| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 252,387 | G→A | 13.0% | K29K (AAG→AAA) | yafO → | mRNA interferase toxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 252,387 | 0 | G | A | 13.0% | 189.5 / 3.6 | 78 | K29K (AAG→AAA) | yafO | mRNA interferase toxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (20/47); new base A (9/2); total (29/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.64e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.59e-01 | |||||||||||
ACATGCTTGCTGAACAAGAGGAGAAAAAGCCCATAAAGGCGCGCTTCCGTCCAAGTGCTGCAAGATTAGAGGAAATTACACGCCGCGCTGAACAATATCTTAATGATATGACGGATGATGATTTCAATGACTTTAAGGAATAAGGATGCGGGTATTCAAAACAAAACTTATTCGCCTGCAACTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGC‑GTGACGGTGTTTTGCCAGATATATTTG‑GTCGCGA‑TGCACTCTACGACGACTCCTTTACCTGGCCATTAA‑TCAAATTTGA‑GCGAGTTGCTCATATTCATCTGGCAAAT‑GAGAATAATCCATTTCCGCCACAGTTGCGCCAATTCAGCAGAACGAATGACGAAGCGCATTTGGTATATTGTCAGGGGGCGTTTGATGAGCAAGCATGGTTGCTCATTGCCATTCTGAAACCTGAA > NC_000913/252156‑252621 | aCATGCTTTGGGAAAAAGAAGAAAAAAAGCCCAAAAAGGCGCTGTTCCTGCCAAGTGCTGCAAGATTTGAGGAAATTACAATGCGCGCTGAAAAATATCTTAATGATATGACGGATGATGATTTCAATGACTTTAAGGAATAAGGATGCGGGTATTCAAAACAAAACTTATTCGCCTGCAACTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGC‑GTGAc < 1:239670/238‑1 (MQ=255) 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ACATGCTTGCTGAACAAGAGGAGAAAAAGCCCATAAAGGCGCGCTTCCGTCCAAGTGCTGCAAGATTAGAGGAAATTACACGCCGCGCTGAACAATATCTTAATGATATGACGGATGATGATTTCAATGACTTTAAGGAATAAGGATGCGGGTATTCAAAACAAAACTTATTCGCCTGCAACTTACAGCAGAGGAACTTGATGCGTTAACGGCGGATTTTATTTCCTATAAGC‑GTGACGGTGTTTTGCCAGATATATTTG‑GTCGCGA‑TGCACTCTACGACGACTCCTTTACCTGGCCATTAA‑TCAAATTTGA‑GCGAGTTGCTCATATTCATCTGGCAAAT‑GAGAATAATCCATTTCCGCCACAGTTGCGCCAATTCAGCAGAACGAATGACGAAGCGCATTTGGTATATTGTCAGGGGGCGTTTGATGAGCAAGCATGGTTGCTCATTGCCATTCTGAAACCTGAA > NC_000913/252156‑252621 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |