Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 65 (0.990) | 54/282 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 74 (1.130) | 59/282 | 0.1 | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTG > NC_000913/1292892‑1293174 | gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctaaacaggaggccgagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtg > 1:1056441‑M1/141‑143 (MQ=255) ttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCGCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGGGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgtg < 2:89693/143‑1 (MQ=255) tgatgtacggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctaaaccggagggccagctgatagaaaaagaagccactggagcacctcaacaacaccatcatccactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtgtg < 1:775189‑M1/5‑1 (MQ=255) atgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaactcagtaagttggcagcatcacctctaacg < 2:649451‑M1/7‑7 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGCGGTGATCATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGATCTTTATTTTGTgccg > 1:718208/1‑143 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccg < 1:988814/143‑1 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGCTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCAGggt < 1:1149253‑M2/143‑4 (MQ=255) aaTGTTAAGTGCTTCGCTTATTGTAGTAATCTCAAACTGATATTGGGGTGGTTTGCTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa > 1:1151824‑M2/1‑138 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTCAGGCATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatg < 1:1116803‑M2/143‑8 (MQ=255) cggtgctgttgccgttccgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataa > 2:567573‑M1/129‑143 (MQ=255) tttGAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATTTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGACTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatga > 2:773138‑M2/1‑135 (MQ=255) tttAAGTGCTTCGCTCAGTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatga > 2:199310‑M2/1‑135 (MQ=255) gttaAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatga > 2:1012539‑M2/2‑135 (MQ=255) tGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaa < 2:677746‑M2/143‑15 (MQ=255) ttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 1:64445‑M1/121‑143 (MQ=255) ccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaaccccatcatacactaaatcagtaagttgacagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCa < 1:602935‑M1/26‑1 (MQ=255) cgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATCAATATCTTTTCAt < 2:1116918‑M1/27‑1 (MQ=255) ttGTAGTAATCTCAAGCTTGTATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAAGAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatag > 2:298683‑M2/1‑118 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctgaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATtaa < 2:734761‑M1/35‑2 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:426530‑M2/1‑114 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaat > 1:882366‑M2/1‑113 (MQ=255) ccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAg < 1:646256‑M1/39‑1 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 2:1177832‑M2/143‑37 (MQ=255) aCTTATATTGGTGTGGTTTGTTTATTTAATAATAGATCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAAGAAAGAAAGGAATTCAAAATTGTGCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:675320‑M2/1‑103 (MQ=255) tataTTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa > 1:146326‑M2/1‑100 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata < 1:939‑M1/56‑1 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata > 1:819303‑M1/88‑143 (MQ=255) gtgtggtttGGTGTGTTAATAATAGAGCGTTAAAGTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttctgataatgcccga > 1:823164‑M2/3‑93 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 1:806539‑M1/59‑1 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgctg < 1:177935‑M2/143‑53 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc < 1:1107267‑M1/9‑1 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 2:1107267‑M1/78‑86 (MQ=255) ttgAGGTAATAATAGAGCCTTAGATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgaccttgtc > 1:112601‑M2/1‑83 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAACAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 2:372156‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 1:533942‑M1/68‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 2:445938‑M1/69‑1 (MQ=255) tagagacagaagccactgcagcaccgccgcaacaccatcatacactgaatcagtaagttgggagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCga > 1:492821‑M1/72‑143 (MQ=255) ggTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcccacttattgatagtgttctatgttcagatcctgcccgatgcctttgtcatgc < 2:127780‑M2/143‑65 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTGTTTTGTGGCGggaaattactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 1:865761‑M2/143‑66 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGAtt < 2:573543‑M1/77‑1 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagcccc < 2:918576‑M2/143‑71 (MQ=255) agcagccactcgagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatctccTTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTc > 1:785107‑M1/65‑143 (MQ=255) gaagccactggatcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCg > 2:195200‑M1/64‑143 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAGATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTCTTTACACCGATGATTTCgcagc < 2:148319‑M1/84‑1 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgctgtctttgtcatgccgctccaccgaatttgagaa < 2:938526‑M2/143‑85 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:1021984‑M2/1‑59 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt > 2:976395‑M1/51‑143 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacacgaaatcagtaagttggcagcatccccTTGTGCCGCCAATAGATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCTCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa > 2:505289‑M1/48‑143 (MQ=255) cgcaaaaacaccatcatacactaaatgagtaagttggcagcagcaccATGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa > 2:337645‑M1/48‑143 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgagagtgtgttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgccgctccaccgattttgagaacgcca < 2:889510‑M2/143‑90 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGCGGTTaaa < 2:646621‑M1/97‑1 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTaaaa < 2:727208‑M1/97‑1 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaa < 2:608182‑M1/97‑1 (MQ=255) caagaagaccatcatacactaaatcagtcggttcgcagcatcacgTTGTGCCGCCAAGAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaaa > 2:1090131‑M1/46‑143 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaaa < 1:1016547‑M1/98‑1 (MQ=255) gtgtAATGGCCAGGAATGTAATGAATTGAAAGTGGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttatttatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 2:1082806‑M2/1‑52 (MQ=255) aaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTCAAAACt < 2:14920‑M1/100‑1 (MQ=255) gCAATATCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcga > 2:103481‑M2/1‑50 (MQ=255) aaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACtt < 1:113235‑M1/101‑1 (MQ=255) cAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgac < 2:157163‑M2/143‑95 (MQ=255) cAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATGGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgac > 1:428676‑M2/1‑49 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTGGCAGCACGGGAGGTGAAAACTtccg < 2:121997‑M1/104‑2 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt < 1:965440‑M1/104‑1 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc > 1:1112984‑M2/1‑46 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGa < 1:810519‑M1/106‑1 (MQ=255) aGCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 2:74563‑M2/1‑45 (MQ=255) catcatacactaaatcagtgagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAt < 2:808628‑M1/107‑1 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt < 2:706873‑M2/143‑101 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt < 1:576223‑M2/143‑101 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAtt < 1:912035‑M1/108‑1 (MQ=255) accatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAtt > 1:32379‑M1/36‑143 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTc < 2:685955‑M1/109‑1 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc > 2:708117‑M2/1‑41 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGAGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccggtgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc < 1:769233‑M2/143‑103 (MQ=255) acacactaaatcagtaagttgtcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCAt > 1:48227‑M1/33‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 2:757272‑M1/31‑143 (MQ=255) agttaagGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagatgatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagc > 2:452370‑M2/4‑37 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt > 2:1001728‑M2/1‑34 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAt < 1:485196‑M1/118‑1 (MQ=255) aaGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcctgcagctccaccgattttcagaacgacagcgacttccgtcccagcaatg < 2:837063‑M2/143‑111 (MQ=255) aaGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaccgcgacttccgtcccagccgta < 2:652733‑M2/143‑111 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtcatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacctccggcccagccgtgc < 2:420024‑M2/143‑112 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgc < 2:415222‑M2/143‑112 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgaagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgc < 1:306950‑M2/143‑112 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCacgtcacactat < 2:156626‑M1/121‑5 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGCCACAtttt < 2:278462‑M1/121‑1 (MQ=255) gAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcca < 1:592046‑M2/143‑114 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTa < 2:173522‑M1/122‑1 (MQ=255) ttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTCTGCGgag < 2:794178‑M1/129‑1 (MQ=255) tggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAttt < 2:619769‑M1/120‑1 (MQ=255) ttGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcct > 1:415222‑M2/1‑20 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 1:8433‑M2/1‑19 (MQ=255) agcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTAt < 2:1044380‑M1/134‑1 (MQ=255) gttttttttgTGGCGggtaatgaatccatcttattgatagtgttttatgttcagatgatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttggggccgccagctactaccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat > 2:254201‑M2/2‑15 (MQ=255) cTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgccttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctccgat < 2:234018‑M2/143‑129 (MQ=255) tcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGCGATTATCGTa < 1:198544‑M1/138‑1 (MQ=255) accTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAgg > 1:923176‑M1/4‑143 (MQ=255) aTTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 1:697673‑M2/1‑11 (MQ=255) cTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATGGtagggt < 1:816816‑M1/142‑3 (MQ=255) ttGTGCCGggtaatgactccaacttattgataatgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagcacgacagcgacttccgtcccagccgtgccagcaactgccacacattccgctt < 2:1009531‑M2/143‑136 (MQ=255) | TGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTG > NC_000913/1292892‑1293174 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |