| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,873,092 | G→A | 3.6% | G351E (GGA→GAA) | yeaJ → | putative diguanylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,873,092 | 0 | G | A | 3.6% | 366.3 / 2.2 | 112 | G351E (GGA→GAA) | yeaJ | putative diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (58/50); new base A (2/2); total (60/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTCTCAATGTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCTGTTCCAGTATGTCAGTTACGTCCATGACTTACCGGGCGGCATTCGTGTCTCGTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACTTCCGTTTATACCAAAATGTGTCGCGAGAAAATATTAGTGATGCGATGACTGGACTGTATAATCGCAAAATTTTAACCCCTGAACTGGAGCAGCGGTTGCAGAAACTGGTGCAATCCGGTTCTTCGGTGATGTTTATTGCTATTGACATGGACAAGTTAAAGCAAATAAATGACACCCTCGGTCATCAGGAGGGGGATTTAGCGATTACGTTATTAGCTCAGGCGATTAAACAGTCGATTCGTAAAAGTGATTATGCCATCCGACTCGGTGGCGATGAATTCTGCATCATTCTTGTCGATTCGACGCCGCAAATTGCAGCACAACTG > NC_000913/1872819‑1873366 | ttCTCAATGTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCTGTTCCAGTATGTCAGTTACGTCCATGACTTACCGGGCGGCATTCGTGTCTCGTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACTTCCGTTTATACCAAAATGTGTCGCGAGAAAATATTAGTGATGCGATgactgga < 1:611017/275‑1 (MQ=255)ttCTCAATGTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCTGTTCCAGTATGTCAGTTACGTCCATGACTTACCGGGCGGCATTCGTGTCTCGTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACTTCCGTTTATACCAAAATGTGTCGCGAGAAAATATTAGTGATGCGATgactgga < 1:441588/275‑1 (MQ=255) tctcAATGTCACGCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCTGTTCCAGTATGTCAGTTACGTCCATGACTTACCGGGCGGCATTCGTGTCTCGTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACTTCCGTTTATACCAAAATGTGTCGCGAGAAAATATTAGTGATGCGATgactggac < 2:936452/275‑1 (MQ=255) gCTAACCGATACCGATTCGGGGCGCGACATTATCATCAACCAGAGCGAAGATAATCTGTTCCAGTATGTCAGTTACGTCCATGACTTACCGGGCGGCATTCGTGTCTCGTTATCCATTGATATTCTTTACTTTATCACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGTGCGGATGCACTTCCGTTTATACCAAAATGTGTCGCGAGAAAATATTAGTGATGCGATGACTGGACTGTATAATCGCa < 1:1053976/275‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |