Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,817,989 | A→C | 8.5% | intergenic (‑131/+68) | argQ ← / ← argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,817,989 | 0 | A | C | 8.5% | 155.3 / 3.2 | 67 | intergenic (‑131/+68) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/29); new base C (2/5); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 |
CCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCT > NC_000913/2817717‑2818259 | cctGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATCTTATTTTCCTCTTGA‑‑TATGGATACCCCTATTCACGCCTTATCATTTAGAAGATCGATCCTGCGTGAGGCTTACTCG‑CCTTGCTGCTCGCTATTCGGACC‑CTTGCTCAGGCAACGTCatcat‑c > 2:144242/1‑275 (MQ=14) cTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATAGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTACATCCATATCAATTAAGAGATGTGGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTTGCCCTTCGGGTC‑GTGGCCAAACCAACTGTACCAT‑CCCttattc > 1:873408/1‑270 (MQ=17) tGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTTCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGc > 1:622858/1‑274 (MQ=255) tGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTCCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGc > 1:953429/1‑274 (MQ=255) gCGGGTAATACATGTATCTTTGCGATACCTGCAGTGCTGAGGGTTACGGGGAATAGGGTGCATGCGGGAGGATTCGAACCGCGGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTTA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCt < 2:823959/275‑1 (MQ=17) aCCGCTATCGCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGTATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTaa < 1:1032641/274‑1 (MQ=255) tatgagttcccctcatagaggcatgTTACGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGGCCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTCTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGG‑AAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCCT‑CCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCAc < 1:873381/251‑1 (MQ=14) ccatagATTCCTTCATTGCTGAAGGTTACGAGGAATGTGGTGCAGCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCGCGGTTCGTAGCCGATTACTCTATCCAGCTGGGCTACGGATGCAGCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGGGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTAc < 2:228902/269‑1 (MQ=18) aTTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGACACCTTATTCTCCTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATACCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGACC‑GGTGCTAAAGGAACGTTAGCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTGATTCCTCTACCTCCTCGATAACtt > 1:564793/1‑274 (MQ=18) acgggtaaTATGGGGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGTTTGGTTCGCGGCCGAGTACTCTATCCAGCCGGGCTACGGATGCATCGGGAATACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGAGCAGCAGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGAtt < 2:873407/269‑1 (MQ=17) ggATAATAGTGTGCATCCGGGAGGATTCGAGCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTc < 1:632839/275‑1 (MQ=255) gataaTATGGTGCATCCGGGAGGATTCGACCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGATTCCTCTATCCAGCTGAGTTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCg < 1:273388/272‑1 (MQ=255) aaTATGGTTCATCCGGGAGGATTCGAACCTCAGACGGCTCGGTTCTTAGACGAGTACGATAGCCAGCTGAGATACGGATGCATTGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGATACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGga < 1:227789/274‑1 (MQ=18) gtGGGGCATCTGGGAAGATTCGACCCTCCGACCGCTCTATTCGTAGCCGATTTCTCTAATCGCCTAAGCTAAGGAAACATCGGGAATACTTAATCGAGTGCTGA‑‑TATAGATACATCTACTAAAGCTATATCTATTAAGAGAGGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGaa < 2:458789/273‑1 (MQ=17) cATCCGGGAGGATTCGAACCACCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAGAGGGAAAACTTATTCTACTGCGGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGAGGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGt < 1:868785/274‑1 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACGGCTACTAAAGCCATGTCAATTAAGACATGTTGCATCCGGGAGGATCAATCG‑CCTTGAGGCTCGCGCTCCGGGCG‑GTTGCTTAAGAAAACATATCAT‑CCCTAGTGCTTGCGGTTAATTCCGCTACTCCTTAGATACCTTCATTCCTCAAGTTTTCGGAGAATAAgggtc > 2:511664/1‑272 (MQ=17) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGa < 1:402773/239‑1 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGa > 2:402773/1‑239 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTCGAACCCCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAATTACTTCAACCGCTGA‑‑TATTTATTCCCACCCTAAAGACATAACAATTTAGCAATGGTGCAACCGGGAGGTTTAACCGTCTTTGCGG‑TCCCCCCTCAGGCCGGGTGTTAAACCAAC‑TTATCCTCCCCTGGTGCCTGTGGTACTGACCGCCCCCTCTTCGATACCTCCAtccttacgcttcccaagaatatggtc > 2:321930/1‑249 (MQ=2) ccGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCAt > 1:598030/1‑275 (MQ=255) ttCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATCTTTTTCTCCTCCTTA‑‑TATTAAAACCCCTCTTAAACCATTATCAATTAAGACCTGGTTCTTCTACAAATATTACTCT‑CCTGACGGCTCGCACATAGGTGA‑ATTGCGAGAGCGCCGTTATCTT‑CCCTAGTACCATCCGTTACTTCCGCCACATCTTCAATTCCTTCATACCTGCACAATTCAGAAAATATGTTGCAtgccgacata > 2:177684/1‑266 (MQ=9) ttCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCAAGCTGAGCTACGGAGGCATCGGGAAAACTTATTCTACCGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAATCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGTCTGCGGTTAATTCCGCTACCCCTTCGATCCCTTCATTGCTGAAGATTTAGGAGAATATGGTCCATCCgggggg > 2:56787/1‑274 (MQ=18) 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aGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTCCTGA‑‑TATTAATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAAAGATGTTGAATCCGGGAGGATTACTCG‑CCCTGCGGCCCGCCTCTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCCACGTTATCTT‑CCCAAGTGCCCTCGGTTAATCCCGCTACCCCTTCGATACCTTCCTTGCTGAAGATTTCGGAAAAAAAGATTCAACCGGAAGGCATCCACACTCCGAACGCACGGCTCGt > 2:581550/1‑275 (MQ=17) gagtatcttttCCAGCTGAGCTACGGATGATACGGGAAAACTTATTCTAATGCGGT‑‑TATTTATACCGCTACTAAAGCCATATTAATTAATGGATGGTGCATCGAGGAGCATTACTCG‑CACTGCGGCGCTCGTCTGGGGCC‑GCAGATATAGCTACGATACCGT‑TCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGcc < 2:622858/265‑1 (MQ=17) aGTACTCTATTCAGCTGAGCTACGGATGCATCTGGAAACCTTATTCTACTGCTTA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGcc < 1:414704/274‑1 (MQ=255) aGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTGGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCCCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGCGAATATGGTGCATCCGGGAGGATCCGAACCTCCGACCGACCGCGTCGTAGcc > 1:591266/1‑274 (MQ=255) tATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCC‑CCTTGCGGCTCGGCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGCGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTActc > 1:252263/1‑275 (MQ=255) aGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGTTTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGCTTCGAACCGCCGACCGCCCGGTTCCTAGCCGCGTActc > 2:535594/1‑270 (MQ=255) gCTGAGCTACGGATGCAGCGGGAAAACTTATTCTACCGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATc < 1:535594/273‑1 (MQ=255) tgctgA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTAc < 1:144242/274‑1 (MQ=255) tgA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGGCATATCAATTAAGTGATGGTGCACCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTActgct < 1:436987/275‑1 (MQ=255) tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGGGTAATCTATCCAGCTGACCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTgc > 1:1060189/1‑273 (MQ=255) tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGa > 1:817164/1‑274 (MQ=255) cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTTCCAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGCTTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGCAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTCCTCTATCCAGCTGAGTTACGGACGCATCGGGAAAtttactttacctctgcattttatcc > 2:1031979/1‑259 (MQ=17) cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGCTATTGATccc > 1:386290/1‑275 (MQ=255) cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGACTGCGGTTAATTCGGCTACCTCTTCGATACCTTCATTTCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTAGCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATAcc > 1:935900/1‑275 (MQ=255) cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGCCTCGCCCTTCTGGCC‑GTTTCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCTCTACCCCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGACAATATGGTGCATGCGGGAGGAATCGAACCTCCGACGGCTCGGATCGTAGCCGAGTACTCCATCCAGCTGACCTACGACTCAATCGGGAAatttatttagcgtcctaaatttatacc > 2:679268/1‑256 (MQ=17) tctcctaAAGCGATATTAATTAAGAGATGGTGCATCCGTGTGTATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCGTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGGGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCg < 1:121121/271‑1 (MQ=255) gtcactaagcgcATGTCATTTAGTAGATGGTGCGGCCGGGAGGAATACTCG‑CCTTGCGTCTCGCCCCGCGGGCG‑TTTGCTATAGAAACGTGATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCAGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCg < 2:953428/264‑1 (MQ=17) gCTACTGAAGCCCTATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCTGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTTCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTTCCTGCGGTTAATTCCGCTGCCTCTTCGATACCTTCATTGGTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCg < 1:511664/275‑1 (MQ=255) 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gTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTGGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTAACAT‑CCCTAGTCCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATTCGGGCGGATTCGAACCTCCGCCCTCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTCTTTTACTGCCGATATTGATACCCACACCAACTCCCTACAAAGTATGAGATgg > 2:529524/1‑275 (MQ=17) ttaacgggtcgcgttgaccG‑CCTGGCGGTTCGCCGTTCGGGCG‑TTTGCTAACGCAACGTTAGCAT‑CCTTGGTGCCTGCGGTTAATCCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTCCGAAGAATATGGTGCATCCGGGAGTATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCAAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGt < 2:523818/256‑1 (MQ=14) gCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTg > 1:155317/1‑112 (MQ=255) cATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTActg < 1:1012375/228‑1 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CCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCT > NC_000913/2817717‑2818259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |