| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,136,803 | A→G | 15.2% | S233G (AGC→GGC) | yijE → | EamA‑like transporter family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,136,803 | 0 | A | G | 15.2% | 269.1 / 5.4 | 121 | S233G (AGC→GGC) | yijE | EamA‑like transporter family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/50); new base G (20/2); total (68/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTGGGCGCTGGCCTACAGTGCGATTCTGGCGACGGCACTGGCGTGGAGCTTATGGT‑TGTTTGTATTGAAAAACTTGCCTGCCAGTATTGCCAGCTTAAGCACA‑CTGGCCGTT‑CCCGTTTGCGGCGTACTCTTTTCCTGGTGGCTGCTCGGCGAGAATCCGGGGGCCGTTGAAGGTAGCGGTATTGTGCTGATTGTGCTGGCACTGGCGCTGG‑TGAGCCGTAAGAAAAAAGAAGCCGTCAGTGTAAAAAGGATCT‑GAATTTTTTCTTCATGTGGGGCGATC > NC_000913/4136566‑4137036 | gCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCCTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTAGGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTGGGCGCTGGCCTACAGTGCGATTCTGGCGACGGCACTGGCGTGGa < 2:989419/238‑1 (MQ=255) 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GCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTGGGCGCTGGCCTACAGTGCGATTCTGGCGACGGCACTGGCGTGGAGCTTATGGT‑TGTTTGTATTGAAAAACTTGCCTGCCAGTATTGCCAGCTTAAGCACA‑CTGGCCGTT‑CCCGTTTGCGGCGTACTCTTTTCCTGGTGGCTGCTCGGCGAGAATCCGGGGGCCGTTGAAGGTAGCGGTATTGTGCTGATTGTGCTGGCACTGGCGCTGG‑TGAGCCGTAAGAAAAAAGAAGCCGTCAGTGTAAAAAGGATCT‑GAATTTTTTCTTCATGTGGGGCGATC > NC_000913/4136566‑4137036 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |