New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 105617 = | 155 (1.390) | 3 (0.030) | 3/494 | NT | 2.0% | coding (313/1152 nt) | ftsZ | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein |
? | NC_000913 | 106662 = | 146 (1.330) | coding (106/918 nt) | lpxC | UDP‑3‑O‑acyl N‑acetylglucosamine deacetylase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
AGTCATCGGCGTCGGCGGCGGCGGCGGTAATGCTGTTGAACACATGGTGCGCGAGCGCATTGAAGGTGTTGAATTCTTCGCGGTAAATACCGATGCACAAGCGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGGGTGGTGGTACCGGTACAGGTGCAGCACCAGTCGTCGCTGAAGTGGCAAAAGATTTGGGTATCCTGACCGTTGCTGTCGTCACTAAGCCTTTCAACTTTGAAGGCAAGAAGCGTATGGCATTCGCGGAGCAGGGGATCACTGAACTGTCCAAGCATGTGGACTCTCTGATCACTATCCCGAACGACAAACTGCTGAAAGTTCTGGGCCGCGGTATCTCCCTGCTGGATGCGTTTGGCGCAGCGAACGATGTACTGAAAGGCGCTGTG > NC_000913/105346‑105883 | cgcagttcaactcgtcgataccggcgtcaagcagcaggtatacaaacggagcggcgctgccgtccatgatcgggatttccggcgcgttaacttcgataacaatgttatcgatgcccaagcccgcgagagcagcattgaggtgctctacggttgaaatccgtacatcatgctcgttgaccagacacgtacagagcatggtatcacgcacagatttggcatcggccgggaaatctaccggtggattcaagtcggtgcgacgatagatgaccccggtg > 2:84425‑M1/272‑275 (MQ=255) gTCATCGGCGTCGGCGGCGGCGGCGGTAATGCTGTTGAACACATGGTGCGCGAGCGCATTGAAGGTGTTGAATTCTTCGCGGTAAATACCGATGCACAAGCGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGggt < 2:1004062/273‑1 (MQ=255) cttaggggtcggcgGCGGCGGCGGTAATGCTGTTGTACAAATGGTGCGCGGAGGCATTGAAGGTGTTGAATTCTTCGGGGTAAATACCGATGCACAAGGGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGggtggt < 2:302376/267‑1 (MQ=255) cATCGGCGTCGGCGGCGGCGGCGGTAATGCTGTTGAACACATGGTGCGCGAGCGCATTGAAGGTGTTGAATTCTTCGCGGTAAATACCGATGCACAAGCGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGggtggt < 2:649438/274‑1 (MQ=255) aTCGGGGTGGGGGGCGGCGGCGGTAATGCTGTTGAACACATGGTGCGCGAGCGCATTGAAGGTGTTGAATTCTTCGCGGTAAATACCGATGCACAAGCGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGggtggt < 2:609864/273‑1 (MQ=255) gcgtcggcgGCGGCGGCGGTAATGCTGTTGAACACATGGTGCGCGAGCGCATTGAAGGTGTTGAATTCTTCGCGGTAAATACCGATGCACAAGCGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGGGTGGTGGTAc < 1:1052356/274‑1 (MQ=255) ggcggcgggggcggTAAGGCTGTGGAAAACATGGGGAGCGGGCGAATGGAAGGTGTTGAATTGTTCGCGGTAAATACCGATGAACAAGCGCTGCGGAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGGGTGGTGGTACCGGTAc < 2:548219/275‑1 (MQ=255) 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tGCACAAGCGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGGGGGGTGGTACCGGTACAGGTGCAGCCCCAGTCGTCGGTGAAGTGGCAAACGGTTTGGGTATGCTGACCGTATGTGTCGTCACTAAGCCcttaccat > 2:780699/1‑270 (MQ=255) tGCACAAGCGCTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGATGAGGGTATGGGTGGTGGTACCGGTACAGGTGCAACCCCAGTCGTTGCTGAAGTGGGCAACGATTTGGGTTTCCTGACTGTTGCTGTCGCCACTCAGCCTTTCaaa > 1:1025671/1‑273 (MQ=255) gcgcTGCGTAAAACAGCGGTTGGACAGACGATTCAAATCGGTAGCGGTATCACCAAAGGACTGGGCGCTGGCGCTAATCCAGAAGTTGGCCGCAATGCGGCTGATGAGGATCGCGATGCATTGCGTGCGGCGCTGGAAGGTGCAGACATGGTCTTTATTGCTGCGGGTATGGGTGGTGGTACCGGTACAGGTGCAGCACCAGTCGTCGCTGAAGTGGCAAAAGATTTGGGTATCCTGACCGTTGCTGTCGTCACTAAGCCTTTCAACTTTGAAgg > 2:939252/1‑275 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |