| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,976,994 | C→A | 9.3% | S133* (TCA→TAA) | galR → | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor, autorepressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,976,994 | 0 | C | A | 9.3% | 461.4 / 22.3 | 149 | S133* (TCA→TAA) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor, autorepressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/69); new base A (10/5); total (74/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGA‑AACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAA > NC_000913/2976709‑2977271 | gTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTAAtt > 1:243606/1‑289 (MQ=255) 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tGATTTAGCCTCATTAATGA‑AACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGaa < 2:80631/289‑1 (MQ=255) ggATATAGCCTAATTAATAA‑AACAAATGCCCGGTATGGTACTGATCAACCATATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATGTGTCTGGACGATCATGACGGGGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCGTTGGTGATATGGGCTCTAACCACTCTATTTCTGAGGCCGAAGATCGGCTGCAAGGGGATTACGATGCCCGTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGGGAACCAGACGAAAGCGGGGGCGaa < 2:783589/288‑1 (MQ=255) | GTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGA‑AACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAA > NC_000913/2976709‑2977271 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |