| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,526,449 | IS5 (+) +4 bp | 51.3% | intergenic (‑300/‑17) | nudE ← / → yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; Ap3A/Ap2A/ADP‑ribose/NADH hydrolase/putative RcsCDB‑response attenuator, inner membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 110 (0.680) | 72/506 | NT | 54.3% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3526449 = | 91 (0.570) | intergenic (‑300/‑20) | nudE/yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; Ap3A/Ap2A/ADP‑ribose/NADH hydrolase/putative RcsCDB‑response attenuator, inner membrane protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 82 (0.510) | 58/504 | NT | 47.0% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3526452 | 91 (0.580) | intergenic (‑303/‑17) | nudE/yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; Ap3A/Ap2A/ADP‑ribose/NADH hydrolase/putative RcsCDB‑response attenuator, inner membrane protein | |||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATACCCGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCGTCTTTATAATGAAAATGATGCCAAAGCGAACGACAAGGTTGTAGTTTTCACTA > NC_000913/2289826‑2290400 | cGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCATCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCa < 2:152669/289‑1 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |