| New junction evidence | |||||||||||
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TTGCCACATACTTCTTCCACTACCAGCTTCCGGTCGCCTCTTGCGTCATTATCTCGG‑TGGCGATCTCCCACTTTTTCGTGCAACGCGCTTTTGACAAAAAAGATAAAAATATCAATCACGAACA‑GGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGT‑CCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATT > NC_000913/3375432‑3375902 | attccgcccaggccagaatgctccgcccccctgaaaaccgcatcgacagtgccaatcgtcgttaagcctttcgcaaatatttcacccgcgaccaccagcgttaccacgttggcaaactgcgtacccatgccgtcaaaaaacgcctgcacatcgtccattgtttcgcgcaagttatgcttgcggaagaactcaacaaacatcgtcacagtcaaactcagtaacatcaccaccaccaGATg > 2:92095‑M1/236‑239 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ttttACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAata > 2:939063/1‑239 (MQ=255) ttttACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGCGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGAc < 1:1274816/115‑1 (MQ=255) ttttACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGATGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGAc > 2:1274816/1‑115 (MQ=255) ttttACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTAGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGAAGTTTGCCAACGTGGGAACGCTGGTGGA‑CGCGAGTGacaaa > 2:1277906/1‑235 (MQ=255) tttgtcctgttgtgggtttcaTCCTGAGGTTCGGCTCGGTGTTCCTCGCCCACTTTGGGCTGATGCAGTTAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGGTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAata < 1:994079/219‑1 (MQ=255) gtgATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGaa > 2:72700/1‑239 (MQ=255) cttAATCCTTATTCCCGGTTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTTGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTaa < 1:170214/238‑1 (MQ=255) aTGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGTGGGT‑CGCGGGGGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGAGGATTgg > 2:446051/1‑239 (MQ=255) tGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACCATTGGc > 2:746564/1‑239 (MQ=255) tGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACAACGATTGGc > 2:870953/1‑239 (MQ=255) tctggcctctttttCCTCGCCCCCGTCGGGTTGGTTCAGTCAGAACTGCATTTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCAc < 1:635042/227‑1 (MQ=255) cggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTg > 2:635042/1‑239 (MQ=255) ggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATATGGTGGTGGAGATGTTAAGGAGATTGACTGTGACGAGGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTTCCCGAAACAATGGACGCTGTGCAGGCGCTTTTTGCGGGCATGGTTACGCAGTTTGTCAACGCGGTAACGGCGGTGGTGCGGGGGGGAAA‑AGTTTCGAAAGGCGTAACACAGATTTGCAcggg > 1:40968/1‑236 (MQ=255) 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cTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGGGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTa > 2:803154/1‑238 (MQ=255) aCGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGATTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑cg < 1:75130/177‑1 (MQ=255) aCGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGTG‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGAACTGTCGAGGCGGTTATCAggggg > 2:220209/1‑239 (MQ=255) aCGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑cg > 2:75130/1‑177 (MQ=255) tCGGGCTGTTGCTGTCTGAACTGCATCTGGGGGTGGTGATGTTACTGAGTTGGGCTGTTACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGAAGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCg < 1:1117624/239‑1 (MQ=255) tCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGGATCTGGTGGTGGGGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGc < 1:1277462/144‑1 (MQ=255) tCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGc > 2:1277462/1‑144 (MQ=255) ggCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCgggg > 2:1213573/1‑237 (MQ=255) GATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCAtt > 1:1213573‑M1/1‑239 (MQ=255) | TTGCCACATACTTCTTCCACTACCAGCTTCCGGTCGCCTCTTGCGTCATTATCTCGG‑TGGCGATCTCCCACTTTTTCGTGCAACGCGCTTTTGACAAAAAAGATAAAAATATCAATCACGAACA‑GGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGT‑CCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGT‑CGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGCGGAGCATT > NC_000913/3375432‑3375902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |