Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,115,218 | T→C | 10.5% | E121G (GAG→GGG) | glpX ← | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,115,218 | 0 | T | C | 10.5% | 263.3 / 2.6 | 108 | E121G (GAG→GGG) | glpX | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/44); new base C (2/11); total (53/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.55e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGTCTGGCATACAGGTGAGAATTGAGGCCGCAACGTCGCCGTCCGGAATAGCAAATACGCGTACGCCGAGTTGCTGCATTTCAGCGATAACGGCATCGT‑GGCG‑TGGTTTAGCCAGAATCGTTACCGTCAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAG‑CGCCGCC‑GCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGATTTCACCTTCACCAATGACGATGGTGCCGTCAATGTTGACCTGGTTGAGCATAA > NC_000913/4114982‑4115455 | tGTCTGGCATACAGGTGAGAATTGAGGCCGCAACGTCGCCGTCCGGAATAGCAAATACGCGTACGCCGAGTTGCTGCATTTCAGCGATAACGGCATCGT‑GGCG‑TGGTTTAGCCAGAATCGTTACCGTCAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAG‑CGCCGCC‑GCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTcc < 2:333247/239‑1 (MQ=255) 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tCTGGCATACAGGTGAGAATTGAGGCCGCAACGTCGCCGTCCGGAATAGCAAATACGCGTACGCCGAGTGGCTGCATTTCAGCGATAACGGCATCGT‑GGCG‑TGGTTTAGCCAGAATCGTTACCGTCAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAG‑CGCCGCC‑GCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCa < 2:29204/238‑1 (MQ=255) cATACAGGTGAGAATTGAGGCCGCAACGTCGCCGTCCGGAATAGCAAATACGCGTACGCCGAGTTGCTGCATTTCAGCGATAACGGCATCGT‑GGCG‑TGGTTTAGCCAGAATCGTTACCGTCAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAG‑CGCCGCC‑GCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACa > 1:103405/1‑239 (MQ=255) aGGTGAGAATTGAGGCCGCAACGTCGCCGTCCGGAATAGCAAATACGCGTACGCCGAGTTGCTGCATTTCAGCGATAACGGCATCGT‑GGCG‑TGGTTTAGCCAGAATCGTTACCGTCAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAG‑CGCCGCC‑GCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGCTCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATcc > 1:1049372/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |