| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3815859 | 3815940 | 82 | 49 [0] | [0] 49 | [rph]–[rph] | [rph],[rph] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3815858 | 0 (0.000) | 46 (0.940) | 38/264 | 0.3 | 100% | pseudogene (24/48 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
| ? | NC_000913 | 3815941 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH | |||||
AAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCC > NC_000913/3815803‑3816080 | ctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcctacttttcgacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttccgccagcc > 2:431617‑M2/139‑139 (MQ=255) gcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctccacctcttacacatcaacagacaaaaaaaaagcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgcccccttctgcCGTcccc > 1:632265‑M2/137‑143 (MQ=255) taagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgcggccttcggcCGTCCCCTGCCCt > 1:594000‑M2/131‑143 (MQ=255) taagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtagccttaaaaatcagtttgccagagcagccttctgcCGTCCCATGCACt > 1:414129‑M2/131‑143 (MQ=255) aagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACtt < 1:763498‑M2/14‑1 (MQ=255) aagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACtt > 2:390152‑M2/130‑143 (MQ=255) caaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatg < 1:74907‑M2/19‑1 (MQ=255) aaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttacaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGCTCCACGCACATCAatga > 2:95443‑M2/124‑143 (MQ=255) aattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcaccttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGGCCCCTGCACTTCAatgat < 2:118864‑M2/21‑1 (MQ=255) tcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccctaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGGCCCCTGCACTTCAGTGATgcg > 1:309175‑M2/120‑143 (MQ=255) tcaataaactgacgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgacgtacaaatcaagttgccagagcacccttccgcCCTCCCCTACCCTTCAATGAtgca > 2:9213‑M2/120‑142 (MQ=255) taaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagattgccagcgccgccttctgcCGTCCCCCGCACTTCAACGACGCgcccc > 2:146053‑M2/116‑142 (MQ=255) aactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTc > 2:208902‑M2/114‑143 (MQ=255) tggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGCCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTc > 2:895059‑M2/111‑143 (MQ=255) 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gttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaaccagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGt < 2:145317‑M2/47‑1 (MQ=255) tcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTc > 1:106794‑M2/95‑143 (MQ=255) ctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtagcattaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGGCTGTGc > 1:264629‑M2/81‑143 (MQ=255) tcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCg < 1:876607‑M2/64‑1 (MQ=255) ttgcttttcttcagacaaaaaaaaggcggctcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCaga < 2:755420‑M2/69‑1 (MQ=255) ttactttgctacagacaaaaaaaaggcgactgatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCaga < 2:208722‑M2/69‑1 (MQ=255) tacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcAGTCCACTGCACTGCAATGCTGCGCCCGTCTTCGATCACCACTCCGTCCATGTCGGtgtccgccgcccgg > 2:172398‑M2/74‑139 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCt > 1:749025‑M2/71‑143 (MQ=255) ttttgacagacaaaaaaaaggcgcctcaccagtcgccttaaaagccagcttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCtt < 2:761044‑M2/74‑1 (MQ=255) tacagacaaaaaaaaggcgactcatcggtcgccttaaaaaccagtgtgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAAc < 1:87818‑M2/78‑1 (MQ=255) 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aaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCCCTACGCTCACGTCGCTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTCTTCcac > 2:173423‑M2/57‑142 (MQ=255) aaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATc < 1:501775‑M2/90‑1 (MQ=255) ctcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccggcgccgccttctgcCGTCCCCTGCGCTTCAATGATGCGCCCGTCTGCGGGCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCCAACCg > 1:524078‑M2/46‑143 (MQ=255) gtcgccttaaaaatgggtttgccagcgccgccttctgcCGGCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGcc < 2:220206‑M2/105‑1 (MQ=255) tcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCCTGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGCTCGTAAgacgcttgcccg > 1:845086‑M2/38‑138 (MQ=255) tcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCg > 1:620096‑M2/38‑143 (MQ=255) ccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTc > 1:160617‑M2/35‑143 (MQ=255) ttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCTCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTcac > 2:314701‑M2/33‑143 (MQ=255) cgttttggcagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGAGGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGTCGTTCACAATTTcgt < 2:936672‑M2/119‑2 (MQ=255) agtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGCTCACTGCGACAGAGTCTTCAACGTATTGCAGATCGCAAACCGCGTCGCCGTTCTCAATCCAGAc > 2:827632‑M2/24‑143 (MQ=255) cgccgccttctgcCGGCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCg < 1:390152‑M2/130‑1 (MQ=255) gccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTTCCTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCgg < 2:571981‑M2/131‑1 (MQ=255) cgttctggCGTCTCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCCGTGTGTAGCAATACGATCATGTCGGTCTTTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTAc < 2:197967‑M2/135‑1 (MQ=255) ttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGGATTCACAAACGCAGACCGCTTCGCCGCTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTaccc > 1:439123‑M2/7‑142 (MQ=255) tgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATcc > 1:35580‑M2/4‑143 (MQ=255) | AAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCC > NC_000913/3815803‑3816080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |