| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4606559 = | NA (NA) | 4 (0.070) | 4/270 | 8.9 | NA | noncoding (1/92 nt) | REP351 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences | REP351 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4606591 = | NA (NA) | noncoding (33/92 nt) | REP351 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences | REP351 (repetitive extragenic palindromic) element, contains 2 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
AAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCGGGTCATA > NC_000913/4606419‑4606697 | aaaaGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGcagatgcc > 2:301312/1‑143 (MQ=255)aaaaGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTGTGGTATGCATGCGGGGGcagatgcc > 2:11052/1‑143 (MQ=255) aaaGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGcagatgcca > 2:954263/1‑143 (MQ=255) aGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAACTGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGcaggtgccaga > 1:909127/1‑143 (MQ=255) aaTTGCTCCCACGGAGGCGCATTCTAGGTGTGTTCAACACTTCATGTATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTGATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGGATGCATGCGGGGGcagatgccagatg < 1:384481/143‑1 (MQ=255) aaTTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGcagatgccagatg < 2:260496/143‑1 (MQ=255) tGCTACCACGGAGGCGCATTCTTGGGGTAATCTGCTTTTCGTCCATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑G‑AAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGAc < 1:785553/143‑1 (MQ=255) gCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCCTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGAc < 2:739442/143‑1 (MQ=255) tACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGc > 1:596349/1‑143 (MQ=255) gggggCGCATTCTAGTGGTCTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGgcgc < 2:99936/140‑1 (MQ=255) aGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGGTTTTCGTCAATAGTTGTTTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:605404/143‑1 (MQ=255) ggCGCTTTCTCGTGGTTTGCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGGGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTc < 1:875430/143‑1 (MQ=255) gcgcATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 2:454193/143‑1 (MQ=255) gcgcATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTGCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 1:1092986/143‑1 (MQ=255) gcgcACTCGAGTGCTTCTCAGCCTTTCGTGAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGGAATTGCTG‑GAAAAATGGCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 2:450185/143‑1 (MQ=255) cATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 1:496999/143‑1 (MQ=255) aTTCTAGTGGTTTTCAGCTTTACGTTAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATAAGACGcgccagcgtcgcatc < 1:1024966/143‑15 (MQ=255) aTTCTAGCGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCGATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATAAGACGcgccagcgtcgcatc < 1:608173/143‑15 (MQ=255) aGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGcc < 1:469088/143‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCATACGAAg > 1:939124/1‑143 (MQ=255) tgcagggtttCGTCAATAGTTAACTAGCGACAGAGGTGGAAGTGCTG‑GAAAAATGTCCATCGGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAg < 1:1017740/136‑1 (MQ=255) tCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCATACGAAgg > 1:934470/1‑143 (MQ=255) cTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGCAGGGCTa > 1:840973/1‑143 (MQ=255) tttCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAAc > 2:1118803/1‑143 (MQ=255) tCAAAAGGTAATTGTCGGCAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCa < 2:982351/143‑1 (MQ=255) cAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAg > 1:428029/1‑143 (MQ=255) cAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAg < 2:728370/143‑1 (MQ=255) cAATAGTTAATTATCGACAGAGGGGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCGATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAg < 1:76611/143‑1 (MQ=255) aaTAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCAAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCGGCCTACGAAGGGCGAACGTGCAgg > 1:906641/1‑143 (MQ=255) aaTAGTTAAGCAGCGACAGAGGTGTAATTGCTT‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAgg < 2:259378/143‑1 (MQ=255) tAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCCG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGtt < 2:866805/143‑1 (MQ=255) aGTTAATTATCGACAGGGGTGTGATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGttt < 1:940467/143‑1 (MQ=255) gTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCGACGAAGGGCTAACGTGCAGGtttt > 1:643515/1‑143 (MQ=255) gTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCAGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGtttt > 1:180509/1‑143 (MQ=255) gTTAATTATCGACAGAGGTGGAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGtttt < 2:947687/143‑1 (MQ=255) gtgaTTATCGACAGAGGTG‑AACTGGTGTGTAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTg < 1:530655/140‑1 (MQ=37) tcaTTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGt < 2:108646/141‑1 (MQ=255) actcaTCGACAGAGGTGTACGTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGAAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTa < 2:786612/139‑1 (MQ=255) tATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCCTCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGt < 2:900898/143‑1 (MQ=255) tATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGGATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGt < 1:926801/143‑1 (MQ=255) gggcGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGt < 1:1053780/140‑1 (MQ=255) tCGACAGTGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCg < 1:742263/143‑1 (MQ=255) tCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCg < 2:235205/143‑1 (MQ=255) aCAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGAt < 2:283482/143‑1 (MQ=255) agagGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATaa < 2:777854/143‑1 (MQ=255) gagGTGGAATTGCTG‑GATAAATGTCCATCAGGAAACTAGTGTACAGGGTTCGTATGGATGCGGGGGCAGGTGCTAGATGGGAGGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGCTCGGATAAg < 1:129969/143‑1 (MQ=25) gtgtAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑Cg < 1:167819/143‑1 (MQ=255) tgtCATCGCTG‑GGAAAATGTGCATCGGGGACCTAGCGTGCCGGTTGGGGGTGCACGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGt < 1:179803/143‑1 (MQ=21) gtAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTTGCCCGTCTTTTCTGGCCTACACGGGGCTAACACGCGGGTTGCGTAGGACGGATAAgcgatg > 1:124253/1‑138 (MQ=255) gtAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGCTACGG‑CGtt > 2:1089280/1‑143 (MQ=255) gtAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGtg > 1:348348/1‑142 (MQ=255) gtAATTGCTG‑GAAAAAGGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGtt < 1:922665/143‑1 (MQ=255) aTTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCAc > 2:162893/1‑143 (MQ=255) tGCTG‑TAAAAATGTCCATCAGGAAACGAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCCGCTGCGACGCTGGCGCGTCTTATATGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCAcgc < 1:394254/143‑1 (MQ=38) tGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCAcgc < 1:67089/143‑1 (MQ=255) tG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGGTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCAcgccgc > 2:630935/1‑143 (MQ=255) tgttaaaaTGTCCATCAGGAAACTAGCGGGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCAcgccgc < 1:956778/139‑1 (MQ=255) tggaactgtGTCCGTCCGGAACCTAGCGTGCTGGTTGGGTATGCTTGCGGGGGCAGATGCTTGTTGCTACGCTAGCCCGTCTTATCCGGCCTACGGAGGGCTAACGCGCAGGTTGTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCAcgccgc < 1:390922/135‑1 (MQ=255) aTCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGCTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCCCATCCGACACGGTa > 1:758880/1‑143 (MQ=255) tCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTCACGTGCAGGTCTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTAt > 2:1029755/1‑143 (MQ=255) cAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACggaaat > 2:213809/1‑139 (MQ=255) cAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTAAGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCAGACACGGTAtt > 2:736242/1‑143 (MQ=255) cAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATATGGCCTACGAAGGGCTCACGTGCAGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCCGTGCA‑GACGCATCCGACACggactt > 1:421469/1‑139 (MQ=255) accaGCCTGCAGGTGTGGTATGCGTGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCCAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGCCACGGTATTCGGCga < 1:178667/140‑1 (MQ=39) aagaGCGTGCAGGTGTGGGCTGCCGGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCCTATCTGGACTAAGAAGGGCTCCCGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGCTCAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGCCACGGTCTTCGGCgc < 1:1070269/140‑2 (MQ=255) ctggCGTGCAGGTTTGGTAGGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCgag < 1:1000260/140‑1 (MQ=255) tAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCGTATCTGGACTACGAAGGGCTAACGTGGGCGTGTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTAACGCCCCAGCCGACGCGGTATTCAGCgaga > 1:130521/1‑143 (MQ=255) aGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAAc < 2:444169/143‑1 (MQ=255) ggttGGGATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGGCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGCGATAATTAGCCt < 2:582033/141‑1 (MQ=255) gTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAAGTAACCt > 2:732970/1‑143 (MQ=255) gTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGCTAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGCGATCATTAACCTttctt > 2:728936/1‑143 (MQ=255) ggcgcgacagatgccagctgcGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGc < 2:251158/136‑1 (MQ=255) gggggCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCgg < 2:180509/143‑1 (MQ=255) gggggCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCgg < 1:301312/143‑1 (MQ=255) ggggCAGATGCCAGTTGCGACGCTGGCGCGTCTGATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCggg < 1:644370/143‑1 (MQ=255) gggCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCGGGt < 2:738441/143‑1 (MQ=255) ggCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCGGGTc < 1:418234/143‑1 (MQ=255) gCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGCCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTCTTCGGCCAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCgggccc > 1:505021/1‑140 (MQ=255) agatgccagatgcGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATCAACCTTTCTTCGCCTGGCGGGGCATa > 2:312782/1‑143 (MQ=255) | AAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTG‑GAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGG‑CGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGGCGGGTCATA > NC_000913/4606419‑4606697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |