New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 3845530 = | 128 (0.790) | 78 (0.500) | 51/498 | NT | 35.9% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3992759 | 155 (0.990) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGTCAGGGGCTATTTGATGGCGAGAAGTTTGCCTTCACTACGCTGGAAGTCACGGAATAATAAAAAAAGCCCGGCGTCATGCCGGGCAAAAGTCACCAGTTACGTTTATGCCACTGTCAACTGCTGAATTTTTTTCTCGCGG > NC_000913/3845246‑3845811 | ccgatctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCAcc > 2:1437746‑M1/285‑289 (MQ=255) 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atgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttgggctctgtataaccgagcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaatacactcgtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacatcgcgcacccgtttgtatattaacggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgaagcctcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACTGCCACGTCCCCGTCGCCGGCGGACAAAATTGa < 2:1061527‑M1/37‑1 (MQ=255) ccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatatacccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatagtaaaggtaacggcattgtcgatttgactaagtagcaggagatggtcggcgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACAGGGCGCAGTCGCTGGCGGTAACAATTGAAGCCtt < 2:682203‑M1/43‑1 (MQ=255) ccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataacctggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtagattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtggcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCCCATCCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCtt < 2:1045085‑M1/43‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |