| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3845531 = | 66 (0.880) | 43 (0.610) | 35/264 | 1.3 | 38.7% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
| ? | NC_000913 | = 3992760 | 75 (1.070) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCA > NC_000913/3845389‑3845671 | cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg > 1:1217794/1‑143 (MQ=255) taaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctg < 2:1763‑M1/1‑1 (MQ=255) gtaataTTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGc < 1:1363730/142‑1 (MQ=255) ataataTTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGACGTTACCCATTACCGGGCTGATGAga > 2:337273/1‑142 (MQ=255) ataataTGGTGGGTATCGGTCGCAGTGCGCAACAGAGGGCGCTGTCGGTCAGT‑ACGAGTTGGCAGGAGTGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGc < 1:1353868/143‑1 (MQ=255) aactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgccccatttcccgctgcgcttgcctGCa < 1:1021749‑M1/3‑1 (MQ=255) atatTGTGGTGCTCGGTGGCAGTGCCGAAGAGAGGGCGCGGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCAcc < 1:717765/143‑1 (MQ=255) ggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGa > 2:481228‑M1/137‑143 (MQ=255) gctCGGTCGCAGTGCCGAAGAGAGGGCGCTGGCGGGCAAGCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGgcgc < 1:220410/141‑1 (MQ=255) tCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCAGCGACACGGCGCAg > 1:1164568/1‑143 (MQ=255) tCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCCGATGCGCACAGACACGGCGCAg > 2:398030/1‑143 (MQ=255) ggTCGCAGTGCCGAAGAGGTGTCGCGGGCGGTCGAGCAGGTGAT‑TCGGGATGGCGGCGTGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGAAACGGTGCAGTc < 2:236644/143‑1 (MQ=255) aGTGCGGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCGGTGCGTGGTACGTACCGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGc < 1:488721/143‑1 (MQ=255) aGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATTAGTGGTT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGc < 1:1055739/143‑1 (MQ=255) gggCCGAAGTGATGGCGCTGGCGGTCAAGGAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCg < 2:478045/141‑1 (MQ=255) gTGGCGAAGAGATGGCGCTGGCGCTCCTTCAGCACAT‑GCATTTTGGCGACGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAATTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCg < 1:1285242/143‑1 (MQ=255) gTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCCGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCCGATGCGCACCGACCCGGCGCAGCCGCTGGCg > 2:791087/1‑143 (MQ=255) tcgggctgctgacctcgcccgcccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCgg > 2:838106‑M1/117‑143 (MQ=255) acggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgaaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttccggctgcgcttacgtGAGCCGACACGGCGCCGGCgctggggg < 2:1026943‑M1/27‑4 (MQ=255) 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gTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgc > 2:554455/1‑143 (MQ=255) tCAATCAGGGCAT‑TCGGGATGGAGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACTGCCAGGTACAAGGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgcc < 2:866727/143‑1 (MQ=255) cAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgccgccgc > 1:141815/1‑143 (MQ=255) tatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACCAACTGACGCCATGCAAgccgccgcc < 2:789435‑M1/56‑1 (MQ=255) gTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGGACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGGAAGCCGCGGCCCg > 1:154528/1‑143 (MQ=255) tGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAACGCCGCCGCCCGt 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2:1128746/143‑1 (MQ=255) cTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGGGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTCATTCAGACGGCGTTCCTTTCGCTGcc > 2:1037609/1‑143 (MQ=255) tcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCa < 1:422369‑M1/116‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACCCGGCGCCGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGTCTGCGGTCCGACACCCGACGAGCCGTTTATTCAGCTGGCGTTTGTTTCTCTCCCAg > 2:891707/1‑143 (MQ=255) gcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGt < 1:279325‑M1/118‑1 (MQ=255) gcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCCGCCAGt < 2:758643‑M1/118‑1 (MQ=255) cGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATGCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGccgggg > 1:456721/1‑139 (MQ=255) cGTTACCCATTGCCGAGCTGATGAGCGCCTACGCGGCGCAGTCGATGGCTGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTg < 1:305825/143‑1 (MQ=255) gTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGa > 1:83809/1‑143 (MQ=255) gTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGa < 1:809152/143‑1 (MQ=255) catttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGGGATc < 2:432073‑M1/122‑1 (MQ=255) tttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCCTTGATccc < 1:655465‑M1/124‑1 (MQ=255) tttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGGCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCCGTGATccc < 1:312765‑M1/124‑1 (MQ=255) cccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATccc < 1:1027968/143‑1 (MQ=255) cccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGCTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCcgc < 2:649558‑M1/127‑1 (MQ=255) cccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGGTCATTCAGATGGCGTTCCTTGCTCTGACGGtgatccgagc < 2:1358577‑M1/127‑5 (MQ=255) atcgCCGGGCTGATCAGCACCGACCCGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCcgc < 1:346450/140‑1 (MQ=255) ccGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTa < 1:920788/143‑1 (MQ=255) cGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaa < 1:918530/143‑1 (MQ=255) gcgcttacctGCACGCACACGGCGCAGGCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAACCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaa > 1:575348‑M1/11‑143 (MQ=255) gcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTTGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaa > 2:17337‑M1/11‑143 (MQ=255) ggCTGATGAGCACCGACACGGCGCGGCCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCTGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTGCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaaa < 2:1335863/143‑1 (MQ=255) tgatgaGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGCACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGCTCCCCGCGCTCAAACTa > 2:1033747/1‑143 (MQ=255) gaGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCa < 1:864430/143‑1 (MQ=255) | CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGAT‑TCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCA > NC_000913/3845389‑3845671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |