtCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCACGAATCGTTATTACGCATTTTTACTGGTGtt > 1:1053701/1‑239 (MQ=255) ttgtCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACCAACgtcaacgtgacggcaactttatcggcctgataaaacgcggagatcagtgacaacatgcacagcgtggtcagcgcggcgaacaaaaccccccattcggcggcccgacgttgtggcgaaaacgaaacgaccagtgcgccgataaaaggc > 1:1314339‑M2/1‑57 (MQ=255) gtCACTGATCTCCGCGTTTTATCAGGCCGATAAAGTTGCCGTCACGTTGACGTTGGTCAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATa > 2:860915/1‑200 (MQ=255) 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cGTCACGTTGACGTTGGTTAACGTGGGGGATGTGGCGTTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCACGAATCGTTATTACGCATTTTTACTGGTGTTTATCGGCGCGATGGCGGGACTGGTACTCTCCTCGACgct > 2:829574/1‑237 (MQ=255) cACGTTGACGTTGGTGAACGGGGGGTGTGTGGCGGTGTTTGGCTTGGTCATTGATCGCGTGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGATTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGGCACGAATCGTTATTACGCATTTTTACTGGTGTTTATCGGCGCGATGGCGGGACTGGTACTCTCCTCGACGCTGCTCg < 2:1139850/239‑1 (MQ=255) acgttgacgttgGTCAACGTGGGGGATGTTGCGCTGTTTGGCCTGGTCATTGATCGCGAGAGTACGCTGATTCTGTTTGTGGTGGTGTTTCTCGGTTTGCTGGTCACGATCTACTCCACGGGTTATCTGACGGATAAAAATCGCGAACACCCGCATAACGTCACGAATCGCTATTACCCATTCTTACTGGTGTTTATAGGCGCGATGGCGGGCCTGTTCCTCCACTCGGCGCTGCTccg > 2:1055067/1‑237 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |