| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 582,370 | 0 | C | . | 3.0% | 470.8 / 6.8 | 132 | pseudogene (435/653 nt) | ybcY | pseudogene, DLP12 prophage, methyltransferase homology,Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (61/67); new base . (2/2); total (63/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGCGCATCAGTTTTTGACCGAAGCTATTGTGCACAACTCCATCGCCAAGAATTGTGGCTCCGTATAGAGTTCCATCGTCAGTTAAGGCCTGCGCCGCATTGCGTATTACACAGCTTTTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATG > NC_000913/582085‑582652 | tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTTGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTGATTGTAAATGCGCATCAGTTTTTGACCGAAGCTATTGTGCACAACTCCATCGCCAAGAATTGTGGCTCCGTATAGAGTTCCATCGTCAGt > 1:185338/1‑289 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |