Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,817,995 | A→G | 8.0% | intergenic (‑137/+62) | argQ ← / ← argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,817,995 | 0 | A | G | 8.0% | 181.8 / 3.9 | 67 | intergenic (‑137/+62) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/32); new base G (2/4); total (30/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 |
TGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGA > NC_000913/2817726‑2818269 | tGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTTCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGc > 1:622858/1‑274 (MQ=255) tGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTCCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGc > 1:953429/1‑274 (MQ=255) gCGGGTAATACATGTATCTTTGCGATACCTGCAGTGCTGAGGGTTACGGGGAATAGGGTGCATGCGGGAGGATTCGAACCGCGGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTTA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCt < 2:823959/275‑1 (MQ=17) aCCGCTATCGCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGTATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTaa < 1:1032641/274‑1 (MQ=255) tatgagttcccctcatagaggcatgTTACGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGGCCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTCTCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGG‑AAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCCT‑CCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCAc < 1:873381/251‑1 (MQ=14) ccatagATTCCTTCATTGCTGAAGGTTACGAGGAATGTGGTGCAGCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCGCGGTTCGTAGCCGATTACTCTATCCAGCTGGGCTACGGATGCAGCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGGGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTAc < 2:228902/269‑1 (MQ=18) aTTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGACACCTTATTCTCCTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATACCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGACC‑GGTGCTAAAGGAACGTTAGCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTGATTCCTCTACCTCCTCGATAACtt > 1:564793/1‑274 (MQ=18) acgggtaaTATGGGGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGTTTGGTTCGCGGCCGAGTACTCTATCCAGCCGGGCTACGGATGCATCGGGAATACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGAGCAGCAGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGAtt < 2:873407/269‑1 (MQ=17) ggATAATAGTGTGCATCCGGGAGGATTCGAGCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTc < 1:632839/275‑1 (MQ=255) gataaTATGGTGCATCCGGGAGGATTCGACCCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGATTCCTCTATCCAGCTGAGTTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCg < 1:273388/272‑1 (MQ=255) aaTATGGTTCATCCGGGAGGATTCGAACCTCAGACGGCTCGGTTCTTAGACGAGTACGATAGCCAGCTGAGATACGGATGCATTGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGATACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGga < 1:227789/274‑1 (MQ=18) gtGGGGCATCTGGGAAGATTCGACCCTCCGACCGCTCTATTCGTAGCCGATTTCTCTAATCGCCTAAGCTAAGGAAACATCGGGAATACTTAATCGAGTGCTGA‑‑TATAGATACATCTACTAAAGCTATATCTATTAAGAGAGGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGaa < 2:458789/273‑1 (MQ=17) cATCCGGGAGGATTCGAACCACCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAGAGGGAAAACTTATTCTACTGCGGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGAGGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGt < 1:868785/274‑1 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACGGCTACTAAAGCCATGTCAATTAAGACATGTTGCATCCGGGAGGATCAATCG‑CCTTGAGGCTCGCGCTCCGGGCG‑GTTGCTTAAGAAAACATATCAT‑CCCTAGTGCTTGCGGTTAATTCCGCTACTCCTTAGATACCTTCATTCCTCAAGTTTTCGGAGAATAAgggtc > 2:511664/1‑272 (MQ=17) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGa > 2:402773/1‑239 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGa < 1:402773/239‑1 (MQ=255) aTCCGGGAGGATTCGAACCCCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAATTACTTCAACCGCTGA‑‑TATTTATTCCCACCCTAAAGACATAACAATTTAGCAATGGTGCAACCGGGAGGTTTAACCGTCTTTGCGG‑TCCCCCCTCAGGCCGGGTGTTAAACCAAC‑TTATCCTCCCCTGGTGCCTGTGGTACTGACCGCCCCCTCTTCGATACCTCCAtccttacgcttcccaagaatatggtc > 2:321930/1‑249 (MQ=2) ccGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCAt > 1:598030/1‑275 (MQ=255) ttCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATCTTTTTCTCCTCCTTA‑‑TATTAAAACCCCTCTTAAACCATTATCAATTAAGACCTGGTTCTTCTACAAATATTACTCT‑CCTGACGGCTCGCACATAGGTGA‑ATTGCGAGAGCGCCGTTATCTT‑CCCTAGTACCATCCGTTACTTCCGCCACATCTTCAATTCCTTCATACCTGCACAATTCAGAAAATATGTTGCAtgccgacata > 2:177684/1‑266 (MQ=9) 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aGTACTCTATTCAGCTGAGCTACGGATGCATCTGGAAACCTTATTCTACTGCTTA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGcc < 1:414704/274‑1 (MQ=255) aGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTGGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCCCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGCGAATATGGTGCATCCGGGAGGATCCGAACCTCCGACCGACCGCGTCGTAGcc > 1:591266/1‑274 (MQ=255) tATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCC‑CCTTGCGGCTCGGCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGCGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTActc > 1:252263/1‑275 (MQ=255) aGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGTTTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGCTTCGAACCGCCGACCGCCCGGTTCCTAGCCGCGTActc > 2:535594/1‑270 (MQ=255) gCTGAGCTACGGATGCAGCGGGAAAACTTATTCTACCGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATc < 1:535594/273‑1 (MQ=255) tgctgA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTAc < 1:144242/274‑1 (MQ=255) tgA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGGCATATCAATTAAGTGATGGTGCACCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTActgct < 1:436987/275‑1 (MQ=255) tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGGGTAATCTATCCAGCTGACCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTgc > 1:1060189/1‑273 (MQ=255) tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGa > 1:817164/1‑274 (MQ=255) cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTTCCAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGCTTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGCAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTCCTCTATCCAGCTGAGTTACGGACGCATCGGGAAAtttactttacctctgcattttatcc > 2:1031979/1‑259 (MQ=17) cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGCTATTGATccc > 1:386290/1‑275 (MQ=255) cGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGACTGCGGTTAATTCGGCTACCTCTTCGATACCTTCATTTCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTAGCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATAcc > 1:935900/1‑275 (MQ=255) 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gCTACTGAAGCCCTATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCTGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTTCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTTCCTGCGGTTAATTCCGCTGCCTCTTCGATACCTTCATTGGTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCg < 1:511664/275‑1 (MQ=255) ctactaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAc > 2:494659/1‑192 (MQ=255) ctactaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTACGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATCCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATCTTGATCCCga > 1:79150/1‑274 (MQ=255) 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cAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATc < 2:817163/275‑1 (MQ=255) taagagagatggCATCCGGGGGAAGTAGTCT‑CATTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAGAGCAACGTTATCCT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATGCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGGTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGt < 1:181316/264‑1 (MQ=14) tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCCCGGTTCGTAGCCGCGTCCTCTATCCAGCTGATCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACAGCTACTAAAGCGCTATCAAGTAAgagag > 2:928758/1‑274 (MQ=255) ggTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTAtttt > 2:1012374/1‑228 (MQ=255) gTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTGGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTAACAT‑CCCTAGTCCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATTCGGGCGGATTCGAACCTCCGCCCTCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTCTTTTACTGCCGATATTGATACCCACACCAACTCCCTACAAAGTATGAGATgg > 2:529524/1‑275 (MQ=17) ttaacgggtcgcgttgaccG‑CCTGGCGGTTCGCCGTTCGGGCG‑TTTGCTAACGCAACGTTAGCAT‑CCTTGGTGCCTGCGGTTAATCCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTCCGAAGAATATGGTGCATCCGGGAGTATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCAAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGt < 2:523818/256‑1 (MQ=14) gCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTg > 1:155317/1‑112 (MQ=255) cATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTActg < 1:1012375/228‑1 (MQ=255) tCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCCT‑CCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAA‑AGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAACTTTATTTTACTTCTGATATTGATCCCGCTACTAAAGc > 2:505795/1‑250 (MQ=11) ccGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGa < 2:155317/112‑1 (MQ=255) tACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGACATTTATTTTACTGCTGATATTGATCCCGCTACTAAAGc > 1:358693/1‑240 (MQ=255) cTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCCTCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTTATACCGCTACTAAAGCCATATCCAGTAAGCAATTGTGCATCCggtcggaatc > 2:1064996/1‑266 (MQ=255) ccctGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGTGACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAAcc < 1:566860/272‑1 (MQ=255) gggcattGCTAAAGCAACGTTATCTT‑CCCTACTGCCTGCTGTTAATTCAGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATAGGGTGCATCCGGGCGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTGCGTATCCGAGTACTCTAACCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATATTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTa < 2:386290/270‑1 (MQ=18) tggCTAAATCAACGTTATCAG‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGa < 1:581550/273‑1 (MQ=255) tGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTATGAGATGGTTCATCTGGGAGGATTCGAACCTCCGACCTCTCGGTTCGTAGct > 1:1047027/1‑271 (MQ=255) aaaGAAACGTTATCCT‑CCCGAGTGCTTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTGCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCTCCCGGGAGGATTCTAACCTCCGACCGCCCGGTTCGTAGCCGAGTACGCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCGGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTAct < 1:1069372/275‑1 (MQ=25) gatcat‑cCCTTGGGCGTGTGATTAATTTCGTTGCCACTTTGATGCCTTCCGTGATAAAGATGTCGGGGGATATGGTGCATCCGGCAGGATGCGATCCTCTGCTCGGGCTGTGCGTAGCCGAAGATTTGATCCAGCTCGGCCTCGGATGCATTGTGGAAGGTGTATTACTGCCGATATTGATACCGTTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCt < 2:79150/274‑1 (MQ=16) aGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTACGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCCCCGACCGCCCGGTTCGTAGCCgcagctcctaccctgttgagctccggt > 1:1062648/1‑249 (MQ=17) aGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCAGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGa > 1:256218/1‑275 (MQ=255) | TGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCG‑CCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCC‑GTTGCTAAAGCAACGTTATCAT‑CCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGA > NC_000913/2817726‑2818269 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |