New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3100618 = | 210 (1.350) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 1.4% | coding (111/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 |
? | NC_000913 | 3100639 = | 206 (1.360) | coding (90/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAA > NC_000913/3100402‑3100875 | gTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1002730/1‑238 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCCCCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1413763/1‑237 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:781072/1‑237 (MQ=255) aaTGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTaaaa < 1:1395156/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |