| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,354,909 | A→T | 7.4% | intergenic (‑191/+46) | lysU ← / ← dtpC | lysine tRNA synthetase, inducible/dipeptide and tripeptide permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,354,909 | 0 | A | T | 7.4% | 172.3 / 2.6 | 50 | intergenic (‑191/+46) | lysU/dtpC | lysine tRNA synthetase, inducible/dipeptide and tripeptide permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/21); new base T (2/2); total (27/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
GCTGACGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAGCATATAAATCCCGGTTAATACGCC > NC_000913/4354625‑4355197 | gCTGACGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATaaa > 2:982071/1‑289 (MQ=255) aGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAg < 2:806389/288‑1 (MQ=255) ttttCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTc < 1:982071/287‑1 (MQ=255) ggcgATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCaa < 2:1008029/288‑1 (MQ=255) tCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTGCAGACATTTTGGTTACTCTAAATCCAGCTTTTAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATATGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTATATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCATGATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTATTACGACAGTTAATCGTTGct < 2:831424/289‑1 (MQ=255) ccGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATtcgtcg < 1:864851/289‑1 (MQ=255) ccGTGTTTCTGGTTCCGACATGTGGGTTCCGCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCGCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTGAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATtcgtcg < 2:528664/289‑1 (MQ=255) tttCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTACCATATTCGTCGGCGt > 2:1131429/1‑288 (MQ=255) cATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATACTCGTCGGCGTGCTAAACAGaaa < 2:306859/287‑1 (MQ=255) aTCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAAt < 1:527149/289‑1 (MQ=255) aGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAACCAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATacg > 2:909586/1‑288 (MQ=255) tttAGCGTAGTAAAAGACACAGATCTGTACACGTTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAGCCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATcg < 2:579719/289‑1 (MQ=255) tAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAGCTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGcc < 2:662302/289‑1 (MQ=255) aTCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCAct > 2:1009530/1‑288 (MQ=255) tCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCActc < 1:1124773/288‑1 (MQ=255) tattatCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCGATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTgaga > 2:711425/1‑289 (MQ=255) tattatCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCa > 1:1098080/1‑233 (MQ=255) tattatCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCa < 2:1098080/233‑1 (MQ=255) cTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAGGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGACAAGAATCg > 2:897294/1‑288 (MQ=255) cTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATGCGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCCCCCATCTGAGAAAAGAATc > 2:1072555/1‑287 (MQ=255) cTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCGCTCTCCCATCTGAGAAAAGAATc > 2:689271/1‑287 (MQ=255) cTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATc > 1:1042819/1‑287 (MQ=255) cTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATc > 1:793338/1‑287 (MQ=255) cTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCg > 1:532935/1‑288 (MQ=255) aCTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTg < 2:1221549/188‑1 (MQ=255) aCTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTg > 1:1221549/1‑188 (MQ=255) cTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTTTAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAAtt > 1:897677/1‑289 (MQ=255) cTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAAtt > 2:704980/1‑289 (MQ=255) tttATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCAt > 1:23385/1‑289 (MQ=255) tttATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCAt > 2:84988/1‑289 (MQ=255) atcGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTaa > 2:807521/1‑289 (MQ=255) aCTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTg > 1:514195/1‑287 (MQ=255) aCTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTg < 2:514195/287‑1 (MQ=255) aaCGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGAct < 2:1002090/289‑1 (MQ=255) aCCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACCCTgtcg > 2:1131436/1‑288 (MQ=255) aatacCTATCAAAAAGCGTTCAATAACTTTTTAAGTTCAGTTGGTAAGGGTTTTAAACGGAGATGTAATTTATTCATAACCAATTGGTTTGACGACAGTTAATCGTTCCTCTCCTGTATCATATTCGGAGGCGGGCTAAACAGAAACCGGGAACCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCAACACAAGCCAACGTCCACGCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGGCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTgcca < 2:829299/289‑1 (MQ=255) aaCCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTgccagcc > 1:770394/1‑289 (MQ=255) tCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTTTAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAAc > 1:143524/1‑133 (MQ=255) tCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTTTAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAAc < 2:143524/133‑1 (MQ=255) tCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCa > 1:943994/1‑148 (MQ=255) tCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCa < 2:943994/148‑1 (MQ=255) cAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCCGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCAACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACCCCGCCCAGCCAGTTgg > 2:430359/1‑289 (MQ=255) gTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACcg > 2:27301/1‑288 (MQ=255) tattaATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCGCTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAg < 1:689271/289‑1 (MQ=255) cGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAGCATATAAAt < 1:242098/289‑1 (MQ=255) gATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAGCATATAAATc < 1:1009530/289‑1 (MQ=255) aTTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAGCATATAAATc < 2:23385/288‑1 (MQ=255) gTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGt < 1:940870/268‑1 (MQ=255) gTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGt > 2:940870/1‑268 (MQ=255) ttAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTGTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTACGCTGCAATTGCCACACCGCTAATTTGAGACCATGACGTCTGCTGTGCCACGACGACTGCCAGCACGTTGGCGCCAGCGCCTGTTGACAGCCTACAAAACCCGGtt > 2:757090/1‑289 (MQ=255) ataAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAGCATATAAATCCCGGTTAATACGcc > 1:656452/1‑289 (MQ=255) | GCTGACGTAGTGCCGCCAGTTTTTCGCGGCGATTTCTCAGTTCATCGTTAAAATCAATAGCCTCATTGGCTCCCCGTGTTTCTTGTTCAGACATTTTGGTTCCTCTAAATCCAGCTTTCAATTTAGCGTAGATAAAGAGACAGATCGGTACACTGTATTATCTGCCTCGACTATTAGTAACTCAGTTTATCTTATCGAAACTAACGCTTACCTCAAGTTGATATCACTAATAAATAACCATCAAAATGGTTTAAATGACTTATTAATCTCGATTTGTTAGTGTTATAAACTGAAAGTTAATTTATTCATAACCAATTGTTTTTACGACAGTTAATCGTTGCTCTCCTGTATCATATTCGTCGGCGTGCTAAACAGAAAACGGGTAGCAAAGGCCAATACGACGATGATCGCGACACAAGCCAACGTCCACTCTCCCATCTGAGAAAAGAATCGCTGGTAAGCTGCAATTGCCATACCGCTAATTTGCGACTCTGTCGTCTGCTGTGCCACGACGCCTGCCAGCCAGTTGGCGACCGCGCCTGTTGCCAGCATATAAATCCCGGTTAATACGCC > NC_000913/4354625‑4355197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |