Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,417,904 | T→G | 12.4% | G958G (GGT→GGG) | acrF → | multidrug efflux system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,417,904 | 0 | T | G | 12.4% | 345.0 / 2.4 | 135 | G958G (GGT→GGG) | acrF | multidrug efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/69); new base G (19/4); total (62/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TGTGGTTGTTTTCCTGTGCCTTGCTGCACTCTATGAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCTTTGTGGTGATCCGCCGTTGCTTTAAAGGATAAATCAG > NC_000913/3417670‑3418140 | tgtgGTTGTTTTCCTGTGCCTTGCTGCACTCTATGAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGTGTTCCCTAACA‑ATCTCATGGGGTAAGAGGGGAAAGGtgttt > 2:909194/1‑238 (MQ=255) ttttttccgtggctttGCTGCCTTTTATGAAAGGTGGGCAATTCCTGTCTCGGGTATGGTGGGAGGGCCGGTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTTTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAg < 1:1002406/225‑1 (MQ=255) gttTTCCTGTGCCTTGCTGCACTCTATGAAACCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGTGACGCTCTTTAATCCAAAAAATGTCGTCTACTTTTTGGTGGGCTTCCTAACCAAAATTGGACTATCGGCCAAAAACGCAGTTTTTTTCGTTTGGATGGCTTAAGAATTTACTGGGAAAAGAGGGAAAAGGTGTGTTTGaga > 1:104407/1‑237 (MQ=255) ttttTCTGTGCCTTGGTGCACTTTATGAAAGCTTGTAAATTCCTTTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGGCTGTGTGCTGCTGGCGGCGACACTCGTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTATCGATAATTGGCTGGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCGAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCg < 1:936590/239‑1 (MQ=255) ccTTGCTTCACTTTTGGAAAGGTGGTCAATTCCTGTCCTGGTTATGTTGGTTGTGCCGTTAGGGATTGTCGGGGTGCTGCTGGCGGGGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATgg < 1:1296414/239‑1 (MQ=255) ttGCTGCACTATATGAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGGGCCGTTAGGGATTTTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCa < 2:612899/239‑1 (MQ=255) gctgcACTCTATGAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGt < 2:932809/239‑1 (MQ=255) ctctATGAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGTTGGGCTTGCGAACGACAATTGGCTTGTAGGCCCAAAACACCATTTTGATCGTTTGGTTTGCATAAG‑GTTTCCTGGGGGAAGGAGGTAAAGGGGTTTTTAAAGCGACACGGATGGCatgaggtag > 1:1250244/1‑231 (MQ=255) ctATGAAAGCGGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTACTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGCCTACTTTATGGTTGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTTTCGGCCACAAACGCTCTTTTGATGCTTGAGTTCGCTAAAA‑TTTTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGATACGAAACTGATgcaaggaggaaggc > 1:573718/1‑226 (MQ=255) tATGAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCTTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCTTGGAGAAAGGGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGACAATGATGGCAgggagaatgcg > 1:1041221/1‑229 (MQ=255) gAAGGCCGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTTCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAtgcgtct < 2:680266/239‑1 (MQ=255) gAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAtgcgtct < 2:1041221/239‑1 (MQ=255) aGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAtgcgtctgcg < 2:229041/239‑1 (MQ=255) ttgttaaTTCCTTTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAtgcgtctgcgtc < 1:680304/233‑1 (MQ=255) tggttcaTTCTTGTTCCGGTTATTGTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCCGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAtgcgtctgcgtc < 1:863867/232‑1 (MQ=255) ggTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGAGGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGTTAGTTGGGTTCGCCAACA‑GTTTCTTGGGGAAAGAGGGATAAGGGGTGTTTTAAGCGAAAATGTGGGCAGtcagatagggtcgtgt > 1:1243721/1‑220 (MQ=255) ggTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCt > 2:244499/1‑239 (MQ=255) ggTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGGATGCGTCTGCGCCCt > 2:666831/1‑239 (MQ=255) gTCATTTCGTGTCTCGGTTATGTTGTTAGTTCCGTGAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGGGGCGACTCTCTTTAATCAAAACAATGAATGCTACTTTATTGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTa < 1:1055332/239‑1 (MQ=255) ttgtccGGTCATGTTAGTTGGGCCGTGGGGGATTGACGGCCTCGTTGTGGAGGCGCCACACTTTAATCAAAAAAATGACTCCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGAAAATTGGATTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTAACCtgatga < 1:1133461/234‑1 (MQ=255) gtttcGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGAc < 2:829914/236‑1 (MQ=255) ggTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGCGTTCGCTAAAC‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTAGTTGAAGCGCACCTGATGGCAGTACGTATGCGTATGCGTCCTATCCGGTTGACatct > 2:45447/1‑238 (MQ=255) ggTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGCGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGAACCTGATGGCAGTACGGATGCGTCTGCGTCCTTTCCGGGTGAcccccc > 1:1211777/1‑235 (MQ=255) gTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGGGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAtgc > 2:1264907/1‑211 (MQ=255) ttttttttgtaggtccGTGAGGGTTTGTGGGTGTGTTGTTGGGGGCGACTCTCTTTAATCAAAAAAATGAGGTCTACGTTATGGTTGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACctctct < 1:174189/224‑1 (MQ=255) ttttGTTTGTGGTGCCGGTAGGGATTGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGGCCCTCTTTAATCAAAAAAAGTGCGGCTACTTTATGGTTGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACctctct < 1:1022968/235‑1 (MQ=255) ttATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGGCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACctctct < 2:92228/238‑1 (MQ=255) ttATGGTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAGG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACctctct < 2:1250244/238‑1 (MQ=255) ctgtttttgttgTGCCGTTAGGGATTGTCGGGGTTGTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACctctct < 1:214142/227‑1 (MQ=255) tATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTCTTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGCGTTGTTGAAGCGACACTGATGCCAGTACGGATGCGTCTGCGTCCTATCCTGAGGCCCcctctc > 2:891826/1‑238 (MQ=255) aGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTAtt > 2:546578/1‑238 (MQ=255) aGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGAAACTGATGGCAGTACGTATGGGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTAtt > 2:833948/1‑238 (MQ=255) gggCCGTTAGGGATTTGCGGGGGTGTGCGGGCGGCGACCCTTTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATtct < 1:941384/237‑1 (MQ=255) gTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCGGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTTCTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATtct < 2:1297520/239‑1 (MQ=255) cttcctttAGGGTTTTTCGGCTTGCTGTGGGGGGGAACGCTCTTTAAGCAAAAAAATGGCGTCATCTTGAGGGTGGGCTTGCTAACGACAATGTGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTGTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACCCTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTGTCGTCTTTATtct < 1:887736/233‑1 (MQ=255) tGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAg < 2:808857/174‑1 (MQ=255) tGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAg > 1:808857/1‑174 (MQ=255) gCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATtctc < 2:487197/238‑1 (MQ=255) ccGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGGGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGCCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTTTTCTCg > 2:874120/1‑238 (MQ=255) ccGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTGGCCTTTAtt > 2:214142/1‑234 (MQ=255) gTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCg‑ct > 2:804054/1‑239 (MQ=255) tCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGttgttg > 2:406836/1‑156 (MQ=255) tCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTTGGC‑GTATTACCg‑ct > 2:1143389/1‑238 (MQ=255) cGGAGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCg‑ctag < 2:355161/239‑1 (MQ=255) tgctgcTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGGGACACTGATGGCAGTACGTAGTCGTGGGCGTCCTATCCTGTTGACCCCTCTCGCCTTTTTTCTCGGG‑GTATTACCG‑CCAGCTATc > 1:779825/1‑239 (MQ=255) ggcggcGAAACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCGTCTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAGGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACg < 2:1221422/239‑1 (MQ=255) gcggcgACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCCCTCGCCTTTATTTTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCCGTAACg‑g > 2:919957/1‑239 (MQ=255) gggaacacTTTTTAATCAAAAAAATGACGTTTACGTTGTGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGGTCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑Gt < 1:145657/234‑1 (MQ=255) cgACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATgg < 2:190800/153‑1 (MQ=255) cacTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGc > 2:145657/1‑239 (MQ=255) tttAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGAAACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCCCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAATAACG‑GGTCCGCCAgggg > 1:345905/1‑239 (MQ=255) ttAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGgc < 2:345905/239‑1 (MQ=255) tCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGgcgcgc > 2:810693/1‑239 (MQ=255) taaaaaaAGTCTTTTATTTTAGGGTGGGGTTGCTAACGACAATTGGCTTGTGGGCCAAAAACGCTATGTTGATCGTTGAGTTCGCTTAAG‑ATCTCATGGAGAACGAGGTTAAAGGTGTTTTGAAAGCGCCACTGATGGCAGTACTTGTGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCAATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAg < 1:691579/238‑1 (MQ=255) aaaaaaTGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTTTGTTCGCTAAAG‑GTCTCATGGGGAAAGGGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGGAGTGATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTATCTCGCCTTTATGTTCGGT‑GTATTTCCGACCAAC‑ATTAGTAACG‑GTGCCggacagggggcgcaaa > 1:1266671/1‑225 (MQ=255) aaaaaaTGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTACCTATCAGTAACG‑GTCCCGGCATGGGCGCGCAgg > 1:763598/1‑238 (MQ=255) aaaaaaTGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGGCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGa < 2:573718/239‑1 (MQ=255) aaaaTGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAGGGTGTTGTTGAAGCGCCACTGATGGCAGTACTTATGCGTCTGCGTCCTTTCCTGATGACCTCACTCGCCTTAATTCTCGCC‑GTCTTACCG‑CTGGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGGTGCGCGCAGaa > 1:1317163/1‑238 (MQ=255) cGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCtgt < 2:968859/237‑1 (MQ=255) cGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTgg > 2:1037693/1‑239 (MQ=255) aCTTTATGGTTGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATc < 2:1087580/239‑1 (MQ=255) tggtggGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTCCCGGCAGTGGCGCGCAAAA‑CGCGGTggggtgcggggaa > 1:415375/1‑229 (MQ=255) tggtggGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGAGTTGTTGAAGCGACAATGATGGCAGTACGAATGCGGCTTCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GGATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTTCCGGCAGTGTCGCGACGAA‑CGCTTTGGGCACCGGGGTa > 2:730121/1‑239 (MQ=255) tgggggGCTTGCGAACTGCCATTGGCTTGTCGGCCAAAACCGCTATTTTGAGCGTTGAGTTCGCGAAAG‑ATCTCATGGAAAAAGGGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACCCTGATCGCAGTGCGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACA‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTa < 1:233495/239‑1 (MQ=255) tggGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAAt < 2:1092827/238‑1 (MQ=255) tggCTTGCTAACGCAAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGAGCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATgg < 1:636825/238‑1 (MQ=255) ggggtggCTAACGACAAGTGGCTTGTCGGCCAAAATCGCTATTGTGAACGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAATAGGTTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAGGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGTCCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATgg < 2:608008/233‑1 (MQ=255) ggCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAACACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTAGGCGTCTGCGTCCTAACATGATGAGCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTTTTACCT‑CTAGCTAACAGTAACG‑GTTCCGTCAGTGGCGGGCAGAA‑CCCTGTGGGTATTGGGGGGATggg > 1:1133812/1‑239 (MQ=255) ggCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGGGCAGAA‑AGCTGTGGGTATCGGGGTAAgggg > 1:1140081/1‑239 (MQ=255) ggCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGGAATggg > 2:674019/1‑239 (MQ=255) ggCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGAACCC‑GTTCCGCCAGTGGCGCGCAAAA‑ccagagggggatcgggtcaaaggg > 1:389129/1‑216 (MQ=255) ggCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTCCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGCGTTGTTGAAGCGACACTGTTGGCAGTACATATGCGTCTGCGCCCTCTCCTGAGGTCCTCTCTGGCCTTT‑TTCTTTGCGGTCTTACCG‑CTAGCTATCCGTAACC‑GGGCCCGAATTGGCCAGCAACA‑CCCTGCGGGAATCcgggacacgtg > 1:438186/1‑232 (MQ=255) ggCTTGCTAACGAAAATTGGCTTGTCGGCCAAAATCGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGGGGGTAAAGGCGTTGTTGAAGCAACACTGATGGAATAACGTATGCGTCTGGGGCCTATCCTGAGGACATCTCACGCCTTTATTCCCGGC‑GATTTACCG‑CTAGCTGTC‑GTACCGTGGGCGGGCAGTGGCGAGCAGAAGCGC‑GGGGGTAGCGGGGAAGTggt > 1:724559/1‑238 (MQ=255) ttGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCTTGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGTTGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTAACG‑CTGGCTATCAGCAACG‑TGGCCGGCAGGTGGGCCACGAA‑CGCTGTGGGGAGCGGGGAAAAgggggg > 1:1082861/1‑239 (MQ=255) cTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATtct < 1:578948/158‑1 (MQ=255) tAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATg < 2:59648/239‑1 (MQ=255) aaCGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGACGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATg < 2:1293844/238‑1 (MQ=255) aTTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTACCG‑GGGCCGTCCGGTGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGGATCGGGGGCAAGGGGGGAAGGGgctgggc > 1:1309461/1‑235 (MQ=255) ttGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCGGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGAGCAGAA‑CGCTGGGGGTATCTGGGTAATGGGGGGACAGGTCTCGGcc > 1:1192706/1‑238 (MQ=255) ggcGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCGCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGc < 2:104407/237‑1 (MQ=255) gTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGc > 2:167879/1‑239 (MQ=255) aaaaaCGGTTTTTTGGTTTTTGAGTTCGCTTAAG‑ATTTCATGGAGAAAGAGGGTAAATGTTGTGTTGAAGCGACACTGATGGCAATACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAAt < 1:970360/239‑1 (MQ=255) ttttttGTGCGTTGAGTTCGGTAAAG‑GTTTCAGTGAGAAAGGGGGAAAAGGGGTTGTTGAAGCGACACTGATGGGAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCGCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCg < 1:16877/237‑1 (MQ=255) tATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCg < 2:1140081/239‑1 (MQ=255) tttttttgTTGAGTTCGGTTAAG‑TTCTTATGGAGAAAGAGGGTAAAGGGGTTGTTGAAGCGAACCTGATGGCATTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTAc < 1:833948/232‑1 (MQ=255) ggtgggtgtgtCGCTAAAG‑TTCTAATGGAGAGATGGGGTAAAGGTGTTGTTAGAGGTACACTGCTGACAGTACGTAAGCGTCGGCGTCCTATCCTGATGACCCCGCGCGCCGTTGTTGTCGGC‑GGATGACCG‑GTAGCTATCAGTAACG‑GTGCGGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCGCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTGCGTACCGgt < 1:1279511/229‑1 (MQ=255) aTCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGgt < 2:121685/239‑1 (MQ=255) aTCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGGTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGgt < 2:763598/239‑1 (MQ=255) ttggTTCGTTAAAG‑ATTTCATGGAGAAAGGGGGTAAAGTGGTTGGTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTTATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGT‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCt < 1:919957/236‑1 (MQ=255) tGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAC‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGGATGGGCTCGGACAGGTTTCTGGGAAACTTCTTGGAACGGGGGTTCt > 1:1259739/1‑239 (MQ=255) taagggccggtGGGGAAAGGGGGTTTATGTTTTTTTTAAGCGACCCTGATGTCATTACGTTTGCGTTTGCGTCCTATCCTGAGTCCCTCTCTGGCCTTTATTCCCGGG‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAC‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCTTTGTGGTGAt < 1:451450/229‑1 (MQ=255) ttctgggtgaAGGAGGGTAAAGGGTTTGTTGGAGCGCACCTGATGGCAGTACGTTGGCGGCTGGGTCCTCTCCTGATGACCTCGCTCGCTTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCGGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCTTTGTGGTGATccgccg < 1:244499/231‑1 (MQ=255) tcagtgaaaaaGAGGTTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACCATGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTAGCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTGTTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTGCGTACCGGTGTTCTTTGTGGTGATCCGCCGt < 2:950280/231‑1 (MQ=255) tcATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACctctct > 2:1088353/1‑85 (MQ=255) tcATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACctctct < 1:1088353/85‑1 (MQ=255) agagGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CCGTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGTGCTCTACAACGTTGCGGGACATGTTCTTAGCACCGGGGTTCTTTGTGTGGATCCGCCGTTGCTTTAAAg > 1:1014972/1‑239 (MQ=255) gttAAGGGTTTGGTTGAAGCGACATGTATGGCAGTACTTATGGGTTGTCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCGCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCTTTGTGGTGATCCGCCGTTGCTTTAAAGGAt < 1:877079/236‑1 (MQ=255) ggTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCTTTGTGGGGATCCGCCGTTGc > 2:451450/1‑228 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCTTTGTGGTGATCCGCCGTTGCTTTAAAGGTTAAATc > 2:382612/1‑239 (MQ=255) tgttgtTGAGCCGACATTGATGGCATGTCGTATGGGTCCGGTTCCTGGCCGGAGGCCCTCTCTCGTCTTTATTCGCCGT‑GTATTACCG‑TTAGCGATCAGTAACG‑GTGGCGACAGTGTCGCGCATAA‑CGGTGTGGGGATCGGGGTAAAGGAAGGAATGGTCCTGGCAACGTTGGTGGAAATCTTCTTCGTACCGGTGTCCTTTGTGGTGATCCGCCGTTGCTTTAAAGGATAAATCAg < 1:978101/237‑1 (MQ=255) | TGTGGTTGTTTTCCTGTGCCTTGCTGCACTCTATGAAAGCTGGTCAATTCCTGTCTCGGTTATGTTGGTAGTGCCGTTAGGGATTGTCGGCGTGCTGCTGGCGGCGACACTCTTTAATCAAAAAAATGACGTCTACTTTATGGTGGGCTTGCTAACGACAATTGGCTTGTCGGCCAAAAACGCTATTTTGATCGTTGAGTTCGCTAAAG‑ATCTCATGGAGAAAGAGGGTAAAGGTGTTGTTGAAGCGACACTGATGGCAGTACGTATGCGTCTGCGTCCTATCCTGATGACCTCTCTCGCCTTTATTCTCGGC‑GTATTACCG‑CTAGCTATCAGTAACG‑GTGCCGGCAGTGGCGCGCAGAA‑CGCTGTGGGTATCGGGGTAATGGGAGGAATGGTCTCTGCAACGTTGCTGGCAATCTTCTTCGTACCGGTGTTCTTTGTGGTGATCCGCCGTTGCTTTAAAGGATAAATCAG > NC_000913/3417670‑3418140 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |