| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1396498 = | NA (NA) | 5 (0.080) +CGC |
4/278 | 8.6 | 7.2% | noncoding (455/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1428369 | 66 (1.080) | noncoding (426/1196 nt) | IS5 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCG > NC_000913/1428227‑1428508 | gTCTGATGCCGCTCCGGGTCGCGGTGCTGCTCTTTGTTCTGGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACACCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTg < 2:635947/143‑1 (MQ=14) tCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGCTGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCGGCGATTGATGGTCTTGAACAATCGa > 2:146232/1‑143 (MQ=255) tGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGCACAATTGACg > 1:874202/1‑143 (MQ=255) gATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGGTTGGTGGAATTGAACAGTTGACgg > 2:761936/1‑143 (MQ=14) ggCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGc < 1:578500/142‑1 (MQ=255) gCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGCCGGGcc > 1:634874/1‑143 (MQ=255) tctcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCACTGATGGT‑GGCATCCACCACAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCCGGCCAGt > 1:481876/1‑143 (MQ=255) ctcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAggt > 2:65592/1‑141 (MQ=255) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTGGTGGTAGAGCGGGGTGCCGCGAGGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTg < 1:474526/143‑1 (MQ=14) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTg > 1:432458/1‑143 (MQ=255) aTCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGAtgct > 1:494350/1‑143 (MQ=255) gcgTGGCTGCTCTGTGTTCGTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAGTG‑TGTTGGGCATCCACCAAAGTGCCCTGGGGCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATgctgct < 2:661258/143‑1 (MQ=14) cgTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGGGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTc < 1:491814/143‑1 (MQ=255) gctgctCTTGGTTCTGCGTCCAGCTGGGTGCCTCAATGATGGG‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGc < 2:990684/143‑1 (MQ=14) ctctTAGCTCTTGGCAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGt < 1:986455/143‑1 (MQ=255) tctTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTg > 1:376478/1‑143 (MQ=255) ttcgTTCTTGGTAGCTCTGGGTGTCTCAATGATGGT‑GGCATCCTCCAAATTGCCTTTGGTCATCTTGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGc < 1:308846/140‑1 (MQ=14) tCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGaaa > 1:948848/1‑143 (MQ=255) cTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATCGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAAt < 2:422883/143‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCGTGACGCCTGCTGCGGCCAGCCCGCGATTGATGGTCTTGAACAAGTGGCGGGCCAGTTGATGGTGGTCGAGCAGGTGGCGGaaact > 1:1065828/1‑141 (MQ=14) ttGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTTATGGTCTTGAACAATTGACGGAGCAGTTGATGCTGCTCAAACAGGTAGCGGacagt > 1:148348/1‑139 (MQ=14) ttGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCGTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGACCAGGCGGCGGAAAtt > 2:552474/1‑143 (MQ=255) ttGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGAT‑GGCATCCACCAAAATGCATTGGGTCATCATGACGCATGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGAAGACGCTCGAGCAGATGGcagcaaat > 2:22951/1‑136 (MQ=14) cTGGGTGCCTCAATGCTGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGCTGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGCCGATGCTGCCCGAGCAGGTGGCGCACATC‑CATGAtggt > 2:253370/1‑143 (MQ=14) gTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGgtggtg < 1:86176/143‑1 (MQ=255) gTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTGGGGTCCTCCTGCCGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGATCAATTGACGGGCCAGTTGATGCTTCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGgtggtg < 1:411385/143‑1 (MQ=14) tgtctctATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGc < 1:1033872/140‑1 (MQ=255) tGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGc > 1:1027558/1‑143 (MQ=255) ccTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGTTTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGACATT‑CATGATGGCGGTGCGa > 2:537592/1‑143 (MQ=255) caaggctggt‑ggCATCCACCTAAGGGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTGCGGCCAGCCAGCGATTGGTGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATcc < 1:1063767/137‑1 (MQ=14) cAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGGTTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGGGCCGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGAGCGAtgc > 2:1060398/1‑141 (MQ=255) cAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGAGTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCGGTTGATGCGGCTGGCGCAGGTGGCGCAATAT‑CATGATGTCGGTGCGAGcc > 2:173757/1‑143 (MQ=14) aaTGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCg > 2:407388/1‑143 (MQ=255) aaTGAGGGT‑GGCATCTATTTATGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCTAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CCGGACGGTGGCGCGACCCg > 2:797650/1‑143 (MQ=14) atgatgGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCgg < 1:482930/143‑1 (MQ=255) t‑ggCCTCCATCAGAGTGCCTTGGGTCATCATGCCGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGgcg < 2:198823/143‑1 (MQ=255) t‑ggCATCCCCCACAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGTAGGgcg < 2:756591/143‑1 (MQ=255) t‑ggCATCCCCCACAGTGCCTGGGGGCATCATGACGCCTGCTTCGGCCCGCCAGCGCTTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGgcg < 2:828431/143‑1 (MQ=17) t‑ggCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCTGCTATTGATTGTCTTTATCAATTGACGGGCCAGGTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGgcg < 1:195300/143‑1 (MQ=17) accgAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAg < 1:568932/143‑1 (MQ=255) cccaaGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAgg < 1:69437/140‑1 (MQ=255) ccacactGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCGAGCGATTGGTGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAgg < 2:691165/137‑1 (MQ=255) ctgggggCATCATGCCGCCGGCTTCGGGCAGCGAGCGATTGGTGGTCTTGAACAAGTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCgg < 2:461279/140‑1 (MQ=14) cTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCgg < 2:249308/143‑1 (MQ=255) ttGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGAGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CCTGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATCATCgtg > 2:675638/1‑141 (MQ=255) gggTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGCCCAGTCCCTGCTCCTCGAGCAGGGCGCGGAAATT‑CATGCTGGCGGTGCGAGCCGGCACGGCGCCACCCAGCGATaacagtgac > 2:16527/1‑136 (MQ=11) atGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAAAAGgcg > 2:723801/1‑143 (MQ=255) ctacTTCGGCCAGCCAGCGAGTGAGGGTCTGGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAg < 1:71562/140‑1 (MQ=255) gCTTCCGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGTTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGc < 1:534020/143‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTGGGACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCg < 2:799181/143‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAATAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGCAATT‑CATGATGGTGGTGCGATTAGGTTGGAACCTAGCCAGGGCTAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGa > 1:1101898/1‑143 (MQ=14) tCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGTACAATTGACGGGCCTGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGAt < 1:761936/143‑1 (MQ=255) ggCCAGCCGGCGACTGATGGTCTTGAACAATTGCCGGGCTAGTTGATGCTGCCCGAGCATGTGGCGGAAACT‑CATGCTGGTCGTGCGATCCGGCAGGTCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGAttt < 2:34766/143‑1 (MQ=255) ggCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACCATTGCCGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAACT‑GCGGAAATTGCTTTTGGGCGGTGCTACCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGAttt < 1:256703/143‑1 (MQ=14) agcgtgcGATTGATCGTCTTCAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTa < 1:146232/138‑1 (MQ=255) agccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGCAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCgaa > 1:89756/1‑141 (MQ=255) gccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGAAGCGAAACTTTATTCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTAc < 1:562399/143‑1 (MQ=17) ccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAACCAGGCGCATGGAGGCGATGTCGTACa > 1:198086/1‑143 (MQ=255) cagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGAGTTCGTACAg > 2:393783/1‑143 (MQ=255) aTGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCACACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTc > 2:200947/1‑143 (MQ=255) aTGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CAGGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATGTCGTACAGGGCATCTTc > 1:895148/1‑143 (MQ=255) tGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGAGGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCACCCACGCGCATGGAGGCCATGTCGTACAGGGCAGCCTcc > 2:159420/1‑143 (MQ=17) ggggttGAACGGTTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAAGT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAAGCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCa < 2:792852/139‑1 (MQ=14) ggTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCCTGGAGGCGCTTTCGTAGAGGGCAGCTTCCa > 1:388459/1‑143 (MQ=255) ggTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCa > 1:464156/1‑143 (MQ=255) gcgccaaCAATGGCCGGGCCAGCCTAAGCTGCTCGAGCAGGGGGCGCAAACT‑CATGATGGTGGAGCACAGCTGCAGGTCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACCGGCGCATGTCGGCGATTTCGTACACGGCATCTTCCATg < 2:904487/138‑1 (MQ=255) cTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATgg < 2:494350/143‑1 (MQ=255) aaTTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGAATCTTCCATGGCACCGTc > 1:284466/1‑143 (MQ=255) cttGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCg < 1:667276/142‑1 (MQ=255) | GTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGT‑GGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT‑CATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCG > NC_000913/1428227‑1428508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |