| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,978,861 | A→C | 26.2% | T88P (ACC→CCC) | wzyE → | putative ECA polysaccharide chain elongation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,978,861 | 0 | A | C | 26.2% | 88.6 / 3.6 | 62 | T88P (ACC→CCC) | wzyE | putative ECA polysaccharide chain elongation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/16); new base C (4/15); total (31/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACAGTCAGATCTTTTCCAGTGAAGTCTCCGGCGTGGCGTTAAAACGCTTCTTTTAC > NC_000913/3978637‑3979088 | ggCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTTGTGCAGGCGTTGGTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTTCTATTT‑CACCt > 2:493133/1‑228 (MQ=255)ggCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGTCGTTTCTTTCTCCGGGCTGCTCCTACCCGGTTTACTATTT‑ccccc > 2:626897/1‑227 (MQ=255) ctgctCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTTGCCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTa < 1:287220/227‑1 (MQ=255) tGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTTCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAAccc > 1:498528/1‑229 (MQ=255) tGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GGTTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGGTGCTTTCTGGGGGCTGCTTCTACGCGGTTTCCTATGT‑CACCTACAAAAc > 2:287220/1‑227 (MQ=255) cGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCTGCCTGCTTCTACGCGGGTTACTCTGT‑CCCCTACAAAACCCGCCt > 1:25506/1‑229 (MQ=255) gCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGACGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTCCTCCTACGCGGATTACTATGT‑AACCTACAAAAccccccca > 2:335736/1‑227 (MQ=255) cACGTTGCCCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCTCTTTATCTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTT‑TTTTTGCTCGCCTTTTGCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CCCCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGt < 1:687244/228‑1 (MQ=255) cACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CCCCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGt > 2:129646/1‑228 (MQ=255) cACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAATACCCGCCTACGCAACCGCGt > 1:262206/1‑228 (MQ=255) cGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTTTCGCGCCGCCAGCAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTCCTACGCGCTTTACTATTC‑CCCCTACAAAACCCCCCTACGCaacaccgttgg > 2:285091/1‑220 (MQ=255) cGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTCCGCGGTTTACTATGT‑CACCTCCAAAACCCGCCTACTCAAACGCGTTg > 1:269938/1‑228 (MQ=255) cGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CCCCTACAAAACCCCCCTACGACAACCCGtgg > 2:172442/1‑226 (MQ=255) gCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTTCCCTTTAACTCCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGC‑TTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTg < 1:85428/229‑1 (MQ=255) 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tcttctTTTCATGGCTG‑TTTTTGCTCTCGTTTTTCTGCGGCTTCCCGCTGCCCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAACCCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGAc < 1:626898/229‑1 (MQ=255) ttttCATTGCTG‑TTTTTGCTCCCCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGTTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATc < 1:435770/229‑1 (MQ=255) aTTTCTT‑TTTTTTCTCCCCTTTTGTTGCGGCTTCCCGTTGGCCGGCGTGCTGGTTTTTCGTTTGG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATTTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACg < 2:491236/229‑1 (MQ=255) tGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACAAATCTTActgg > 1:660404/1‑226 (MQ=255) gtttttttGCTCCCCTTTTTGTGGGGCTTCCCGCTGCCCAGGGGGGTGGTA‑TTCGGTTTGTGTGTGG‑GTGCGGCGCCGTCAGAAATGTTGTTGCGGTCGTTGCTGTCTGCGGGCTGCTTCTGCGCGGTTTACTATGT‑CCCCTAAAAAACCCGCCTACGCAAACGCGGTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTggg < 2:642719/226‑1 (MQ=255) cgttttttGCTCACTTTTTCCTTCGGCTTCCCGCTGGCCAGCGTGCTTGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTTGCGCGCCGCCAGAAATCTTTTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTggg < 1:194141/226‑1 (MQ=255) 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cttcGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATcgc < 1:129646/228‑1 (MQ=255) ctccggtctccccgtgcccAGCGTGCTGGTTTTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GGTTCGCGCCGCAAGAAATCTTGTTGCAGTCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATcgcg < 1:632857/212‑1 (MQ=255) ggCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTCCGCAAACGCGTTGCTGATGTCCCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGGACCCAATCTTACGGGGGGGATCCTGTTGGGTATcggccggg > 2:308652/1‑223 (MQ=255) tcTTCCCCGTGCCCGGTGTGCTGTTTTGTTGGTTTG‑ATGTTG‑GGGTCGCGCCGCAAGAACTCGTGTTGGAGGGGTTGTTTCCGGGGGGCTGCTTCTCCGGGGTTTACTATGT‑CCCCTACAAACCCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCACGCTGGt < 2:22670/228‑1 (MQ=255) gttccccgtttcacgggtggCTGTTTTTTCGTTTTG‑A‑GTTGTGGGTCGCGCCGCCAGAATCTTTGTTGCCGGGTTTGTTTTCGGGGGGTGGCTTCTGCGCGTTTTATTATGT‑CCCCTTCAAACCCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGt < 2:230278/210‑1 (MQ=255) cTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGTGGCTCCTGATGGGTATCGCGCTGGt > 1:462123/1‑228 (MQ=255) cccGCTGACCCGCGTGCGGTGATTTCGCTGTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGGGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTAT‑T‑CCCCTCCAAACCCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCg < 1:28731/229‑1 (MQ=255) ccGCTGACCTGCGTGTTGGTTTTTCGTTTTG‑ATGGTG‑GTGGCGCGCCGCAAGAAATCTTGTTGGCGGCGTTGGTTCTGGGGGGCTTCTTCGACGCGGTTTACTATGG‑CCCCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTATGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCg < 2:225014/229‑1 (MQ=255) agttgttgggTTTTTCGTTTTG‑TTGTGG‑GTTGCGCGCCGCCAAAAATCTTGTGGGAGGCTTTGTTTTCTGCGGGCTTCTGTTACGGGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCAtct < 2:498528/221‑1 (MQ=255) cGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCCtcttc > 1:20703/1‑229 (MQ=255) tGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCTCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTCCTGCTGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGAc > 1:645534/1‑172 (MQ=255) tGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCTTCCGCTGTTTACCATGAACCGCCTGGGGACCACTCTTACGTGGGGGATCCTGATGGGGATCGCCCTGGTAAGCGTCGGCACCttcttc > 2:560048/1‑227 (MQ=255) ttG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCTTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCCCTGTTTACCATGAACCGCGTGGATACCCATCTTCCTTGGGTGATCCTGATGGGTAACAGCCTGTACACCGCCGGCACCTTCTTCATGCCCAACGGCt > 2:104673/1‑228 (MQ=255) ttG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCt > 1:542092/1‑228 (MQ=255) ttttG‑GGGTCGCCGCGACAAAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTGTGCGGGCTGTTTCTACGCGGTTTACTAGGT‑CACCTACAAACCCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTg < 1:672087/227‑1 (MQ=255) g‑gTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTg > 2:526304/1‑228 (MQ=255) 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> 1:479396/1‑229 (MQ=255) tGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGGGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGCCATCTTCTTCATGCACACCGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACAGCCAGATCTTTTCCAg > 2:227946/1‑229 (MQ=255) ttCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACAGTCAGATCTTTTCCAGTGAAGTCTCCggcgtg > 1:17146/1‑228 (MQ=255) gTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGCGACCACTCTTACGTGGGTGATCCTCATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACACTCCGATCTTTTCCAGTGAAGTCTCCGGCGTGGCGTTAAAAc > 1:508358/1‑229 (MQ=255) tttACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGATGATCCTGATGGGTATCGCGCGGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCCCAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACCCCTACAGTACGATCTTTTCCGGTGAACACTCCGGGGGGGCGGTaaaaac > 2:87327/1‑227 (MQ=255) tACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGCGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCACCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACAGTCCAATCTTTTCCCGTGAGTTCTCCGGGCTGGCATTacaaacat > 2:224354/1‑225 (MQ=255) cACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCCCAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTCCAGTCAGACCTTTTCCATTGAAGTCTCCGGAGTGGCGTTAAAAAGCTTCTTTTa > 2:348482/1‑228 (MQ=255) cACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTCCGGTCAGATCTTTTCCAGTGAAGTTTCCGGCGTGCCGTTAAAACGCTTCTTTTa > 1:307219/1‑228 (MQ=255) cACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGAACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACCGTCAGATCTTTTCCAGTGAATGCTCCGGCTTGGCGTTAAAAAGCTTCTTTTa > 1:297743/1‑228 (MQ=255) cACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGAATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCGGTTACGGCTTAACTCCTACAGTCAGATATTTCCCAGTGACGTATCTGGCGTGGCGTTAAAACCCTTCTTTTat > 2:267501/1‑228 (MQ=255) cACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGCGATCCTGACGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACATTCAGACATTTTCCAGTGAAGTCTCGTGCGCGGCGTTAAAACGCTTCTTTTat > 2:133639/1‑228 (MQ=255) cACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCCCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGTCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACCCCTACAGTCCGATCCTTTCCTGTGAAGTTCCCGGCGGGGCTATAAAACGCGTCtttttg > 2:581126/1‑227 (MQ=255) | GGCTGCTCTGCACGCTGTTTATTGCCACGCTGACCTGGTTTGAGTTTCGCCGTGTGCGCTTTAACTTCAATGTCTTCTTTTCATTGCTG‑TTTTTGCTCACCTTTTTCTTCGGCTTCCCGCTGACCAGCGTGCTGGTATTTCGCTTTG‑ATGTTG‑GTGTCGCGCCGCCAGAAATCTTGTTGCAGGCGTTGCTTTCTGCGGGCTGCTTCTACGCGGTTTACTATGT‑CACCTACAAAACCCGCCTACGCAAACGCGTTGCTGATGTACCGCGCCGTCCGCTGTTTACCATGAACCGCGTGGAGACCAATCTTACGTGGGTGATCCTGATGGGTATCGCGCTGGTAAGCGTCGGCATCTTCTTCATGCACAACGGCTTTTTGCTGTTCCGGCTTAACTCCTACAGTCAGATCTTTTCCAGTGAAGTCTCCGGCGTGGCGTTAAAACGCTTCTTTTAC > NC_000913/3978637‑3979088 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |