| New junction evidence | |||||||||||
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TATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATATTAAGCC > NC_000913/4542409‑4542935 | tATTGAAGCTGGAACCGTCACGCAGACTCATCCTAATATGTTAAGGTATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAAT < 1:609693‑M1/275‑1 (MQ=255) agagcctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttttaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacctTTgggg < 2:878358‑M1/6‑1 (MQ=255) agagcctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTgggg > 1:750466‑M1/270‑275 (MQ=255) agagcctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTgggg > 2:504756‑M1/270‑275 (MQ=255) agagcctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTggg > 1:749334‑M1/270‑274 (MQ=255) agagcctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagggaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTgggg > 1:4019‑M1/270‑275 (MQ=255) aaGCGGGAACAGTAACCCAGCATCATCCTAAGAGGTTAAGGCATGCGTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCTATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTTCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAAGAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGG < 1:922363‑M1/275‑1 (MQ=255) gagcctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGc > 2:701431‑M1/269‑275 (MQ=255) cctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgctgtagaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCa > 1:344596‑M1/266‑274 (MQ=255) actgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccattaaccgtcgtggcagcggccagagccgcggtagaactgagggacagagccgacagaaaaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatagccatgggcagtcgttctgtacactttgttttgaaaacgagtttgactgccaacactgcacagttatcccccaaaagctgaaacatTTCgggcaat < 1:180635‑M1/10‑4 (MQ=255) 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atTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATTCTGCTCGTGTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaat < 2:222167/275‑1 (MQ=255) gattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTcaca > 1:882402‑M1/144‑271 (MQ=255) gattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttcaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtaaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACAt > 1:488467‑M1/144‑272 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |