| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,062,374 | T→G | 8.1% | G43G (GGT→GGG) | yihN → | MFS transporter family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,062,374 | 0 | T | G | 8.1% | 534.7 / 4.3 | 204 | G43G (GGT→GGG) | yihN | MFS transporter family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (75/105); new base G (18/4); total (94/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.52e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
AACCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCG‑TTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCGCTGAAAGATGCGTTTTATATCCCGATGCA‑GGAATATTTCCATTTGAC‑CAATGGTCAAATTGGTAATGCTATGTCGGTAAACT‑CATTTGTCACCA‑CAGT‑GGGCTTTTTTCTGTCTATTTATTTTGCCGATAAACTACCGCG‑CAGATACACCATGTCATTCTCACT‑CA‑TTGCGACAGGATTACTGGGTGTTTATTTGACGACAATGCCGGGGTATTGGGGCATCCTCTTTGTCTGGGCGCTATTTGGCGTTACTTGCGACATGATGAACTGGCCGGTCTTGCTCAAGTC > NC_000913/4062136‑4062607 | aaCCACTAATAAGTTTTAACTCATACGCAGTTAATAAAACCATTCCATATGAATGGTCGGTATCTTATTGCCTTTAAAACAGTGATTTTAAAAATCGCTTAGGGGATGTTATGCTCACGAAAAAGAAATGGGCG‑TTATTTAGTCTATTAACACTGTGTGGCGGTACAATTTATAAATTACCGTCCCTTAAAAATGCGTTTTATATCCCGATGCA‑GGAATATTTCCATTTGAC‑CAATGGt > 2:596072/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |