New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 166404 = | 76 (1.310) | 5 (0.090) | 3/502 | NT | 7.1% | coding (1675/2535 nt) | mrcB | fused glycosyl transferase and transpeptidase |
? | NC_000913 | 166643 = | 58 (1.030) | coding (1914/2535 nt) | mrcB | fused glycosyl transferase and transpeptidase |
AGCGTAAGTTGAGCGATCTTGAAACTGCGATTGTGGTCGTCGACCGCTTTAGTGGTGAAGTTCGTGCGATGGTCGGAGGTTCTGAGCCGCAGTTTGCGGGCTACAACCGTGCGATGCAGGCGCGTCGTTCGATTGGTTCCCTTGCAAAACCAGCGACTTATCTGACGGCCTTAAGCCAGCCGAAAATCTATCGTCTGAATACGTGGATTGCGGATGCGCCAATTGCGCTGCGTCAGCCGAATGGCCAGGTCTGGTCACCGCAGAATGATGACCGTCGTTATAGCGAAAGCGGCAGAGTGATGCTGGTGGATGCGTTGACCCGTTCGATGAACGTGCCGACGGTAAATCTGGGGATGGCGCTGGGGCTGCCTGCGGTTACGGAGACCTGGATTAAACTGGGCGTACCGAAAGATCAGTTGCATCCGGTTCCGGCAATGCTGCTGGGGGCGTTGAACTTAACGCCAATCGAAGTGGCGCAGGCATTCCAGACCATCGCCAGCGGTGGTAACCGTGCACCGCTTTCTGCGCTGCGTTCGGTAATCGCGGAAGATGGCAAAGTG > NC_000913/166120‑166679 | gtttggtcggctggttgttatcacggccgacccaggtgatggtcaccgtgctgccgtcaatgcccgcaaaccaggtatctacgttattgttggtagtccctgttttccctgccagatgcaggttcgggtatttcgccccaagctgacgacccgtaccgcgttgtaccacctgctgcatggtccatagtgtcagatacgccgcctgcgccggaacagcgcgttccgcctgcgggaagctctgatacagcactttgccatcttccgcgattaccgaacgcagcgcaGaaa < 2:263181‑M1/4‑1 (MQ=255) aGCGTAAGTTGAGCGATCTTGAAACTGCGATTGTGGTCGTCGACCGCTTTAGTGGTGAAGTTCGTGCGATGGTCGGAGGTTCTGAGCCGCAGTTTGCGGGCTACAACCGTGCGATGCAGGCGCGTCGTTCGATTGGTTCCCTTGCAAAACCAGCGACTTATCTGACGGCCTTAAGCCAGCCGAAAATCTATCGTCTGAATACGTGGATTGCGGATGCGCCAATTGCGCTGCGTCAGCCGAATGGCCAGGTCTGGTCACCGCAGAATGATGACCGTCGTTATAGCGaaa > 1:220571/1‑288 (MQ=255) gCGTAAGTTGAGCGATCTTGAAACTGCGATTGTGGTCGTCGACCGCTTTAGTGGTGAAGTTCGTGCGATGGTCGGAGGTTCTGAGCCGCAGTTTGCGGGCTACAACCGTGCGATGCAGGCGCGTCGTTCGATTGGTTCCCTTGCAAAACCAGCGACTTATCTGACGGCCTTAAGCCAGCCGAAAATCTATCGTCTGAATACGTGGATTGCGGATGCGCCAATTGCGCTGCGTCAGCCGAATGGCCAGGTCTGGTCACCGCAGAATGATGACCGTCGTTATAGCGAAAGc > 1:218916/1‑289 (MQ=255) gTAAGTTGAGCGATCTTGAAACTGCGATTGTGGTCGTCGACCGCTTTAGTGGTGAAGTTCGTGCGATGGTCGGAGGTTCTGAGCCGCAGTTTGCGGGCTACAACCGTGCGATGCAGGCGCGTCGTTCGATTGGTTCCCTTGCAAAACCAGCGACTTATCTGACGGCCTTAAGCCAGCCGAAAATCTATCGTCTGAATACGTGGATTGCGGATGCGCCAATTGCGCTGCGTCAGCCGAATGGCCAGGTCTGGTCACCGCAGAATGATGACCGTCGTTATAGCGAAAg < 1:527395/286‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |