Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,487 | C→A | 15.7% | Q9K (CAG→AAG) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,487 | 0 | C | A | 15.7% | 225.1 / 7.8 | 109 | Q9K (CAG→AAG) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/63); new base A (12/6); total (37/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.24e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206249‑3206725 | ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAAc < 1:1068312/239‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:275370/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 1:218379/237‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCACGTGTGATAAGCGAAGTGTATTTCGCAAAACATAGCCATTCCCTGTTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGAGTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACAGTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 2:990895/237‑1 (MQ=255) tCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGATTTTTTC‑AGACAAATACAAAAACT‑TGAGTTTCCACGATG‑AGCGGAAGAAATAAAAAACAGGCAGt > 1:1000215/1‑239 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAACACAAAAAAG‑TGAGATGGCATGATT‑AGGGAAAGGAAAAAAAAAAAGGcggca > 1:530927/1‑235 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATaa < 1:1012099/239‑1 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATaa < 1:466571/239‑1 (MQ=255) tCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAg < 1:778721/236‑1 (MQ=255) cGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGAAAAATAAAAAAACA‑TGAGGTGCCATTATGAAGCG‑AAGAAATAAACCAAAGGCAATGAAAAAATTGaa > 1:877394/1‑238 (MQ=255) aaGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGc < 1:463801/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTTTATTTCGCAAAACATTGCAATTCACTGCTCTGTCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTTATTCACGAACTGTTAATTACATATTCCCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGTTAAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 2:530927/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGATTTTTTC‑TTACCAAAAAAAAAAAT‑GGAGGTGCCCTTGTG‑GGCGAAAAAAATAAACAACAAGGAGAGAAAAAGTTGACAGAGAGTGTTGCt > 1:803893/1‑239 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:763793/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 2:1055200/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 2:364770/239‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AAAACACAACAAAAAAT‑GGAGTTGGCATGATG‑AGCGAAAATAATAAAGAACAAACAAAGAAAAAATTGAAAAAGAATGTCGGTaa > 2:763793/1‑239 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGAAATTTTTA‑AAACAAAAAAAAAAAAT‑GGAGTTTGCATTGAG‑GGAGGAATGAATAAGCAAAAAAAAGGGAAAAAGATGACAGCAAATGTCACTAACtttt > 2:660806/1‑238 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAAAAAAAAAACA‑GGAGTTTCCATGTTG‑GGCGAAAGTAATAAACAACACGCAGGGAATAAAATGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑Acatcc > 1:1158443/1‑235 (MQ=255) cGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑CGACAAATACAAAAAAT‑GGGGTTGGCATTGTT‑GGGGAAAGGAATAAAAAACAAGCAGGGGATAAGTTTTCAGAGAATTTCGCCAAATTT‑TCccccca > 1:834286/1‑237 (MQ=255) aaaaCATTGCGCTCCCCTTCTGGTGCAAAAAATTTATTCTTATTTTCGCGTGGATTCACAAACTTTAAATGAAATATTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTGGGGGTGTGTGGGGGCGGGAAATTTTTCC‑AAAAAAATAAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAAGTAAAAAGCAACAGGAGGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAAATTC‑ACCGCCATGAt < 2:785710/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGGGTTGCCATGATG‑AGGGAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGAt > 1:618666/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGAAAAAAAAAAAAAAA‑GGGGGTGCCATGATG‑AGGGAAAGAAATAAAAAAAAAGGAGTGAATAAGTTGACAGAGATTTTTGCTAAATTT‑ACCGCCATGAttt > 1:190459/1‑239 (MQ=255) cATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAAAAAAAAAAAT‑TGAGTTGCCATGATG‑AGGGAAAGTAATAAACAACAGGGAGTGAATAAATTGACAGAGATTGTTGCTAACTTT‑ACCGCCCTTAttttt > 1:847286/1‑237 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTACGCTTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCC‑AGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAATAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGa < 2:422381/239‑1 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCGCAATATTAATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTGGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGTCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 2:707159/239‑1 (MQ=255) ttCCCTGCTCTGGCGCAATATTCTTTTTTATTTTCGTGTAGATTCACGAACTTTTAATTAAATATCCGCGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAATTTTTTCA‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTGGCCAGGATG‑AGCAAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAAt < 2:834286/239‑1 (MQ=255) tCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGAGAAATTTTTC‑AAAAACAAACAAAAAAT‑GGAGTTTCGAAGAAG‑AGCGAAAATAATAAACAACAAGCAGTGAATAAATTTACAGAGATTTTCACTAAATTT‑ACAACCATGATTTCtcacacaat > 2:1136401/1‑230 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGAAAAATACAAAAACT‑GGAGGTGTCATGATG‑GGAGAAAGGAATAAACAAAAAGCAGTGAATAAAGTGAAAGAGATTGTTGCTAAATTT‑TACGCCATGATTTTTTCCCCAATg > 1:422381/1‑238 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGATTTTTTC‑AGACAAAAACAAAAACT‑TGAGTTGCCATGATG‑AGGGAAAGGAATAAGAAACAGACAGTGAATAAGTTGACACAGATTGTCGCTAAATTT‑TCCCCCCAGATTTCTACCCCAATGCCtgat > 1:1089593/1‑239 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAAAACAAAAAAT‑GGAGGTGCCCTGATG‑AGCGAAAGTAATAAACAAAAAGCAATGAATAAATTGAAAGAGATTGTTGCTAACTTT‑ACCCCCATGAATTTTACCCCGAAGCCtgat > 1:994363/1‑239 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAAAACAAAAAAT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGGAAGTAATAAACAAAAAGCAGTGAATAAATTTACAAAGATTGTTGCTAACATT‑ACCGCCATGATTTTTACCCGAATGCCTGGTGACgt > 1:374205/1‑239 (MQ=255) atatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAATACAAAAAAT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGGAAGTAATAAACAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ATCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGtggggg > 1:553213/1‑239 (MQ=255) ttttaatttTTATTATCGGTTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCGTGGGGGAAAAAAAAAAAAAACCACATTTTTGGGTGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTCCC‑AGAAAAATAAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:1037681/234‑1 (MQ=255) tattatttcTTATTTTGACTTTAATTCACAAACTGTTAATTAAATATTCGGGGGGCAAAAAAAAAAAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAATTTTTTCA‑AAAAAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCTTGAGG‑AGCGAAATTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGATATTGTCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:526835/233‑1 (MQ=255) aattcattcTTATTTTCGTGTTGATTCACAACGTGTTAATTAAATATTCCCGGGGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTTAAGTGGAAGTTTGTGGGGGTGAATTTTCCA‑AGACAAAAAAAAAAACT‑GGAGTGGCCAGGAGG‑AGCAAAAGTAAAAAGCAAAAGCAGGTAAATAATTTAAAAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:1225991/238‑1 (MQ=255) cTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATGCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AAACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaa < 1:877032/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGGGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTAAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:1166046/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTCCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:724782/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTA‑AAACAAATACAAAAAAT‑GGAGGTTGCATGGTG‑GGAGAAAGTAAATAGCAACAAGAAGAGAATAAGATGACAGAGATTGTAGCTCAATTT‑AACGCAACGGATTTTAAACGAATGCCTGATATAGCGGTGAGGAAACTaaaa > 2:686417/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGCGAATATTTTT‑CGAAAAAAAAAAAAAAA‑GTAGGTGTCATGATG‑AGCGGAAATAATAAAAAACAAACAGGGAAAAAAAAGACAGAGAATGTCGCTAAATTT‑TACGACATAATTTTTACCCCAATGCCTGAGTACGAGGGGGGGAAACTaaaa > 2:697045/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTGGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATAAAAAAACG‑GGAGTTGCAAGGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGAGAATAAGTTGAAAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:980562/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTAATTCACGAATTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGTGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGGGATTTTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:901204/239‑1 (MQ=255) gcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑ATACAAAAAAAAAAACT‑TGAGTTGCCCTGATG‑AGCGAAAGTAATAAACAACAAGCAGTGAATAAATTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTTTAACCCAATGCCTGATTACGTGGGGGGTAAACTACAACAACTaa > 1:459662/1‑239 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAAATTTTTCC‑AGACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAAcgtcgt < 1:1046637/239‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGAt < 1:420869/174‑1 (MQ=255) ttACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGAt < 1:972372/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTT‑AAACAAAAACAAAAAAT‑TGAGTTTCCCTGATT‑AGCGAAAGTAATAAACAACAAGCAATGAATAAAATGAAAGAGAATGTTGCCAACTTT‑ACCCCCCACATTTTTTACCCCATGCCTGATGACGTGGTGGGTAAACTAAAAAAAACAAAAGATGCCCGAACGCCGTCGGTgggg > 2:9497/1‑239 (MQ=255) ttttaagggTGGAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGAGGTGAATTTTTCA‑AGAAAAAAAAAAAAACG‑GGAGTTGCAATGATG‑AGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAGGTTGACAGAGATTGTGGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:618666/232‑1 (MQ=255) tatTCCCGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:593341/239‑1 (MQ=255) tatTCAGGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGAAAAATACAAAACCT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:559706/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGAAAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGAAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1193615/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTC‑AGACAAATACAAAAAATGGGAGTTG‑CATGGTG‑GGCGGAAGGAATAAGCAAAAAGCAGTGAAAAAATTGACAAAGATTGTCGCTAAATTT‑TACGCCCTGAATTCTAACCCAATGCCTTATGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAACTAAAAGAAGCCCAAAAGTACTCGATggggga > 1:789931/1‑237 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGATTTTTTC‑AGACAAATACAAAAAAA‑GGAGTTGGCATTATT‑GGCGAAAGAAAAAAGCAACAAGCAGTGAATAAATTTACAGAAAATGTCGCTAACTTT‑ACCCCCACGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGGTAAACTAAAACAACCAAAAGATGCCGAAACACCGTCGCTGGGGgaaa > 1:1128967/1‑239 (MQ=255) tCACGGGGAAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTGAATTTTTCC‑TGAAAAAAAAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTCGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGaaaa < 2:803893/239‑1 (MQ=255) aCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTC‑AGACAAAAAAAAAAACT‑TGAGGTGTCCTGGTG‑GGCGAAAGTAAAAAGAAACAGACAGAGAATAAGTTGACAGAGAGTGTCGGTAAATTT‑ACCGCCCTGATTTCTACCCGAATACCTGATTAAGTGGTGGTTAAACTAAAACAACTAAAGAATGACGAAACGTCGTCGGGGGGGgaaaat > 2:162693/1‑237 (MQ=255) aCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTC‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑GGGGGTGGCATGAGG‑AGCGGAAGAAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAAATGAAAGAGATTGTTGCTAACTTT‑ACAGCCAGGATTTCTTCCAGAATGACGGGTGAGGGGGGGGGTAAAATAAAAAAACTAAAAGATGCCGAAAAACGGTCGGTGGGGgaaaat > 2:947587/1‑237 (MQ=255) gtgaaaaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTAAATTTTCCC‑AGACAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGGCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 1:697045/231‑1 (MQ=255) gTGGCAAAAAATATAAAACCCCATTTTTAGTGTTATTTTGGGGCGGTGAATTTTTCC‑AGCAAAATAAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:352262/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGCGGTGAATTTTTCA‑AAAAAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGTAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1210753/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAAAAAACCCACATTTTAGGTGGGAGTTGGTGGGGGAAAATTTTCAC‑AGACAAATAAAAAAAGT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAATAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTAACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:355353/238‑1 (MQ=255) gaaaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTCCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:462259/182‑1 (MQ=255) aaaaTTTAAACCCACATTTTTTGT‑GTTGTTTGTTGGGGGGAATTTTTCCAAAAAAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑GTCGAAAGATATAAGCAACAGCCGTTGAAAAAGTAGACAGGTATTGTAGTTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:965279/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCAGAGTAATAGTGTTGTTTTTGGGCGATGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACG‑GAAGTAGCAATGATG‑ACGAAAAGTAATAGGAAACGGGCAGTCAATAATTTGACGGAGTTTGTGTAAAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:48150/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:162693/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACAGTTTTGTTGGTAGTTTGTGG‑GGTGAAATTTTCCAAGACAAATAAAAAACCT‑GGGGTTGCTATGATG‑AGCGAAAGAAATACGCAACAGGGGGTAAATAAGTTGACAGGGATTGTCTATAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1158443/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTGAATTTTTCA‑AAACAAAAACAAAAACT‑GGAGTTGCAATGATG‑AGCGAAAGAAAAAAGAAACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAGTTTGTCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1223418/239‑1 (MQ=255) ccACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTCCC‑AGACAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGAGG‑AGCAAAAATAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGATAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGac < 1:7546/239‑1 (MQ=255) atttgttgGGGGTGAATTGTTCC‑AGACAATTACAAAAACA‑GGAGTTGCCATAATG‑AGGTAAAGTAATAAGCAACAGGCAGGAAATAAGTTGACAGGTATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:452729/233‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:660806/239‑1 (MQ=255) gTTTGTGGGGGTGAATTTCACG‑AAACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCAAGATG‑AGCAAAAGAAATAAACAAGGGGCGTTGAAAAAGTGAACAGATATTGTCGATACTTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:14921/238‑1 (MQ=255) gTTTGTGGCTGTAAATTTTTCA‑AAAAAAAAAAAAAACCT‑GGAGTGGCCATGAGA‑TGCAAAAGAAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGTTTGTCGTTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:1089593/238‑1 (MQ=255) gtgGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:1037511/239‑1 (MQ=255) tgGCGTTAAATTTTTCA‑AAAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCAAGATG‑AGAGAAAGAAATAAGCAACGGGCAGTGAATAAGTGGAAGGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:459662/238‑1 (MQ=255) tgGCGGAAAATTTTGAC‑AGAAAAATACAAAAACT‑GAAGGGGCAATGATG‑AGCGAAAAAAATAAGCAAAAGGCGTTGAATAAGTGGAAAGAAAGTGTCGAAACCTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGGCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:712962/238‑1 (MQ=255) ggggggtaattttttCC‑AACAAAAAACAAAAACG‑GGAGTGGCCATGATG‑GGCGAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:389799/228‑1 (MQ=255) tttttCC‑AGAAAAAAAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGAAAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcc < 1:376748/239‑1 (MQ=255) ttccc‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTGGCCATGATG‑AGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAAATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:1136401/236‑1 (MQ=255) ttacaaaaaaaaacaaaaacG‑GGGTTTGCCATGGAA‑GGCAAAAGAAAAAAACAAAAGGCAGTGAATAAGTTGAAAGAGATTGGCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgc < 2:847286/231‑1 (MQ=255) tCC‑AGAAAAATAAAAAAACT‑GGATTTCCAATGATG‑AGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGATAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 1:244049/239‑1 (MQ=255) aGAAAAAAACAAAAATT‑GGAGTTGCCAAGATG‑AGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGAAGTGAAAAAGTTGACAGAGATTTGCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTTCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGt < 1:817651/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaaCT‑GGAGTTGCCAGGAGG‑GGCAAAAGAAAAAAGAAAGAGGCAGAAAATAAGTTGAAAGAGATTGTCGTAAATTTA‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGa < 2:414315/234‑1 (MQ=255) aCAAAAACG‑GGAGTGGCCATTATG‑AGCGAAAGTAAAAAGCACGAGTGAGTGAATAATTTGACAGATATTGTCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGacac < 2:1000215/239‑1 (MQ=255) aaaaaGT‑GGAGTTTCCATGAGG‑AGAGAAAGTAAAAACCAAAAGTGAGTAAATAAGTTGACAAAGGTTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCg < 2:1150314/239‑1 (MQ=255) aaaaCT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 1:9497/239‑1 (MQ=255) aaaCT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCggg > 1:850849/1‑239 (MQ=255) aaCT‑GGGGTGGCAATGATG‑AGCAAAAGAAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:513028/239‑1 (MQ=255) aaCT‑GGATTTGCCATAATG‑AGCAAAAGCAAAAAGCAACAGCATTTCAATAAGTTAAAAGAGATTGTCGTTAGTTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTTATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGTAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTCCCAGCCGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:732324/239‑1 (MQ=255) actgggAGTTGCCAGGAAG‑AGCGAAAGTAATAAGCAAAAGGGAGTAAATAAGTGGACAGAGATTGCCCTTATCTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:553213/235‑1 (MQ=255) ggAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAt > 2:1115850/1‑239 (MQ=255) aGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTa > 2:992747/1‑239 (MQ=255) gatg‑aGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCg > 2:354023/1‑239 (MQ=255) aaaGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGt < 1:411796/238‑1 (MQ=255) aaaGTAATAACCAAAAGCAAGGAAGTAGGTTG‑CAGGGATTGTTGGTAAATTTCGCCGCCCTGATTTCTACCCGAAGGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTCCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGCCCTGAATCGTCCTGCCTTTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAg < 2:903565/237‑1 (MQ=255) aaGTAATAAGCAACAGGAAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTACCTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGt < 2:789931/237‑1 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 1:778183/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 1:740291/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTcc > 1:1122123/1‑238 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTcc > 2:1214963/1‑238 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTACTCGTTAAAGTCGGCTCCCGCTTcc > 2:642957/1‑238 (MQ=255) | TTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCC‑AGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑AGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206249‑3206725 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |