| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,523,584:1 | (ACA)2→3 | 5.6% | coding (716/2553 nt) | mrcA → | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3523576 | 151 (0.960) | 9 (0.060) +CAA |
3/496 | NT | 5.6% | coding (708/2553 nt) | mrcA | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| ? | NC_000913 | 3523577 = | 154 (0.950) | coding (709/2553 nt) | mrcA | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
AAGTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCACCATCACCCGCAAAGTGCAGCAGGCCGCGCAGCAGGCGGTACGTAATAACGTGCTGGACTACGACATGCGCCACGGCTATCGCGGCCCGGCAAATGTGCTGTGGAAAGTGGGCGAGTCGGCGTGGGATA > NC_000913/3523296‑3523865 | tcttcctcgcgattcgcattgaacagctgctgacgaaagacgagatcctcgagctttatctgaacaagatttaccttggttaccgcgcctatggtgtcggtgctgcggcacaagtctatttcggaaaaacggtcgaccaactgacgctgaacgaaatggcggtgatagccgggctgccgaaagcgccttccaccttcaacccgctctactcgatggatcgtgccgttgcgcggcgtaacgtcgtgctgtcgcggatgctagatgaagggtatatcacccaagaacaag > 2:272318‑M2/282‑287 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |