| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 224395 | NA (NA) | 7 (0.030) | 6/428 | NT | NA | noncoding (625/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | = 224600 | NA (NA) | noncoding (830/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
AATACCGGTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGAC‑‑CGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGA‑CATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCA > NC_000913/224485‑224880 | agtACCGGTGGCGAAGGCGGCGACCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCGGTAAACGATGTAGGGTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTACCGGGGCTAACGCGTTAAGACGAC‑‑CGCCTGGGTAGTACGGCGGCAAGGTTAAAACTCAAATGAGTTGACGGGGGCCCGCACAGGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGGTGCGACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGA‑CATCcaca < 2:943538/286‑1 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ggTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGAC‑‑CGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGA‑CATCCACAGAACtt > 2:574542/1‑288 (MQ=32) ggTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGAC‑‑CGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACGCAAATGAATTAACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGAAACCGGAAGGACCTTACCTGTGCTTTA‑CATCCACAGAACttt > 2:9605/1‑289 (MQ=255) gTGGCGAAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTAAGTCGAC‑‑CGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCCAATGAATTGACGGGGGCCCGCCCAAGCGGCTGAGTATGTGGCTTAATTCGATGCAAAGCGAACAACCGTACCGCGGCTTGACCATCC‑CAGAACtct > 2:1109592/1‑286 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |