| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3992760 | 42 (0.770) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) aaaCTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgc < 1:699584‑M2/143‑3 (MQ=255) aaCTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTAAATTAAAGGTAACAGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTGCCCGCTGCGCTTACCTgca < 1:180904‑M2/143‑4 (MQ=255) aCTGGTGGCGTGGGCATGGTGTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcac > 1:959436‑M2/1‑139 (MQ=255) tggtggCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAACGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGCGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCCTTTCCCCCTGCGCTTCCCTgcgccg < 2:662571‑M2/143‑7 (MQ=255) gtggCGTGGGCATGATTTATCGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcgccgac < 2:872586‑M2/143‑9 (MQ=255) 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> 2:7415‑M2/2‑29 (MQ=255) tCGCACCATTTCCCGCTGCGCTGACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcgctccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgcca > 1:202981‑M2/1‑27 (MQ=255) gCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtgtattcagctggcgtttctttctctgccagt < 2:487968‑M2/143‑119 (MQ=255) gCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTcc < 1:973243/143‑1 (MQ=255) cACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtg < 2:36191‑M2/143‑120 (MQ=255) cACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCg > 1:650611/1‑143 (MQ=255) ccATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgaccccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatc > 2:672857‑M2/1‑22 (MQ=255) ccATTTCCCGCTGCGCGTACCTgcaccgggacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgat > 2:77722‑M2/1‑22 (MQ=255) tttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgcgcagattattcagatggcattaggtcctctgccagtgatccc < 2:257776‑M2/143‑125 (MQ=255) tttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagacggcgtttccttctctgccagtgatccc < 2:257788‑M2/143‑125 (MQ=255) tttCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGGCTGTGGTGTTCCCCAACCAGGCGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGc > 2:748108/1‑143 (MQ=255) ttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaagaaattgacgccttgaaagccgccgcgcgtgaatgcggtccggtacccgatgagccgtttattcagatggcgtatctttctctgtcagtggtccgc < 1:75074‑M2/143‑126 (MQ=255) ttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgttcctccagatggcgcctccttctctccccctgctcccc < 2:186896‑M2/143‑126 (MQ=255) gctgCTGTGGTTACCGGCGCCGACACCGAAGGCGGTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATTAGCCGGCAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTgg < 2:456055/140‑1 (MQ=255) cccGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGCATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGCTTTCCGTAAGCTgg > 1:900079/1‑143 (MQ=255) ccGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGa < 2:655317/143‑1 (MQ=255) ggcgctTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaa > 1:669829‑M2/2‑11 (MQ=255) cgcTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgccgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaa > 1:153181‑M2/1‑9 (MQ=255) cgcTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcaggtggcgtttctttctctgccagtgatcgccgcgctaaaa < 1:960204‑M2/143‑135 (MQ=255) ttACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagctggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaacta < 1:1007817‑M2/143‑138 (MQ=255) ttACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAg > 2:670961/1‑143 (MQ=255) ttcctggaccggcgcggcgcagtcgctgggggcacacattgacgccttgacagccgccgcccgtggatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaa > 2:180904‑M2/3‑5 (MQ=255) cTgcaccgaaacggcgcagtcgctggcggaaaaaattgccgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaacca > 1:2383‑M2/1‑2 (MQ=255) tGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTg < 1:431823/143‑1 (MQ=255) | ATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTG > NC_000913/3992618‑3992902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |