Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,308,006 | 0 | C | A | 9.8% | 420.1 / 5.5 | 147 | intergenic (‑75/+32) | yrbN/nlpI | uncharacterized protein/lipoprotein involved in osmotic sensitivity and filamentation |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (74/55); new base A (2/14); total (77/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.96e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GGTTTTTCGTAACCCAGATCGTTAAGGGCTTCAAGGATAGGAGCCTTCAGGCCCAGATCTGCAAAAGTGGTTTCGAATTCAGCCATGTAGTACGTGTGCCTCAAAATTAATGGCGGCCAGTCTACATAACTCATCATGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTACGGGCTGATGTGTACGTCAG‑CTATTGCTGGTCCGATTCTGCCAGGTCATCTTGGTCCTGGCCCAGGAGCGATAATTCCAACAATGCGTATCGGTGCTCAACAAAGTTATGAACGTTGTTGGCAACCGCCAGTTTGAACAGTGCCGTGGCGCTGTCCAAATCCCCCAGACTTAGGTAGTACTTACCTAAATAGAAGTTGGTTTCACTGAGATGCTCAGCGAGCGAGG > NC_000913/3307773‑3308243 | tCGTAACCCAGATCGTTAAGGGCTTCAAGGATAGGAGCCTTCAGGCCCAGATCTGCAAAAGTGGTTTCGAATTCAGCCATGTAGTACGTGTGCCTCAAAATTAATGGCGGCCAGTCTACATAACTCATCATGAAATTGATCAGCAATTTTCATTGAAAAGTGTGAACCGGCTCAAAGTAGGTGTATTAACGAACAACAACGCCCTCACCCGTTAAGGTGATGGCAATCAAAAAAGATTa < 2:458051/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |