| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,937,136 | IS2 (–) +5 bp | coding (485‑489/870 nt) | yebK → | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 48 (1.120) | 42/284 | 0.1 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1937140 | 0 (0.000) | coding (489/870 nt) | yebK | putative DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1937136 = | 0 (0.000) | 59 (1.380) | 50/284 | 0.0 | 100% | coding (485/870 nt) | yebK | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCAT > NC_000913/2070134‑2070409 | tgtgtgGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAACACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGGGATTCAGGGGGCCAGTCTGGTGGc > 1:361049/1‑143 (MQ=12) tgtgGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGAATAGTCTAAAAAATAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGCGATTCAGGGGGCCAGTATAGTGGCGa > 2:500867/1‑143 (MQ=255) ggTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATTTTGTTTGTCTGAAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGTGAAGc > 1:99800/1‑143 (MQ=255) cGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAGGCATCCTCCCGCGtt > 2:712670/1‑143 (MQ=255) gTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGttt > 1:385886/1‑143 (MQ=255) tgctcCGGCCCTAAGACATCAAGTATCTGTTCGCCACTGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTa < 2:536421/141‑1 (MQ=255) tcCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGGATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAAtt < 2:645746/143‑1 (MQ=255) cgtcccTAAGTCATCAATCTTCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATGTAAGTTATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTCGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATtct < 2:576561/140‑1 (MQ=17) cATTAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAGACTAGTATTAAGACTATCACTTACTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTc < 2:263599/143‑1 (MQ=255) cATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTc < 2:564974/143‑1 (MQ=255) atcaatcaTCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTATTTCTCATTGATGGTCa > 1:649900/1‑143 (MQ=255) caatcaTCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCagg < 1:721196/143‑1 (MQ=255) atcTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTATTTATCATTGGTGGTCAGGAGGtc > 2:238047/1‑142 (MQ=255) tcTGTTCTCCAATGACTAATCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTTCTATTTGTTGTCTGGAGATTCAGTGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTACTTCTCATCGAGGGTCAGGCGGTaa > 1:387134/1‑143 (MQ=18) tGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATGGATGGTCAGGAGGTAACt > 1:40829/1‑143 (MQ=255) ttCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTGAGGAGGTAACTTa > 1:762641/1‑143 (MQ=255) ttCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTa > 2:737536/1‑143 (MQ=255) ctcCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATc < 2:488717/143‑1 (MQ=255) gccAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGAGTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCa < 1:579546/142‑1 (MQ=255) ccAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCACTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTCTTAATTCTCATTTATGGTCAGGAGGTAACTTATCAg > 2:670261/1‑143 (MQ=255) cAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGCTATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAgc > 1:780762/1‑143 (MQ=255) attattCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCTCTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGTGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGTTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGcc < 2:559998/138‑1 (MQ=255) cTAGTCTACAAAGTAGGATTAAGACTATCACTTATTGAAGTGAGATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCg < 2:461527/143‑1 (MQ=25) cTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCg < 2:528314/143‑1 (MQ=255) tAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATa > 1:453761/1‑143 (MQ=255) tAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATa > 1:165973/1‑143 (MQ=255) aaaaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGCTTCAGCGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATaa > 1:740942/1‑143 (MQ=255) aaaaaCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATaa < 1:201143/143‑1 (MQ=255) aCTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTAt < 1:462922/143‑1 (MQ=255) tATTAAGACTATCACTTATTTACGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGTCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGgtgt < 2:167816/143‑1 (MQ=255) gttAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGtgtg < 2:139705/142‑1 (MQ=255) ttAAGACTATTACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTgg < 2:651024/143‑1 (MQ=255) cTATCACTTATTTAAGTGATATTGGCTGACGAGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGTATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGt < 1:394806/143‑1 (MQ=38) tATCACTGATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGtt < 1:442166/143‑1 (MQ=255) cACTTATTCAAGTGATAGTGCTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGAt < 1:154860/143‑1 (MQ=255) aCTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATACTTATGGTGTGGGACTGTTGCTa > 2:172784/1‑143 (MQ=255) aCTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATa < 1:603998/143‑1 (MQ=255) aCTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATa > 1:497491/1‑143 (MQ=255) aCTTAGTGAAGTGATATTGGTTGTCCGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATa < 1:64600/143‑1 (MQ=255) tttAAGTGGTATTGGTTGTCTGGAGCGTCAGGGGGCTAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGa < 2:103109/143‑1 (MQ=255) tttAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGa > 1:362743/1‑143 (MQ=255) ttAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAg > 1:676318/1‑143 (MQ=255) tGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTgc > 2:600667/1‑143 (MQ=255) tGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTgc > 1:2630/1‑143 (MQ=255) cTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGACGGAACGAATCACGTGGGGGGACTGTAGATAGATGAGGGTGCGCTGGGGCgtggt > 2:760704/1‑141 (MQ=255) tGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGGGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGAGAGGGACTGTTGATAGAGGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTg > 2:243644/1‑143 (MQ=255) tGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTg < 1:85299/143‑1 (MQ=255) gagaTTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTGTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGGTGGAGCGTGTTGAg > 2:773493/1‑143 (MQ=255) 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gggCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTGGTGACAg > 1:344313/1‑143 (MQ=255) gCCAGTCTAGTGGCGAAGCAGCCTCCCGTGTTTTAATTGTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATTGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGt < 1:510496/143‑1 (MQ=255) ccAGTCTAGTGGCGACGCATCCTCCCGTGTCTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTAGGGCGTGCGTCTGCTGTTAGATCTGTTTTCGCGGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTc < 1:148494/143‑1 (MQ=255) cAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGCTGCTAGCTGCGTCTGCGCTCGAGCGTGCTGAGGTAGTGCAAGGtac > 1:123354/1‑141 (MQ=255) cAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGGGTGGGACTGTTGATAGATGCGTCTGCGCTGGAGCGTGCTGCGGGACTGAGAGGGcc > 1:123413/1‑143 (MQ=255) gTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTGCTGTTCATTAAGGGAGAGGAGGTAACTTATCAGCGGTCCCGAGATAATCACGCGAAAGAACCGTAGAGACATGACACCGCGCTGGAGCGTGGAGAGGTAGGTAAAGGtgcct > 2:593424/1‑139 (MQ=255) | TGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCAT > NC_000913/2070134‑2070409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |