Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,655,794 | A→G | 5.3% | Y189H (TAC→CAC) | pepB ← | aminopeptidase B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,655,794 | 0 | A | G | 5.3% | 262.1 / 3.7 | 76 | Y189H (TAC→CAC) | pepB | aminopeptidase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/33); new base G (2/2); total (41/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.23e-01 |
CACCAGACGCCCTTCGGCATCAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATTCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTC > NC_000913/2655510‑2656082 | cACCAGACGCCCTTCGGCATCAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGACCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACt > 2:84403/1‑289 (MQ=255) gACGCCCTTCGGCATCAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGgcg > 2:51907/1‑288 (MQ=255) tCGGCATCAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTAt < 1:178749/289‑1 (MQ=255) cAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCCCGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGt > 1:210408/1‑289 (MQ=255) cAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGt < 1:52792/289‑1 (MQ=255) cAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGt > 2:52792/1‑289 (MQ=255) cAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTGCACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCa > 1:474499/1‑288 (MQ=255) cAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTCGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTg < 2:297438/276‑1 (MQ=255) cAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTCGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTg > 1:297438/1‑276 (MQ=255) ttACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTACTCCAGCGCCAGCa > 2:132362/1‑289 (MQ=255) ttGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAgc < 1:495917/276‑1 (MQ=255) ttGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAgc > 2:495917/1‑276 (MQ=255) gCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGga > 2:109728/1‑289 (MQ=255) gATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTGCACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGgaga < 2:474499/289‑1 (MQ=255) gATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGA‑GAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGgaga < 1:508407/288‑1 (MQ=255) atgatATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTg > 1:54695/1‑289 (MQ=255) tatCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGaa < 1:132362/287‑1 (MQ=255) tCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCCGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGCCACGCGTACACTGGCCCCTCTTTACCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCCCCAGCAGTACCGgagacagctccgatccgc > 2:130953/1‑275 (MQ=255) cccAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGt > 1:411554/1‑288 (MQ=255) aGCTTGACCCCATGGCCGCTAATCGGGTTATCCGAACAGCAGAGGAACAGCTTCCCGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGa < 2:311964/289‑1 (MQ=255) gCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCg > 1:372186/1‑287 (MQ=255) cTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCg > 1:464384/1‑286 (MQ=255) aaCGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACt < 1:434437/285‑1 (MQ=255) aaCGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACt > 2:434437/1‑285 (MQ=255) aTTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGGGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGc < 1:445528/289‑1 (MQ=255) aTTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGc < 1:559181/289‑1 (MQ=255) ttgcgcgtAATCAGGTTATCCGGACAGCAAAGGAACAGCTTCAAGGGCGTGTTCGTTCCGCGCGTAATGGCAGATGCCAGCGCCCCGGTAAGCGTTGCCGCGTCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGcc < 2:411554/282‑1 (MQ=255) ttGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGt > 1:255993/1‑224 (MQ=255) 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cagcagAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGGTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTAAACCGCGTCCGACTG‑GTGTCAGCCCCATCTAACCTTGCTCCCCCAGa > 2:462973/1‑288 (MQ=255) gcagAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGGACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAAACTTGCCCACGCAgcttt > 2:12884/1‑285 (MQ=255) cagAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCat > 1:529899/1‑266 (MQ=255) cagAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCat < 2:529899/266‑1 (MQ=255) aggggAACACCTTCCCGCGCTTGTTCAGGCCGCGCGTAATGGCAAAGGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCtt < 2:476584/285‑1 (MQ=255) gagGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATaa > 1:342184/1‑268 (MQ=255) 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cAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGc > 2:126222/1‑253 (MQ=255) cAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGc < 1:126222/253‑1 (MQ=255) gCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTGCACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGt > 1:43787/1‑289 (MQ=255) ttCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTGCACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTg < 2:43787/285‑1 (MQ=255) gcTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGAt < 1:51907/288‑1 (MQ=255) cgcgTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCg > 1:485032/1‑288 (MQ=255) 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acacCGGAGCTTGCTTATCGGCAGTTGGGATGTAAGCCAGCGCCAGCAAGACCGGAGAACGTTCTGGACCGCGTTGGACTGTGTG‑CGGCTCCAGATGACCTTGCTCACGCAGCTCCTCGCCTTTGGGGATCCGATGAGGCACACGAGCGCCCGAGCGGTTGCGGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATTCTTCGGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTGCCTGGCGCTGGGCATCGTc < 2:199978/289‑1 (MQ=255) | CACCAGACGCCCTTCGGCATCAGTGTTCATCACTTCAACTTTTTTACCGTTGCGATAGGTGATGATATCGCCCAGCTTGAACGCATTGCCGCTAATCAGGTTATCCGCACAGCAGAGGAACAGCTTCACGCGCTTGTTCAGTCCGCGCGTAATGGCAAATGCCAGCGCCCCGGTAACCGTTGCCGCGCCGCCCATGTCCGACTTCATCGAGTCCATAAACGCAGTCTGTTTGATGCTGTAGCCGCCGGAGTCAAAAGTGATACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTG‑CAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATTCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTC > NC_000913/2655510‑2656082 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |