| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3368968 = | 149 (0.910) | 4 (0.030) | 4/494 | NT | 2.9% | intergenic (+16/+44) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| ? | NC_000913 | 3368993 = | 126 (0.810) | intergenic (+41/+19) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
AAGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCA > NC_000913/3368681‑3369246 | gcaatacattgatatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaacgAt < 1:1162804‑M1/2‑1 (MQ=255)gcaatacattgatatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaaga > 1:191597‑M1/288‑288 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAATATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGGCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTTCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTTGTTCGAAACCAGGTGGTGCTAGAGGAAGGCTATAAACGCCGTTAATTTAAACGGTTTCGCATTCTGc > 1:1294704/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTTTGGCTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCCAGCGACTATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTAGCAGATGAACTTGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGCGGAAGGCTATAGACGCCGTCAATTTCACCGGTTTCGAATTCTga > 1:1175333/1‑288 (MQ=255) 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tccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 1:1298120‑M1/11‑1 (MQ=255) tccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 1:1006102‑M1/11‑1 (MQ=255) cTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtg > 1:857011/1‑286 (MQ=255) 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ggTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCa < 1:732833/287‑1 (MQ=255) ggTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCa < 1:860962/287‑1 (MQ=255) tCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACATGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCt > 2:1134824/1‑181 (MQ=255) | AAGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCATTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCA > NC_000913/3368681‑3369246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |