| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 28,116 | T→A | 6.2% | L275Q (CTG→CAG) | rihC → | ribonucleoside hydrolase 3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 28,116 | 0 | T | A | 6.2% | 227.2 / 4.5 | 65 | L275Q (CTG→CAG) | rihC | ribonucleoside hydrolase 3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/32); new base A (2/2); total (31/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
GTATTGAAATCGTCATGTGCGGTTTGGATGTCACCAATCAGGCAATATTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATAGCTATGCATGATGCAAACA > NC_000913/27831‑28389 | gTATTGAAATCGTCATGTGCGGTTTGGATGTCACCAATCAGGCAATATTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGACTTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTggg > 2:35566/1‑289 (MQ=255) gTCATGTGCGGTTTGGATGTCACCAATCAGGCAATATTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAgccagcca < 1:416659/289‑1 (MQ=255) tttGGATGTCACCAATCAGGCAATATTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGGAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTg > 2:314588/1‑289 (MQ=255) tttGCATGTCACCAGTCAGGAAATATTAACTCCGGACTGTCTCTCTACCCTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGt < 2:112628/288‑1 (MQ=255) ggATGTCACCAATCAGGCAATATTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCa < 1:294247/289‑1 (MQ=255) cACCAATCAGGCAATATTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGAt < 1:35566/289‑1 (MQ=255) atatTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAg > 1:163430/1‑289 (MQ=255) tGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCAt > 2:220729/1‑260 (MQ=255) tGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCAt < 1:220729/260‑1 (MQ=255) tGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCcagcag > 1:390307/1‑289 (MQ=255) cTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtg < 1:274481/288‑1 (MQ=255) ctctctACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtgggtg > 1:15947/1‑288 (MQ=255) tctACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTg < 2:106852/289‑1 (MQ=255) acTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTg < 2:15947/289‑1 (MQ=255) cGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGaa > 2:146623/1‑256 (MQ=255) cGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGaa < 1:146623/256‑1 (MQ=255) cGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTgg > 1:68448/1‑288 (MQ=255) cGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTgg > 1:376327/1‑288 (MQ=255) cGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCAGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTgg > 1:458278/1‑288 (MQ=255) cGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCAGGGCAAGCCAGCCAATGGACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTg > 1:458274/1‑287 (MQ=255) cGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAAc < 1:159198/289‑1 (MQ=255) aaaTGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTcac < 1:390905/289‑1 (MQ=255) aaaTGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTcac > 1:163315/1‑289 (MQ=255) ttAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGt < 2:163430/289‑1 (MQ=255) ttAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGt < 2:163315/289‑1 (MQ=255) gCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGCGGTCGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGtcat > 1:115781/1‑289 (MQ=255) cTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGtcattca > 2:423131/1‑288 (MQ=255) aCCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCg > 2:143776/1‑289 (MQ=255) ggCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAgccagcca > 2:273285/1‑169 (MQ=255) ggCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAgccagcca < 1:273285/169‑1 (MQ=255) aTGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGTTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCttt < 1:303053/287‑1 (MQ=255) aTGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCttt < 1:143776/287‑1 (MQ=255) aggCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTAAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGTGTGGCTGCGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCACTCATCGACTCATGCCTTTCACTGat < 2:261790/287‑1 (MQ=255) ggCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATAtc < 1:423131/288‑1 (MQ=255) ggCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATAtc > 2:469527/1‑288 (MQ=255) cTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAag > 1:378009/1‑145 (MQ=255) cTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAag < 2:378009/145‑1 (MQ=255) ttGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATAtccctc < 1:314588/289‑1 (MQ=255) tCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTa > 1:385397/1‑289 (MQ=255) tCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTa > 2:302639/1‑289 (MQ=255) ctggctggTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCa < 2:390307/288‑1 (MQ=255) gcgcCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCa < 2:363689/127‑1 (MQ=255) gcgcCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCa > 1:363689/1‑127 (MQ=255) cgcCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAAc > 2:73624/1‑190 (MQ=255) cgcCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAAc < 1:73624/190‑1 (MQ=255) tCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGTATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCg < 1:505583/289‑1 (MQ=255) tCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCg < 1:302639/289‑1 (MQ=255) tCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTGATGGCAGTGTAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATGGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCg < 2:68448/289‑1 (MQ=255) tttcAAACCCGGTTGTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAAGCACGACGGTGGGTGATATCGACGGTGGCCTGGGCAAGCCAGCCAAAGTACAGGTGGCATTGGATCTGGGTGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTGATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTAGCGGCGTAGCGATgc < 2:115781/287‑1 (MQ=255) tctcAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATg > 2:435270/1‑288 (MQ=255) aaCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTa < 2:120715/242‑1 (MQ=255) aaCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTa > 1:120715/1‑242 (MQ=255) ggggCAGTGGAAACGCAGGGCGAATTTACCTCAGGGACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCAGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGGGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGaaa < 2:458278/287‑1 (MQ=255) tgGAAGTGGGAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGCCGTTGGTTGATATCGACGGTTGCCAGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGaaa < 2:458274/288‑1 (MQ=255) gggCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTAc > 1:317673/1‑68 (MQ=255) gggCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTAc < 2:317673/68‑1 (MQ=255) gggCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTa > 2:233893/1‑289 (MQ=255) ccTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCGTTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGaa < 1:412487/289‑1 (MQ=255) ccTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGaa > 2:376472/1‑289 (MQ=255) aGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATa > 1:190703/1‑287 (MQ=255) gtggtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATa < 1:286016/277‑1 (MQ=255) gtggtTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATa > 2:286016/1‑277 (MQ=255) tatCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATAGCTATGCATGATGCAAACa > 2:503089/1‑288 (MQ=255) gCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGaa > 1:4523/1‑256 (MQ=255) gCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGaa < 2:4523/256‑1 (MQ=255) | GTATTGAAATCGTCATGTGCGGTTTGGATGTCACCAATCAGGCAATATTAACTCCTGACTATCTCTCTACACTGCCGCAGTTAAACCGTACCGGGAAAATGCTTCACGCCCTGTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCA‑‑CTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAACCTGTCACATGTTATTGGCATGCAGTCATTCATCGACTCATGCCTTTCACTGATATCCCTCCCTGTTTATCATTAATTTCTAATTATCAGCGTTTTTGGCTGGCGGCGTAGCGATGCGCTGGTTACTCTGAAAACGGTCTATGCAAATTAACAAAAGAGAATAGCTATGCATGATGCAAACA > NC_000913/27831‑28389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |