| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,390,719 | C→T | 3.6% | intergenic (‑121/+6) | mpaA ← / ← ymjC | murein peptide amidase A/pseudogene |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,390,719 | 0 | C | T | 3.6% | 383.2 / 2.7 | 110 | intergenic (‑121/+6) | mpaA/ymjC | murein peptide amidase A/pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/59); new base T (2/2); total (49/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTTTTCATCACCGTGAGTGCCAGCCAGAATCAAACCACTTTCGCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATAAA > NC_000913/1390440‑1391003 | gTTTTCAGCACCGGAAGTGCCGGCCAGAATCAAACCCCTTTCGCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTttat < 1:679903/287‑1 (MQ=255) tttCATCACCGTGAGTGCCAGCCAGAATCAAACCACTTTCGCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAg < 2:544413/288‑1 (MQ=255) ttCATCACCGTGAGTGCCAGCCAGAATCAAACCACTTTCGCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATAAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGtt > 2:677024/1‑289 (MQ=255) gccGTGAGGGCCAGGCAGAATCCAACCACCTACGCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACAAGATTACCGGAGCGCCCGATAATGAACCTCCGGAATGGTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATGGTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCTACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGAt < 1:79171/286‑1 (MQ=255) cGTGAGTGCCAGCCAGAATCAAACCACTTTCGCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGACGGAATTGCGCCGAGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCTTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGTTCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATATTATTAGCTGGATTggg > 1:174449/1‑289 (MQ=255) gcgGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCTCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAAt < 2:174449/289‑1 (MQ=255) ggctgCAGGGGGAGGAAACCAGATTAACGGGGGGCCGAATAATGAACGGCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAgt < 1:871391/288‑1 (MQ=255) ggCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAAt < 2:690700/288‑1 (MQ=255) aTTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGTATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCt > 1:734126/1‑288 (MQ=255) gcgcCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGAt < 2:642910/289‑1 (MQ=255) cAATGATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATc < 2:365434/289‑1 (MQ=255) aCGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGGAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCgg < 1:694407/289‑1 (MQ=255) aCGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCgg > 2:614673/1‑289 (MQ=255) aCGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCg < 1:594898/288‑1 (MQ=255) ccGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTa > 2:190605/1‑289 (MQ=255) aaTGTTCTGTTCCGGGCGGCAAAGCGCCGCGTTCTGCGCGTGGGCGTGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCTGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGTAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTg < 1:834454/289‑1 (MQ=255) tgttcCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCa > 2:65513/1‑289 (MQ=255) ttcCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAg > 1:347537/1‑288 (MQ=255) ttcCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAg < 2:347537/288‑1 (MQ=255) cGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCAc > 1:476850/1‑288 (MQ=255) ggCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGTAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAACTAAAGTTTGTTTAATGGTTTTCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCaa > 2:518069/1‑289 (MQ=255) ggCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTtg < 1:41817/189‑1 (MQ=255) ggCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTtg > 2:41817/1‑189 (MQ=255) ggCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCaa > 2:487479/1‑289 (MQ=255) ggCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCaa > 1:860007/1‑289 (MQ=255) aaaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTAGTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGCCGGGCAAATAAGGTTTGTTTAATGGTTTGCTGATTTGCGAGTTGATTAATCACATGGGGGGCTATCTGACCGCAAGCTCCAAGAATc > 2:461285/1‑289 (MQ=255) gcggttggggcgGGGGGGGGTTACGGTCAGTATCGTTTCTGGTTCAGGAAGTATTACAAGCAGGGTTTGTCAAATTTTTCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCGTACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACAttt < 1:399398/280‑1 (MQ=255) cGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCAt < 2:476850/289‑1 (MQ=255) ggCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATg > 2:743047/1‑289 (MQ=255) aCGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGAAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGatt < 1:677024/289‑1 (MQ=255) gTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGTCAGCACCAAGAATCAGTACAtttt > 2:246427/1‑265 (MQ=255) gTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACAtttt < 1:246427/265‑1 (MQ=255) gTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGattatt > 2:819310/1‑289 (MQ=255) aTGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGTATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:734126/289‑1 (MQ=255) tGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTaa > 2:214356/1‑186 (MQ=255) tGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTaa < 1:214356/186‑1 (MQ=255) tGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgca > 2:127103/1‑289 (MQ=255) gATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgcag < 1:552708/289‑1 (MQ=255) gATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgca > 2:573062/1‑288 (MQ=255) tcggttctGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGGGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTTTCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgcagca < 1:127103/284‑1 (MQ=255) ctctGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGaaaa < 2:376918/263‑1 (MQ=255) ctctGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGaaaa > 1:376918/1‑263 (MQ=255) ctctGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc > 1:742235/1‑281 (MQ=255) ctctGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 2:742235/281‑1 (MQ=255) ctctGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAatat > 1:222958/1‑289 (MQ=255) ctctGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAatat > 2:579546/1‑289 (MQ=255) ctGTTTCAGTAAGTAGTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATGATCAAATCCTTTTCTGTAACGCTATGTTATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGGCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGc < 1:178015/289‑1 (MQ=255) ggTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAg < 1:116440/242‑1 (MQ=255) ggTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCa > 1:853288/1‑289 (MQ=255) ggTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCa < 2:495506/289‑1 (MQ=255) ggTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTGTCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATGTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAATAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCa < 2:518826/289‑1 (MQ=255) aaGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCa < 1:190605/286‑1 (MQ=255) cAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGTATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTg < 1:690746/289‑1 (MQ=255) gCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATccc > 2:110304/1‑247 (MQ=255) gCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATccc < 1:110304/247‑1 (MQ=255) aGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAg > 2:312406/1‑208 (MQ=255) aGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAg < 1:312406/208‑1 (MQ=255) aGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCACTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGAACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTTTTGGAAGAAATATGCTAGTcaaatcacctattgtggta > 2:636403/1‑271 (MQ=255) aGTGTTGCGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGAt > 2:16616/1‑289 (MQ=255) tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGTGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCCTTAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATTACACTATTTCGGAatt > 1:175167/1‑289 (MQ=255) tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc > 2:643325/1‑254 (MQ=255) tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGAttt > 2:431665/1‑289 (MQ=255) tgttgtGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGAttt > 2:597601/1‑289 (MQ=255) tgCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 1:37784/249‑1 (MQ=255) tgCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc > 2:37784/1‑249 (MQ=255) gCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAata < 1:431665/288‑1 (MQ=255) tttGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCa < 2:248686/264‑1 (MQ=255) gCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTa < 1:487479/289‑1 (MQ=255) ggATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTAc < 2:853288/288‑1 (MQ=255) tATCAAATCCTTTTCTGCAACGATATGTCATCGATTTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGt < 1:614673/289‑1 (MQ=255) tCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCa < 2:222958/289‑1 (MQ=255) tCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCa < 1:743047/289‑1 (MQ=255) tcttcAACGCTATGTCATCGTTCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCGGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAAc < 1:839934/289‑1 (MQ=255) tcttcAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAAc < 1:597601/289‑1 (MQ=255) tGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCa < 2:749652/124‑1 (MQ=255) tGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCa > 1:749652/1‑124 (MQ=255) tGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgcagca > 2:698735/1‑212 (MQ=255) tGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgcagca < 1:698735/212‑1 (MQ=255) cATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGATTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGaa < 2:417039/289‑1 (MQ=255) tCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCTCATGTCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTTGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTAAAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTATTACTTAAAt > 1:590461/1‑289 (MQ=255) tCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCGTACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGc < 1:579546/288‑1 (MQ=255) cTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCtt > 2:872502/1‑289 (MQ=255) tGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCa > 2:663812/1‑289 (MQ=255) gTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAata > 1:314441/1‑235 (MQ=255) gTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTc < 2:812723/287‑1 (MQ=255) tATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGgc < 1:725511/194‑1 (MQ=255) cTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGTATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCa < 1:451271/252‑1 (MQ=255) cTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGTATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCa > 2:451271/1‑252 (MQ=255) ttttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAg > 1:806705/1‑280 (MQ=255) ttttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAg < 2:806705/280‑1 (MQ=255) ttttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCcaca > 1:475980/1‑285 (MQ=255) tttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCATTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTCCCTCAAAGAATGGTGCTAATACTGAAATTTCTTCAGCCACATAg > 1:812723/1‑287 (MQ=255) tttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCatat < 1:429594/205‑1 (MQ=255) tttGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCatat > 2:429594/1‑205 (MQ=255) tgttTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATa > 2:704217/1‑289 (MQ=255) tgttTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATa < 2:175167/289‑1 (MQ=255) tttGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATaaa < 1:819310/289‑1 (MQ=255) ttGCATTTTATTAGTTGGTTAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATaaa < 1:573062/288‑1 (MQ=255) ttGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATaaa < 2:860007/288‑1 (MQ=255) ttGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGACAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATaaa < 2:520498/288‑1 (MQ=255) | GTTTTCATCACCGTGAGTGCCAGCCAGAATCAAACCACTTTCGCGGCTGGCTGCAGGGGCAGGAAACCAGATTAACGGCGCGCCCAATAATGAACGTCCGTAATGTTCTGTTCCGGGCGGAAATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTATTACAGGCAGTGTTGTGCAAATTTTGCGGATTATCAAATCCTTTTCTTCAACGCTATGTCATCGATCTTGTATCACTTTTTTGCCGGAAGTTGTTTGCATTTTATTAGTTGGATAGGGTTTGTGGATTTTTGCTGGCTGACGGGCAAATAAAGTTTGTTTAATGGTTTGCTTATCTGCCAGTTGATTAATCACATGGCGGGCTATCTGACCGCCAGCACCAAGAATCAGTACATTTTTCATGAAAATTATCCCAGATTATTGGCAGCAATATGCCAGTCCATATCACTATTGCGGATTTGAATATGTTTCATTACAGAGTTTCCTCAAAGAACGGAGCTAATACTGAAATTGCTTCAGCCACATAGGCTTTGCCGTCATAAA > NC_000913/1390440‑1391003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |