| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3893264 = | 103 (1.090) | 3 (0.030) | 3/512 | 9.8 | 2.6% | coding (500/960 nt) | yidZ | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | = 4488197 | 123 (1.330) | coding (880/1083 nt) | lptG | lipopolysaccharide export ABC permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GAGTGGATGCAAATGAGCAACCTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTG‑GACACCTTCTTACGTTATCCGCATATCAGCATTTGCTGGGAACAGAGCGATACCTGGGCGCTGGACAATGTGTTACAGGAGCTGGGACGCGAACGCACGATTGCTATGAGCCTGCCGGAATTCGAGCAGTCACTGTTTATGGCAGCGCAACCCGACAATCTGCTACTGGCGACCGCGCCG > NC_000913/3892993‑3893535 | gcgTGGATGCAAATGAGCAACCTGCTGCTGGAGAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGTGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGt < 1:499318/272‑1 (MQ=255)gAGTGGATGCAAATGAGCAACCTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGTCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGt < 1:395339/274‑1 (MQ=255) tgATGCAAGTGTGCAACCTGCTGCTGGTGAACCGGCC‑CCGCCTGCCACCGGGCGGACTGGAGTTTGGGCTGGCGGCGTGATCACCGCTGATGATGATCATGGTTAATGCGCTGGTGAAACTGACCGAC‑CAAGGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGGTTACGATTCCTTAGATGTCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGcc < 2:606596/274‑1 (MQ=255) gATGCAAATGGCCACCCTGTTGCTGGA‑AAACCGCACCCACCAACCCCCGCGCGGCCTG‑AGTTTGAGCGGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 1:461369/275‑1 (MQ=255) aatgaaaTGAGCAACCGGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGGCACCGCGCGGCCTGGAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCAAGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACGGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 1:426425/271‑1 (MQ=255) aTGCAAATGAGCAACCTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 1:561088/275‑1 (MQ=255) aTGCAAATGAGCAACCTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 2:319312/275‑1 (MQ=255) aTGCAAATGAGCAACCTGCGTGTGGATAACCCGCG‑CCACCAGACACCGCGCTGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCAt < 1:820101/275‑1 (MQ=255) tGCAAATGAGCAACCTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGG‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCTGTCGCGACAGCCATCCTCGCTCGGGGGAGGTGGTAAGCTCGCCACCGTTAGcc > 1:869798/1‑272 (MQ=255) tGAGCAACCTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGAt > 2:623867/1‑272 (MQ=255) cAACCTGCTGCTGGATCAACCGCA‑CCACCCGACACCGCGCGGCCTGAAGGTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACTATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGaa < 2:327135/274‑1 (MQ=255) cAACCTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATg < 1:623868/272‑1 (MQ=255) aaactgctgctgGATAAACCGCA‑CCACCAGGCAGCGCGCGGCCTGAATGTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGAGGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAg < 1:768523/271‑1 (MQ=255) ccggctgctgGATAAACCGGA‑CCACCAGACACCGGGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 2:103283/271‑1 (MQ=255) ccTTCTGCTAGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGGGGCCGGAAGTGTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACCGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 1:525563/274‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGGGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 2:702497/274‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGTATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCGGTTACGCCCGCCCCCGTTAGCCATTGTTTATGAATTGc > 2:817924/1‑275 (MQ=255) ccTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg > 1:597527/1‑274 (MQ=255) ccTGCTGCTGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 1:24340/274‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGATAAACCGAA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 1:123408/274‑1 (MQ=255) ccTGCTGATGGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCGGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTg < 2:809494/274‑1 (MQ=255) ctgctgctgGATAAACCGCA‑CCCCCAGACACCTCGCGGCCTGAAGTGTGCGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCt < 1:298757/275‑1 (MQ=255) tgctgGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTACCTCGCGGGAGCTGTTAATCTCGCTCCCGTTAGGCATTGATTCTTACTTGCTGtt > 2:346853/1‑274 (MQ=255) gctgGATAAACCGCA‑CCACCAGACACCGCGCGTCCTGAAGCTTGAGCTTGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTa < 1:791435/275‑1 (MQ=255) gctgGATAAACCCCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACTGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAAACGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTa < 1:55572/275‑1 (MQ=255) gctgGAGAAACCGCA‑CCACCCGACACCGCGCTGCCTCAATTTTGAGCTGGGCGCGTAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACATATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGTATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAATTGGATATCGGTTTTTCCGGTCTCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTa < 1:150156/275‑1 (MQ=255) ccGCA‑CCACCAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGcc < 1:4004/275‑1 (MQ=255) a‑ccaccAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCCGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGCGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGGGAAAGCCATACTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTATCGTTAGCCATTGATTCTGACGTGTTGTTTAGTGAGGTGCCCGGc > 1:404513/1‑275 (MQ=255) a‑ccaccAGACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGAGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACGCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTGTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTAGCTACCGTTAGACATTGATTCTTAAGTGCTGTTGAGTGATGTGCCCt > 1:840704/1‑273 (MQ=255) caccaGACACCGCGCGGCCTGGAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGAGGATGATCATGCTGAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGt < 1:494774/275‑1 (MQ=255) ccaGACCCCGGTCGGCCTGAAGGTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGcc < 2:840703/267‑1 (MQ=255) gccacCGCGGGGCCTGAAGGTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATAATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt < 1:424213/273‑1 (MQ=255) gACACCGCGCGGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGt < 1:684765/275‑1 (MQ=255) ccGCGCGGCCGGAAGGTGGGGCTGGTGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTGTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACg < 2:616923/275‑1 (MQ=255) cgcgcgGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACg > 1:89877/1‑274 (MQ=255) cgcgGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GACGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGACAGCCATCCTCGCCCGCGGGAGCTGTTAAGCTAGCTACGGTTAGCCATTGATTATGACGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCa > 2:827204/1‑274 (MQ=255) cgcgGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGc > 1:73546/1‑273 (MQ=255) cgcgGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGc > 1:568259/1‑273 (MQ=255) cgcgGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCa > 1:32606/1‑274 (MQ=255) cgcgGCCTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCAGCGTCTGGTTACGc > 1:106079/1‑273 (MQ=255) ggCCTGAAGTTTTGGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGa < 2:392324/275‑1 (MQ=255) ggCCGGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGa < 2:37885/275‑1 (MQ=255) ccTGAAGTTTGAGCTGGCGGCGGAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGGTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGGTCGTCACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTGTGGTTAAGAAAAGat > 1:637446/1‑274 (MQ=255) gAATCACCGCTGATGATGATCATGCTTAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGt < 1:158250/274‑1 (MQ=255) gaggagtatCAAGCTTAATTCGCTGTCGAAACAGATCTACATAACG‑TACCCGCAGGCGACCATGAAATTACGTAACTGGGATGACGATTCATTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTGTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGACTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTG‑Gac < 1:383291/267‑1 (MQ=255) attatgatCATGCTTAAGGCGCGATCGAAACAGAGCTGC‑CAACGTTACCCGCAGGCAACCATCAAATTACGTAACTGTGATTACGATTACTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCTAAAGCCATCCTCGCGCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTG‑Gaca < 1:87930/271‑1 (MQ=255) 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ttAATGCGCGGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTCACGCACAGGCGACCAGCAAATTGCGTAACTGGGATTACGATTCCAGAGATGCCATGACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTGTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTTTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCCTGCGTCTGGTTACGCAAAGATCATCCGGCACTGCATCAAACGTGGAATCTG‑GACACCTTCTTACGTTAt < 1:876367/275‑1 (MQ=255) tAATGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCCATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGt < 1:174526/167‑1 (MQ=255) aaTGCGCTGTCGAAACAGATCTAC‑CAACGTTACCCGCAGGCGACCATCAAATTACGTAACTGGGATTACGATTCCTTAGATGCCATTACTCGTGGT‑GAAGTGGATATCGGTTTTTCCGGTCGCGAAAGCAATCCTCGCTCGCGGGAGCTGTTAAGCTCGCTACCGTTAGCCATTGATTATGAAGTGCTGTTTAGTGATGTGCCATGCGTCTGGGTACGCAAAGATCATCCGGTAATGAATCAAACGGGGAATCTG‑GCCACCTTATTACGTTATcc > 2:637373/1‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |