| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4544926 = | 69 (0.720) | 4 (0.040) | 4/498 | NT | 5.6% | coding (623/726 nt) | fimC | periplasmic chaperone |
| ? | NC_000913 | 4545203 = | 69 (0.740) | coding (108/2637 nt) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher | |||||
ACCGGGAAAGTTTATTCTGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGC > NC_000913/4544644‑4545208 | aCCGGGAAAGTTTATTCTGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAg < 1:217234/286‑1 (MQ=255)aCCGGGAAAGTTTATTCTGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCa < 2:8059/288‑1 (MQ=255) cGGGAAAGTTTATTCTGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACgg > 2:872517/1‑289 (MQ=255) ggAAAGTTTATTCTGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGtt > 1:285430/1‑289 (MQ=255) ttCTGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCtt < 1:9707/289‑1 (MQ=255) tGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTg < 1:732523/289‑1 (MQ=255) cGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGa < 2:107868/289‑1 (MQ=255) cGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGa < 2:285430/289‑1 (MQ=255) cGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACACGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGa < 2:859638/289‑1 (MQ=255) aaaGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCa < 2:601905/289‑1 (MQ=255) aaaGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAAGACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCa < 2:73904/289‑1 (MQ=255) aTTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATAtt > 2:79593/1‑288 (MQ=255) aTGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGaa < 1:484342/289‑1 (MQ=255) aaTTGACCGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTa > 1:586353/1‑289 (MQ=255) tGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATgg < 1:595858/289‑1 (MQ=255) aCTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGa > 1:634631/1‑252 (MQ=255) aCTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGa < 2:634631/252‑1 (MQ=255) aCTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGgc > 2:809632/1‑288 (MQ=255) gaacaatcccttgttcactgtcgcccgtattaaatgtgacatcacgcgttgccatataaccattattcaaatagatatcgacgcgatacgtccctggcggtaattcttgcccattttcaaaacgcgataaatcggccacagcctggggatcatccgctaaaaagcgcggattaaaatagaggtcggcagatgacaaaggtgcctgtgcggcaAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTAc < 2:83390‑M1/76‑1 (MQ=255) aCAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAAGTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCCGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCCAAATCTCTGACGCTGATTAACCCGACGCCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGAAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTTCCTCCAATGGGCGAACGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGCACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCaaa > 1:815942/1‑289 (MQ=255) tCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGAc < 1:342946/289‑1 (MQ=255) tCGCAATTAGCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCTGCTAAATGAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGAc < 1:468198/289‑1 (MQ=255) cGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAACTGATTATGGCGCACTTCCCCCCAACCTGACg > 1:34956/1‑289 (MQ=255) tcactgtcgcccgtattaaatgtgacatcacgcgttgccatataaccattattcaaatagatatcgacgcgatacgtccctggcggtaattcttgcccattttcaaaacgcgataaatcggccacagcctggggatcatccgctaaaaagcgcggattaaaatagaggtcggcagatgacaaaggtgcctgtgcggcaAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACgg < 1:166062‑M1/90‑1 (MQ=255) ttAAACTGTTCTTTCGCCAAGCTGAATTAGCGTTGCCACCCTATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTATCAGAGTTGAAGGCCGGAACCCGGGTTCTTGGAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCATAATTTCGGGCGTAATGGAATAACg < 2:835013/289‑1 (MQ=255) ttAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACg < 2:59594/289‑1 (MQ=255) gTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAggggg < 1:281290/289‑1 (MQ=255) aCTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGaa > 1:701972/1‑289 (MQ=255) aCTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGaa > 2:766849/1‑289 (MQ=255) tCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAAtttt > 2:392728/1‑289 (MQ=255) tCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCAAGGTTAAATTGCCTTCTGATGGAGGAAGCAATATTACTCACCGAACAATAAATGCTTATGGCGCCCTTACCCCAACAATGCCTGCCGTAAGGGAATAACGCAGGGGGAAtttt > 2:838596/1‑289 (MQ=255) tCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGACCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGAAGGGGGAAtttt > 1:733266/1‑289 (MQ=255) cGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCa < 1:590367/201‑1 (MQ=255) cGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCa > 2:590367/1‑201 (MQ=255) cGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATa > 1:160504/1‑221 (MQ=255) cGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATa < 2:160504/221‑1 (MQ=255) aaaTTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCTACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAAt < 2:130040/289‑1 (MQ=255) aTTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATaa < 1:79593/289‑1 (MQ=255) cGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGa > 1:471993/1‑289 (MQ=255) cGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGcc > 1:22709/1‑289 (MQ=255) aTCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCgg > 2:626872/1‑289 (MQ=255) gtcgtAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTc < 2:586353/289‑1 (MQ=255) aGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCatat < 1:872517/288‑1 (MQ=255) aGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCatat < 1:294710/288‑1 (MQ=255) gcgAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCt < 1:211613/287‑1 (MQ=255) gcgataaatcggccacagcctggggatcatccgctaaaaagcgcggattaaaatagaggtcggcagatgacaaaggtgcctgtgcggcaAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAg > 1:83390‑M1/90‑289 (MQ=255) aTTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGc > 2:260122/1‑289 (MQ=255) tAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGa < 1:809632/289‑1 (MQ=255) aCCCGACACCCGATTACCTGACGGTAACCGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTTGTGCCTCCAAAGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGAGGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGaaa < 2:815942/289‑1 (MQ=255) cacCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGAc < 1:756486/166‑1 (MQ=255) cacCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGAc > 2:756486/1‑166 (MQ=255) cccTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTACCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAAt > 1:311752/1‑289 (MQ=255) ccTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATg < 2:733266/289‑1 (MQ=255) aCCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCa < 1:766849/289‑1 (MQ=255) ccTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCat > 1:742241/1‑289 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAGTTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGc > 1:530274/1‑225 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGc < 2:530274/225‑1 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCatat > 1:657535/1‑288 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCatat > 2:776357/1‑288 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCatat > 2:182343/1‑288 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCatat > 1:477967/1‑288 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCatat > 1:69049/1‑288 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCa > 2:610647/1‑285 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCa < 1:610647/285‑1 (MQ=255) gACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCACCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCGGGAGGAATAATGTCATATCCGACTTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCatat > 1:401078/1‑288 (MQ=255) aCGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGTTTCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGTCGCACTTACCTCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATGGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGTAGGAATATGGTCGTATCTGAATTTAACACTTTACCAGCGAACCACACAGTGCTTGCatatgc > 2:320769/1‑287 (MQ=255) cGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACAACCAATGCTTGCATATTCg > 2:190795/1‑289 (MQ=255) gTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTa > 1:774716/1‑289 (MQ=255) gAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAg > 1:373438/1‑250 (MQ=255) gAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAg < 2:373438/250‑1 (MQ=255) tcggcagatgacaaaggtgcctgtgcggcaAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGAc > 2:166062‑M1/31‑288 (MQ=255) aaaTGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGtt < 2:742241/289‑1 (MQ=255) tGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGACGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTg > 2:297023/1‑287 (MQ=255) aTTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGcc < 1:315536/289‑1 (MQ=255) gggCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGc > 1:563539/1‑288 (MQ=255) | ACCGGGAAAGTTTATTCTGGATGAACGTTAAAGCGATTCCGTCAATGGATAAATCAAAATTGACTGAGAATACGCTACAGCTCGCAATTATCAGCCGCATTAAACTGTACTATCGCCCGGCTAAATTAGCGTTGCCACCCGATCAGGCCGCAGAAAAATTAAGATTTCGTCGTAGCGCGAATTCTCTGACGCTGATTAACCCGACACCCTATTACCTGACGGTAACAGAGTTGAATGCCGGAACCCGGGTTCTTGAAAATGCATTGGTGCCTCCAATGGGCGAAAGCACGGTTAAATTGCCTTCTGATGCAGGAAGCAATATTACTTACCGAACAATAAATGATTATGGCGCACTTACCCCCAAAATGACGGGCGTAATGGAATAACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGC > NC_000913/4544644‑4545208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |