Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,089,012 | 0 | C | T | 3.1% | 430.6 / 2.3 | 131 | S282S (TCG→TCA) | pgaB | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (58/67); new base T (2/2); total (60/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.26e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TCATTGGTAGCAAACGATTTGGAAACCAGACCTCTTTGACCAGCCCATCACCATCGGGATCAGCAAATGCCTGCAAATACACGGTTGATATTTGCATATCTTTCACCCGCTGAATTAGCACATCAATATTGCGATCCATTTGCTGGAGGTTTTCGTCATAAACGTAATCAAGATCGATATGCATTATCCGTTGTGGTGATTTTTCCTGTACGGTAATAATTTGCTGGGCAAACTCTTTTAATGAGGGATTATTGGCGATTAATACCCGCGGAATGGAATCCAATTGCGACGCATTTGCCAAACCTGATTCAAGGGTGAAGAACATGTCATAACCGAGTTTTTTTAATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAA > NC_000913/1088726‑1089297 | tCATTGGTAGCAAACGATTTGGAAACCAAACCTCTTTGACCAGCGCATCACCATCGGGATCAGCAAATGCCTGAAAATACACGGTTGATATTTGCATATCTTTCACCCGCTGAATTAGCACATCAATATTGCGATACATTTGCTGGAGGTTTTCGTCATAAACGTAATCAAGATCGATATGCATTATCCGTTGTGGTGATTTTTCCTGTACGGTAATAATTTGATGGGCAAACTCTTTTAATGAGGGATTATTGGCGATTAATACCCGCGGAATGGAATCCAATTGCGa < 2:205963/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |