| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,209,178 | T→G | 13.9% | V386G (GTG→GGG) | ttdT → | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,209,178 | 0 | T | G | 13.9% | 269.2 / 4.5 | 124 | V386G (GTG→GGG) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/57); new base G (20/3); total (64/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
ATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTG‑GTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGC‑TGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGT‑GTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGC‑GGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAACGGCGGATTACTGGCGAC > NC_000913/3208940‑3209405 | tttcgtGCCGCGGTGGTGGGTTTCAGGGGG‑GTGGCAATGATGGTGCTTCTGCGGATTATCAGTTGGGACGTCATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGC‑TGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTgtggt < 1:821814/234‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |