New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1899106 = | 133 (1.190) | 3 (0.030) | 3/484 | NT | 2.5% | coding (680/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production |
? | NC_000913 | 1899503 = | 104 (0.970) | coding (1077/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production |
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CTGACGATCGACCGTGCCCTGATTAAAGGCAGTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTCCAACACAATTACCGCTGGCGGTGCTGCTAAGTTTACTGGTGGGCTACATCGCCTGGCTGGCGACCGCTTACCGAATGAGCTTTTCCCGCGAAATCAATCTGGGCCTGGCGCAACATGAGTTCGAATTGTTCTGTCAGCCTTTGCTTAATGCGCGCAGCCAGCAATGTATTGGTGTAGAGATTTTGCTGCGCTGGAACAATCCGCGTCAGGGCTGGATTTCACCGGAT > NC_000913/1898832‑1899377 | gtcagaacctatagctgcggtaaatgacttatcaattttcagcacgtcaggacgtaatgtttcaagccaggaaaacgagctgttgccggtgccgaagtcatcaatcgccagtttgacgtttttacgatgcagctcgcgggcaatccgataatcaacatccagtaaggcatcgcgttcggtgatttcgaggatcagttgctgaatcgggtgagcgctaaaccagtactgattgagatcttttatcagcacaacacggcgaaaatggctgggtgcga < 1:957489‑M1/1‑1 (MQ=255) agaacctatagctgcgggaaatgacttatcaattttcagcacgtcaggacgtaatgtttcaagccaggaaaacgagctgttgccggtgccgaagtcatcaatcgccagtttgacgtttttacgatgcagctcgcgggcaatccgataatcaacatccagtaaggcatcgcgttcggtgatttcgaggatcagttgctgaatcgggtgagcgctaaaccagtactgattgagatcttttatcagcacaccacggcgaaaatggctgggtgcgACGt > 2:109912‑M1/272‑275 (MQ=255) aTCGACCGTGCCCTTATTAAAGGCAGTCCGGTTTTGATTCAATGGAAGACTGCAGCGGTCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTaa < 1:854877/275‑1 (MQ=255) aTCCACCGTGCCCTGATTAAAGGCAGTCCGGTTTTGACTCAATTGACGCCTGCAGCGGGCAGTATCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATCAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCGGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTaa < 1:971520/275‑1 (MQ=255) gTGCCCTGATTAAAGGCAGTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCCCAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCCCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGAAACCTGAAGACCAGGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTCCCATGAACGTTACTTGTcag > 1:430938/1‑273 (MQ=255) gTGCCCTGATTAAAGGCAGTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTCTGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGt > 2:39646/1‑272 (MQ=255) gTGCCCTGATTAAAGGCAGTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGt > 1:816050/1‑272 (MQ=255) tGCCCTGATTAAAGGCAGTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCgg > 1:133848/1‑275 (MQ=255) cggtaaatgacttatcaattttcagcacgtcaggacgtaatgtttcaagccaggaaaacgagctgttgccggtgccgaagtcatcaatcgccagtttgacgtttttacgatgcagctcgcgggcaatccgataatcaacatccagtaaggcatcgcgttcggtgatttcgaggatcagttgctgaatcgggtgagcgctaaaccagtactgattgagatcttttataagcacaccacggcgacactggccaggtgggccgttaaatccaacagt < 2:447608‑M1/17‑11 (MQ=255) aTTAAAGGCAGTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTa > 1:628191/1‑274 (MQ=255) 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gTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCATTTTACAATAAACGTTAATGGTCCGGGGGCCACGGCGCtggca > 1:508128/1‑275 (MQ=255) gTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGCTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAACACTATCCGGTTTCTTCGCCACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCtggca > 2:701890/1‑275 (MQ=255) gTCCGGTTTTGATTCAATGGACGCCTGCAGCAGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGCGCCACAACTGCCGCACATCAGTAGCGCCAGCCTGCCTGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATTGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAATACAATGTAAACTATAAGGTTTCTTCGACAATCTTTCCTTTTACACTTAACGTTAATGGACCGTGGTCTACGGCCCtggca > 2:118286/1‑275 (MQ=255) gTCCGGTTTTGATGCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCGGGGGTAATGGGGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACGGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTTGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCtggca < 1:76450/275‑1 (MQ=255) ttttGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCAc < 2:40456/275‑1 (MQ=255) tttGGTGCAATGGACGCCTGCCGCGGTCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGAGGAGTAACATGGACTTACCGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTAGACAAACAGCATTTGCTATATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGATTTCTTCGCAACGATTTGCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACt < 2:270675/275‑1 (MQ=255) ttGATTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTa < 1:22825/275‑1 (MQ=255) aTTCAATGGACGCCTGCAGCGGGCAGTAGCAATGCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCCCTATc > 1:1023229/1‑274 (MQ=255) attgACGGCTGCAGCGGGCAGTAGCCATTCTGGGGTCATGGAGATGATTAACATCGACTTACTGACGGCAATGCTGCTTGAGCCACAACTGCCGCAAATCAGTAGCGCCAGCCTGACGGTGGACAAACGGCATTTGCTCTATGGTAATGGGCTGGTAGATTCCCTTCCGCAACCTGAAGACAATGAAAACTATCAGGTTTCTTCGCAACGCTTTCCTTTTACCATTAACGTTAATGGTCCGGGGGCTACGGCGCTGGCATGGCACTATCTTcc < 1:342579/270‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |