Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,532,593 | C→A | 13.8% | intergenic (‑156/‑223) | yhgE ← / → pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,532,593 | 0 | C | A | 13.8% | 344.6 / 4.6 | 125 | intergenic (‑156/‑223) | yhgE/pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (79/25); new base A (2/18); total (81/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.39e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GGTAGCAAACCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCC‑AGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTTAATTATCGCATCCGGGCA‑GTAGTATTTTGCTTTTTTCAGAAAATAATCAAAAAAAGTTAGCGTGGTGAATCG‑ATACTTTACCGGTTGAAT‑TTG‑CATCAATTTCATTC‑AGGAATGCGATTCCAC‑TCACAATATT‑CCCGCCATATAAACCAAGATTTAACCTTTTGAGAACATTTTCCACACCTAAAATGCTATTTCTGCGATAATA‑GCAACCGTTTCGTGACA‑GGAATCACGGAGTTTTTTGTCAAATATGAATTTCTCCAGATACGTAAATCTATGAGCCTTGTCGCGGTTAACACCCCCAAAAAGACTTTACTATTCAGGCAATACATATTGGCTAAGGAGCAGTGAAATGCGCGTTAAC > NC_000913/3532359‑3532827 | gCAAACCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCC‑AGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTTAATTATCGCATCCGGGCA‑GTAGTATTTTGCTTTTTTCAGAAAATAATCAAAAAAAGTTAGCGTGGTGAATCG‑TTACTTTACCGGTTGAAT‑TTG‑AATCAATTTCATTC‑AGGAATGCGATTCAAC‑TCACACAATT‑c > 2:890790/1‑238 (MQ=255) 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> NC_000913/3532359‑3532827 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |