| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,136,219 | 0 | A | T | 3.1% | 478.0 / 2.3 | 128 | V342E (GTG→GAG) | wza | colanic acid export protein, outer membrane auxillary lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (59/65); new base T (2/2); total (61/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TGTTCTGCGGCGACGCTGATAGCGGTAGGATCAGCGCCCTTACCGACCAGCGCGCCGAGTCCAGCGGACTCCACTTTCAGCTCCGGGTGATAACGTTGCAGTAAGCGTTCCGCCGTCGGGGAACGGCAAATATTGCCGACACAGACAACTAAGATGTTGTTAAACATGACGATTACCAGTTATGAATGTCGCTGGCTGTATCCGTCATGTAACGGACACCGCTAATAGTTGGCAGCAACTGATTGATCAGACGGTTCCAGCGGGAAACCGGGGCGGTGGTGACATACACCACGTCATAAGGTTGCAGGCGGAATTCTGTCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATGCCGCTAAAGTCCATTTTCAGGGTGCTCTGTTTCTTCACTTCACCCATCACAAATACTTTCAGATCATCATTACGTGGCACGTAGAGA > NC_000913/2135932‑2136506 | tGTTCTGCGGCGACGCTGATAGCGGTAGGATCAGCGCCCTTACCGACCAGCGCGCCGAGTCCAGCGGACTCCACTTTCAGCTCCGGGTGATAACGTTGCAGTAAGCGTTCCGCCGTCGGGGAACGGCAAATATTGCCGACACAGACAACTAAGATGTTGTTAAACATGACGATTACCAGTTATGAATGTCGCTGGCTGTATCCGTCATGTAACGGACACCGCTAATAGTTGGCAGCAACTGATTGATCAGACGGTTCCAGCGGGAAACCGGGGCGGTGGTGACATacac < 1:1042717/289‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |