| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,193,508 | A→C | 9.9% | V220G (GTG→GGG) | mrp ← | antiporter inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,193,508 | 0 | A | C | 9.9% | 309.0 / 2.0 | 124 | V220G (GTG→GGG) | mrp | antiporter inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/41); new base C (4/13); total (70/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.93e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ACCACCGGTACCGAAAATCGGTTCATGGTGACCACAGTTACTGCAAATATGCACACTCATGTTCTCGACAATACCGAGCACCGGAACCTCGACTTTCTCGAACATCACAATGCCTTTTTT‑CG‑CATCGATCAGCGCGATGTCCTGCGGGGTGGTGACCACGACTGCACCGGTTACTGGAATGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACA‑AGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACACCATCGCATTGTCGTCAGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCAGGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGATGGGCCGTAGATATCGGCGTCCAGAAT > NC_000913/2193276‑2193746 | accaccGGTACCGAAAATCGGTTCATGGTGACCACAGTTACTGCAAATATGCACACTCATGTTCTCGACAATACCGAGCACCGGAACCTCGACTTTCTCGAACATCACAATGCCTTTTTT‑CG‑CATCGATCAGCGCGATGTCCTGCGGGGTGGTGACCACGACTGCACCGGTTACTGGAATGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCCCCCGAt > 2:528445/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |